LIME1 (Lck interacting transmembrane adaptor 1)

symbol:
LIME1
locus group:
protein-coding gene
location:
20q13.33
gene_family:
alias symbol:
FLJ20406|dJ583P15.4|LIME
alias name:
None
entrez id:
54923
ensembl gene id:
ENSG00000203896
ucsc gene id:
uc002ygp.5
refseq accession:
NM_017806
hgnc_id:
HGNC:26016
approved reserved:
2005-04-25
20q13.33
基因染色体位置图

LIME1(Lck interacting transmembrane adaptor 1)是一种跨膜衔接蛋白,主要参与T细胞受体(TCR)信号通路的调控。它通过其胞内段的免疫受体酪氨酸激活基序(ITAM)与酪氨酸激酶Lck结合,促进T细胞活化信号的传递。LIME1在免疫系统中发挥重要作用,特别是在T细胞发育、增殖和功能调节中。其表达产物具有典型的衔接蛋白特性,能够整合上游信号并向下游传递,影响细胞因子的产生和免疫应答的强度。LIME1属于跨膜衔接蛋白家族,该家族成员通常含有多个酪氨酸磷酸化位点,能够与多种信号分子相互作用,共同调节免疫细胞的激活与抑制平衡。若LIME1发生突变,可能导致TCR信号传导异常,进而引发免疫缺陷或自身免疫性疾病。例如,某些突变可能削弱LIME1与Lck的结合能力,降低T细胞活性,增加感染风险;而功能获得性突变则可能过度激活T细胞,诱发自身免疫反应。研究表明,LIME1的过表达会增强TCR信号强度,促进T细胞过度活化,可能与类风湿性关节炎等自身免疫疾病的发病机制相关。相反,LIME1表达降低可能导致T细胞反应迟钝,影响机体对病原体的清除能力。此外,LIME1还与其他免疫相关基因(如ZAP-70、LCK)存在功能上的协同或拮抗关系,共同调控T细胞的命运决定。在癌症中,LIME1的异常表达可能与肿瘤免疫逃逸有关,但其具体机制仍需进一步研究。

This gene encodes a transmembrane adaptor protein that links the T and B-cell receptor stimulation to downstream signaling pathways via its association with the Src family kinases Lck and Lyn, respectively. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2015]

这个基因编码经由其与Src家族关联的T和B细胞受体刺激链接到下游信号传导途径的跨膜衔接蛋白分别激酶的Lck和Lyn。这个基因的选择性剪接的结果在多个转录变体。 [由RefSeq的,2015年3月提供]

LIME1基因的碱基序列:[NCBI]
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LIME1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs914559       rs1056441       rs1151622       rs1151623       rs1151624       rs1151625       rs1275330       rs2236510       rs2236511       rs2427533       rs2427534       rs2427535       rs3032680       rs4809331       rs6011069       rs6011070       rs6122159      

LIME1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

LIME1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIME1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0050852
A0A087WT39 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
A0A087WT39 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WUJ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050852
A0A087WUJ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
A0A087WUJ1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050852
A0A087WZP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
A0A087WZP9 (UniProtKB)
IEA
GO:0002250
Q9H400 (UniProtKB)
IEA
GO:0005615
Q9H400 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q9H400 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9H400 (UniProtKB)
IEA
GO:0050852
Q9H400 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
Q9H400 (UniProtKB)
IEA
GO:0050852
V9GYI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
V9GYI1 (UniProtKB)
IEA
GO:0050852
X6RKG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0050853
X6RKG5 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LIME1基因的相关microRNA:     

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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