LIN54 (lin-54 DREAM MuvB core complex component)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LIN54
locus group:
protein-coding gene
location:
4q21.22
gene_family:
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MIP120|DKFZp686L1814|JC8.6|CXCDC1|TCX1
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CXC domain containing 1
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132660
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ENSG00000189308
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uc003hnx.5
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NM_194282
hgnc_id:
HGNC:25397
approved reserved:
2007-01-03

基因染色体位置

基因染色体位置

4q21.22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LIN54是LIN基因家族的重要成员，属于LIN-9/LIN-54复合体（也称为DREAM复合体或MuvB复合体）的一部分。这个基因家族主要参与细胞周期调控、染色质重塑和转录抑制等关键生物学过程。LIN54编码的蛋白质含有多个保守结构域，包括一个DNA结合结构域和一个染色质结合结构域，使其能够特异性识别并结合特定的DNA序列（如细胞周期依赖性基因启动子区域），从而调控下游基因的表达。在功能上，LIN54通过与LIN9、LIN37、RBBP4等其他蛋白形成复合物，在G0/G1期抑制细胞周期相关基因（如周期蛋白和CDK基因）的表达，确保细胞在适当条件下进入S期。该基因的突变可能导致复合体功能异常，引发细胞周期紊乱、增殖失控，甚至与多种癌症（如卵巢癌、肺癌）的发生发展相关。研究表明，LIN54表达降低会削弱DREAM复合体的稳定性，导致细胞周期基因异常激活，促进细胞异常增殖；而过表达则可能过度抑制细胞周期进程，影响组织再生和修复能力。此外，LIN54在生殖系统发育中也起重要作用，其突变可能导致不育或生殖器官发育缺陷。该基因家族（LIN家族）的共同特征是通过多蛋白复合物调控基因表达，尤其在细胞周期同步化、分化维持和肿瘤抑制中发挥核心作用。LIN54的功能研究为理解细胞周期调控机制及开发相关疾病治疗策略提供了重要线索。

LIN54 is a component of the LIN, or DREAM, complex, an essential regulator of cell cycle genes (Schmit et al., 2009 [PubMed 19725879]).[supplied by OMIM, Dec 2010]

LIN54是LIN的一个组成部分，或DREAM，复杂的细胞周期基因的重要调节器（施密特等，2009 [搜索PubMed 19725879]）[由OMIM，2010年12月供给]

OMIM数据库中对LIN54基因的介绍     Wikipedia数据库中对LIN54基因的介绍

基因序列

基因序列

LIN54基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LIN54基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs921992       rs985899       rs1020750       rs1020751       rs1020752       rs1020753       rs1457828       rs1457829       rs1473394       rs1840994       rs1902831       rs1993523       rs2015255       rs2125170       rs2125172       rs2168788       rs2868708      

基因表达

基因表达

LIN54基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCACGAAGCTGATCTTTGC
59
TGAAAGAACCCTGCAATAACTG
59
ACAGTACAGATTGCTAAGAAGC
59
TGTCTGTCCTGTAACTGCT
58
CAGCTGAGATTGCTAAGAAGC
60
AAACTTGAGTTGTCTGTCCTG
59
AAACCCTGGTCTGTGTCTC
59
AAGTTGATCAGGCACAAAGC
60
CAGCTGAGATTGCTAAGAAGC
60
AAACTTGAGTTGTCTGTCCTG
59
ATTGGTGTCTCAGCATTGAC
59
TGAAAGAACCCTACCTGTACTG
60
ACAAACCCTGGTCTGTGTC
60
TCTTCCAGTTCTCAGCTGG
59
ACCAACTTATGTTCTGCTGAG
58
AGGTACTTTGCCATTCTGC
58
CAGCTGAGATTGCTAAGAAGC
60
AAACTTGAGTTGTCTGTCCTG
59
ACAGTACAGATTGCTAAGAAGC
59
TGTCTGTCCTGTAACTGCT
58

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
E2F4
LIN54
Unknown
19725879

基因本体信息

LIN54基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LIN54基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003677
Q6MZP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q6MZP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6MZP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6MZP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q6MZP7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS
GO:0006351
Q6MZP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006355
Q6MZP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q6MZP7 (UniProtKB)
IEA
GO:0051726
Q6MZP7 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LIN54基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Adenocarcinoma Of Esophagus 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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