LIMS2 (LIM zinc finger domain containing 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIMS2
locus group:
protein-coding gene
location:
2q14.3
gene_family:
alias symbol:
PINCH2|PINCH-2
alias name:
particularly interesting new Cys-H…
entrez id:
55679
ensembl gene id:
ENSG00000072163
ucsc gene id:
uc002tox.4
refseq accession:
NM_017980
hgnc_id:
HGNC:16084
approved reserved:
2001-07-26

基因染色体位置

基因染色体位置

2q14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIMS2（也称为PINCH2）是LIM锌指结构域蛋白家族成员，属于ILK-PINCH-PARVIN（IPP）复合体的核心组分，该家族以含有LIM结构域（一种介导蛋白质相互作用的锌结合模体）为共性。LIMS2主要在细胞黏着斑（细胞与细胞外基质连接的动态结构）中表达，与整合素连接激酶（ILK）和PARVIN形成复合物，调控细胞黏附、迁移、信号传导及细胞骨架重组。其表达产物通过维持IPP复合物的稳定性，影响细胞机械力感知、增殖和存活，尤其在肌肉、心脏和肾脏组织中功能显著。突变或表达异常可能导致IPP复合物功能障碍，与肌肉萎缩、心肌病、肾小球疾病及肿瘤转移相关。例如，LIMS2缺失会破坏细胞-基质黏附，诱发肌纤维排列紊乱；而过表达可能通过异常激活AKT信号通路促进肿瘤侵袭。该基因家族（PINCH家族）包括PINCH1和PINCH2，均通过LIM结构域与其他蛋白互作，但组织分布略有差异：PINCH1广泛表达，而LIMS2/PINCH2在特定组织（如肌肉）中更丰富。若LIMS2表达降低，可能削弱细胞抗凋亡能力并增加对机械应激的敏感性；过表达则可能干扰正常黏着斑周转，导致迁移异常或纤维化。目前研究提示LIMS2在糖尿病肾病中表达上调，或与足细胞损伤相关，但其机制仍需深入探索。

This gene encodes a member of a small family of focal adhesion proteins which interacts with ILK (integrin-linked kinase), a protein which effects protein-protein interactions with the extraceullar matrix. The encoded protein has five LIM domains, each domain forming two zinc fingers, which permit interactions which regulate cell shape and migration. A pseudogene of this gene is located on chromosome 4. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Nov 2011]

这个基因编码的小家族黏着蛋白的其与I??LK（整合素连接激酶），它影响与extraceullar基质蛋白质 - 蛋白质相互作用的蛋白质相互作用的成员。该编码的蛋白有五个LIM结构域，每个域形成两个锌指，这使得其调节细胞形态和迁移的相互作用。该基因的假基因位于染色体4编码不同亚型的多个抄本变形也发现了这种基因。 [由RefSeq的，2011年11月提供]

OMIM数据库中对LIMS2基因的介绍     Wikipedia数据库中对LIMS2基因的介绍

基因序列

基因序列

LIMS2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIMS2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1047760       rs1820971       rs2243805       rs2243824       rs2243934       rs2244042       rs2244229       rs2244346       rs2288658       rs2435619       rs3732201       rs3771295       rs3771296       rs3796082       rs3821231       rs6708099       rs6714357      

基因表达

基因表达

LIMS2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGGTCATGCACTTTGTCTG
59
GGTTGTAGTGAGTCTCGCA
60
CTACTCTGACAGCCTGCTC
60
TCCACAAACTTGTTCCATCG
59
CTGAAGGGTGAGCTCTACTG
60
CACAGACAAAGTGCTCCAC
59
CTGAAGGGTGAGCTCTACTG
60
CACAGACAAAGTGCTCCAC
59
CTGAAGGGTGAGCTCTACTG
60
CACAGACAAAGTGCTCCAC
59
TGACGGGAAGCAATATGTC
58
CCATTGCTGTTGACAATGC
58
GAGGTGGAGCAATATGTCG
58
CCATTGCTGTTGACAATGC
58
TTGAAGGCCGGAAGTACTG
60
CCAATGATGAACTCACCGC
59
CTGACCACTTCAACTGCAC
59
CAGTAGAGCTCACCCTTCAG
60
TTGAAGGCCGGAAGTACTG
60
CCAATGATGAACTCACCGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LIMS2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIMS2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0008270
A0A087X2F9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008270
H0Y592 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
Q7Z4I7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IDA
GO:0008270
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016337
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0034329
Q7Z4I7 (UniProtKB)
TAS
GO:0043066
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:0045216
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:2000178
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:2000346
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA
GO:2001046
Q7Z4I7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIMS2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Stomach Neoplasms 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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