LCN9 (lipocalin 9)

symbol:
LCN9
locus group:
protein-coding gene
location:
9q34.3
gene_family:
Lipocalins
alias symbol:
None
alias name:
MUP-like lipocalin|epididymal-spec…
entrez id:
392399
ensembl gene id:
ENSG00000148386
ucsc gene id:
uc064wzo.1
refseq accession:
NM_001001676
hgnc_id:
HGNC:17442
approved reserved:
2005-01-11
9q34.3
基因染色体位置图

LCN9(Lipocalin 9)属于脂质运载蛋白(lipocalin)家族,这是一类广泛存在于生物体中的小分子分泌蛋白,其共性是通过疏水口袋结构结合和运输脂类、类固醇、气味分子等疏水性物质,参与信号传导、免疫调节及代谢过程。LCN9的具体功能尚未完全明确,但脂质运载蛋白家族成员通常与炎症反应、细胞增殖和代谢平衡相关。研究表明,LCN9可能在生殖系统(如睾丸)中高表达,推测其与精子发育或性激素运输有关,但确切机制仍需进一步验证。若LCN9发生突变,可能导致其疏水结合能力受损,影响相关配体的运输,进而干扰生殖或代谢功能,但目前尚未发现直接关联的疾病。当LCN9过表达时,可能通过异常调控脂质代谢或炎症通路引发局部组织功能紊乱;而表达降低则可能削弱其对靶分子的转运效率,例如影响生殖细胞的营养供应。脂质运载蛋白家族的其他成员(如LCN2)与糖尿病、癌症等疾病相关,但LCN9的病理作用尚不明确。需要注意的是,现有研究多基于动物模型或细胞实验,人类LCN9的生物学意义仍需更多证据支持。专业术语解释:疏水口袋(hydrophobic pocket)指蛋白质表面可结合非极性分子的结构区域;配体(ligand)指与蛋白质特异性结合的分子。若需更详细的应用信息(如实验中的基因操作建议),建议结合具体研究目标进一步探讨。

Members of the lipocalin family, such as LCN9, have a common structure consisting of an 8-stranded antiparallel beta-barrel that forms a cup-shaped ligand-binding pocket or calyx. Lipocalins generally bind small hydrophobic ligands and transport them to specific cells (Suzuki et al., 2004 [PubMed 15363845]).[supplied by OMIM, Aug 2009]

的脂笼蛋白家族,如LCN9成员,具有由形成一个杯形配体结合口袋或花萼8链反平行β桶的共同的结构。脂质运载蛋白通常结合小的疏水性配体和其运送到特定细胞(Suzuki等人,2004 [搜索PubMed 15363845])。[由OMIM,2009年08月供给]

LCN9基因的碱基序列:[NCBI]
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LCN9基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs86932       rs484198       rs488539       rs492708       rs505017       rs531480       rs533477       rs564112       rs566252       rs567785       rs571756       rs574076       rs729614       rs1165008       rs1165012       rs1759713       rs1759714      

LCN9基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCAGATTTGAAGAAACCTGC
60
GTAGCAGGGATCTTTGTTGG
59
AGAACTTCAGGAACGGGAC
59
TAGCAGGGATCTTTGTTGGT
59
TACAGGCTGTTCATCACCT
58
TTTCGCAGGTTTCATAGAGC
59
TACAGGCTGTTCATCACCT
58
TTTCGCAGGTTTCATAGAGC
59
TCCATCAACTATGAGGGCC
59
AAGTTCTGGAGGTGGAAGG
59
CTACAGGCTGTTCATCACC
58
TTCGCAGGTTTCATAGAGC
58
CAGAACTTCAGGAACGGGA
59
AGCAGGGATCTTTGTTGGT
59
CCATCAACTATGAGGGCCA
59
AAGTTCTGGAGGTGGAAGG
59
CTACAGGCTGTTCATCACC
58
TTCGCAGGTTTCATAGAGC
58
TGAGCAGATTTGAAGAAACCTG
59
AGCAGGGATCTTTGTTGGT
59
      尚未收录相关数据

LCN9基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LCN9基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005215
A0A087WZ21 (UniProtKB)
IEA
GO:0005550
A0A087WZ21 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
A0A087WZ21 (UniProtKB)
IEA
GO:0005215
Q8WX39 (UniProtKB)
IEA
GO:0005550
Q8WX39 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q8WX39 (UniProtKB)
IEA
GO:0006810
Q8WX39 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LCN9基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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