LIMS1基因详情-基因数据库-基因云馆

LIMS1 (LIM zinc finger domain containing 1)

symbol:: LIMS1
locus group:: protein-coding gene
location:: 2q12.3
gene_family:
alias symbol:: PINCH|PINCH1
alias name:: particularly interesting new Cys-H…
entrez id:: 3987
ensembl gene id:: ENSG00000169756
ucsc gene id:: uc002teh.3
refseq accession:: NM_004987
hgnc_id:: HGNC:6616
approved reserved:: 1998-01-15

2q12.3

LIMS1（LIM和senescent cell antigen-like domains 1）基因编码一种含有LIM结构域的蛋白质，主要参与细胞骨架组织、信号转导和细胞粘附等生物学过程。LIM结构域是一种锌指模体，能够介导蛋白质之间的相互作用，因此LIMS1在细胞内多作为支架蛋白发挥作用，帮助形成信号复合物。该基因的表达产物在多种组织中存在，尤其在心脏、骨骼肌和肾脏中表达较高。LIMS1通过整合素信号通路参与细胞与细胞外基质的相互作用，影响细胞迁移、增殖和存活。突变或功能异常可能导致细胞粘附缺陷，进而与某些疾病相关，如心血管疾病和癌症。研究表明，LIMS1在某些肿瘤中过表达可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移，而降低表达则可能抑制这些恶性行为。此外，LIMS1还参与细胞衰老过程，其表达水平的变化可能影响衰老相关分泌表型（SASP）。LIMS1属于LIM蛋白家族，该家族成员通常含有1个或多个LIM结构域，并通过这些结构域与其他蛋白质相互作用，参与转录调控、细胞骨架重塑和信号转导等共同功能。LIM蛋白家族在发育、分化和疾病中发挥重要作用。LIMS1的过表达可能通过激活特定信号通路（如FAK/PI3K/AKT）促进细胞存活和迁移，而表达降低可能导致细胞粘附能力减弱，影响组织完整性。该基因还与某些遗传性疾病和神经退行性疾病有关，但其具体机制仍需进一步研究。

The protein encoded by this gene is an adaptor protein which contains five LIM domains, or double zinc fingers. The protein is likely involved in integrin signaling through its LIM domain-mediated interaction with integrin-linked kinase, found in focal adhesion plaques. It is also thought to act as a bridge linking integrin-linked kinase to NCK adaptor protein 2, which is involved in growth factor receptor kinase signaling pathways. Its localization to the periphery of spreading cells also suggests that this protein may play a role in integrin-mediated cell adhesion or spreading. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

由该基因编码的蛋白质是含有5个LIM结构域，或双锌指一个衔接蛋白。该蛋白可能参与整合，通过与整合素连接激酶其LIM结构域介导的互动，黏着斑发现信号。它也被认为是作为整合素连接激酶链接到NCK衔接蛋白2，这是参与生长因子受体激酶信号传导途径的桥梁。其定位到扩频单元的周边还表明，该蛋白可能在整合素介导的细胞粘附或扩散的作用。已发现该基因编码不同亚型的几个抄本变形。 [由RefSeq的，2010年7月提供]

OMIM数据库中对LIMS1基因的介绍 Wikipedia数据库中对LIMS1基因的介绍

LIMS1基因的碱基序列：[NCBI]

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LIMS1基因的碱基突变：仅显示部分snp

rs700878 rs700879 rs700880 rs826588 rs826589 rs826590 rs826591 rs826592 rs826673 rs826675 rs826676 rs826677 rs826678 rs826679 rs826680 rs826681 rs826682

LIMS1基因在不同组织中的表达： [UniProt]

正向引物序列

正向Tm值

反向引物序列

反向Tm值

评分

AAGATCGTGAACAGTAATGGG

58

TGTTCGTTCCTCATAGAAGAG

57

GAGGGCTGTTTCCAAACTG

59

GGCCATGTTGAATTTCGCA

59

GGACTCTTCTATGAGTTTGAAGG

58

CACACTGATGACAGCAAGG

58

GGAAGAGCTAAGCAACATGG

59

TTCACGATCTTCTCAGCGG

59

TGTTATAGAAGGTGATGTGGTC

57

TTAGTGTTGCAGGTAGAACAG

58

AGATCGTGAACAGTAATGGG

57

TGTTCGTTCCTCATAGAAGAG

57

AAGAGCTAAGCAACATGGC

58

GTTCACGATCTTCTCAGCG

58

TGCGAAATTCAACATGGCC

59

TTCACGATCTTCTCAGCGG

59

GTGTTATAGAAGGTGATGTGGTC

59

TAGTGTTGCAGGTAGAACAGG

59

CAAGAATGCTGGGAGACAC

58

TTCTGGCAGATGTATTTCCCA

59

尚未收录相关数据

LIMS1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt] [GenomeNet]

质膜
细胞质
细胞外
高尔基体
囊泡
细胞骨架
内质网
细胞核
内体
溶酶体
线粒体

LIMS1基因的本体（GO）信息：

GO库代码

对应的蛋白质

来源代码

GO:0008270

A0A0M3HER1 (UniProtKB)

IEA

GO:0008270

C9JF46 (UniProtKB)

IEA

GO:0008270

F8WB59 (UniProtKB)

IEA

GO:0008270

F8WC86 (UniProtKB)

IEA

GO:0008270

F8WE10 (UniProtKB)

IEA

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005515

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0005829

P48059 (UniProtKB)

TAS

GO:0005829

P48059 (UniProtKB)

TAS

GO:0005886

P48059 (UniProtKB)

IEA

GO:0005911

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0005925

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0005925

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0005925

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0007569

P48059 (UniProtKB)

TAS

GO:0008270

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0010628

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0010811

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0019901

P48059 (UniProtKB)

IPI

GO:0034329

P48059 (UniProtKB)

TAS

GO:0043547

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0045184

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0045892

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0048471

P48059 (UniProtKB)

IDA

GO:0051894

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0071560

P48059 (UniProtKB)

IEP

GO:1900026

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0001837

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0050678

P48059 (UniProtKB)

IMP

GO:0005925

P48059 (UniProtKB)

IDA

可能调控 LIMS1基因的相关microRNA：

hsa-miR-1 hsa-miR-192 hsa-miR-221 hsa-miR-340 hsa-miR-421 hsa-miR-590-3p hsa-miR-1226 hsa-miR-18a* hsa-miR-215 hsa-miR-505

Reactome

MINT

IntAct

mentha

String

序号	作用方式	资源库来源/分值	基因名称	基因名称

Reactomepathway

名称
Cell junction organization
Cell-Cell communication
Cell-extracellular matrix interactions
Regulation of cytoskeletal remodeling and cell spreading by IPP complex components

疾病名称

关系值

NofPmids

NofSnps

来源

疾病名称	关系值	NofPmids	NofSnps	来源
Neoplasm Metastasis	0.003267234	3	0	BeFree_LHGDN
Squamous cell carcinoma	0.00272435	1	0	LHGDN
Glioma	0.00272435	1	0	LHGDN
Carcinogenesis	0.000542884	2	0	BeFree
Leukemia, Myelocytic, Acute	0.000271442	1	0	BeFree
Carcinoma breast stage IV	0.000271442	1	0	BeFree
Breast Carcinoma	0.000271442	1	0	BeFree
Malignant neoplasm of breast	0.000271442	1	0	BeFree
Adenocarcinoma, Clear Cell	0.000271442	1	0	BeFree
Kidney Diseases	0.000271442	1	0	BeFree

LIMS1 (LIM zinc finger domain containing 1)

基因基本信息

基因基本信息

基因染色体位置

基因染色体位置

基因简述

基因简述

基因序列

基因序列

基因突变

基因突变

基因表达

基因表达

基因引物

基因引物

转录因子

转录因子

尚未收录相关数据

基因本体信息

基因相关microRNA

基因相关microRNA

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

基因相关服务

基因相关服务

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