LINC00458 (long intergenic non-protein coding RNA 458)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LINC00458
locus group:
non-coding RNA
location:
13q14.3
gene_family:
alias symbol:
LncRNA-ES3|ES3
alias name:
lncRNA embryonic stem cell 3
entrez id:
100507428
ensembl gene id:
ENSG00000234787
ucsc gene id:
uc058xho.1
refseq accession:
NR_108062
hgnc_id:
HGNC:42807
approved reserved:
2011-08-22

基因染色体位置

基因染色体位置

13q14.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LINC00458是一种长链非编码RNA（lncRNA），属于长链非编码RNA基因家族，这类RNA通常不编码蛋白质，但能通过调控基因表达参与多种生物学过程。LINC00458在多种癌症中表现出异常表达，例如在乳腺癌、肝癌和结直肠癌中常出现过表达，可能与肿瘤的发生、发展和转移相关。研究表明，LINC00458可能通过充当竞争性内源RNA（ceRNA）吸附微小RNA（miRNA），从而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，影响细胞增殖、凋亡和侵袭等过程。例如，在乳腺癌中，LINC00458可能通过吸附miR-145-5p，上调靶基因ADAM19的表达，促进肿瘤细胞的迁移和侵袭。此外，LINC00458的过表达还可能激活某些信号通路，如Wnt/β-catenin或PI3K/AKT通路，进一步促进肿瘤进展。相反，降低LINC00458的表达可能抑制肿瘤细胞的恶性行为，如增殖和转移，并增强化疗敏感性。LINC00458的突变或表达异常可能与某些疾病的预后相关，例如高表达LINC00458的癌症患者通常预后较差。长链非编码RNA基因家族的共性包括调控基因表达、参与表观遗传修饰以及影响染色质结构等，它们虽不编码蛋白质，但在细胞分化、发育和疾病中发挥重要作用。LINC00458的具体机制和功能仍在研究中，但其作为潜在的治疗靶点或生物标志物具有重要价值。

None

无

OMIM数据库中对LINC00458基因的介绍     Wikipedia数据库中对LINC00458基因的介绍

基因序列

基因序列

LINC00458基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LINC00458基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs988526       rs988527       rs988528       rs1932503       rs1960782       rs2576114       rs2576115       rs2576116       rs2576117       rs2576119       rs2576120       rs2576121       rs2576122       rs2576123       rs2576125       rs2576126       rs2576127      

基因表达

基因表达

LINC00458基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCCTACAGCAAGTACTGTG
57
AAGGTGTAGGACTGCTCAG
59
AATTTCAAATCTGGAACGCG
58
GTGAGATGTCCATCCTTTGAG
59
ACCAATTTCAAATCTGGACCC
59
CTGGGAAGGAGTCAGTCAG
59
CTGTCATCTCCTATGATAACAATGC
60
CCTTTACATGGAGTGAAAGAGC
59
AGTACTGTGAGAACTCAAAGG
57
GCAGACGTAGAGAAAGATCAG
58
GCAAGTACTGTGAGAGCTG
58
CATAGGAGATGACAGCTCCA
59
ACCAATTTCAAATCTGGACCC
58
CTGGGAAGGAGTCAGTCAG
59
GTACTGTGAGAACTCAAAGGG
58
GCAGACGTAGAGAAAGATCAG
58
CACCAATTTCAAATCTGGACC
58
GGGAAGGAGTCAGTCAGAG
59
AAGTACTGTGAGAGCTGCA
59
TCATAGGAGATGACAGCTCC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LINC00458基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LINC00458基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LINC00458基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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