LMLN (leishmanolysin like peptidase)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LMLN
locus group:
protein-coding gene
location:
3q29
gene_family:
alias symbol:
Gp63|Msp|LMNL1
alias name:
None
entrez id:
89782
ensembl gene id:
ENSG00000185621
ucsc gene id:
uc011buo.2
refseq accession:
NM_033029
hgnc_id:
HGNC:15991
approved reserved:
2001-06-28

基因染色体位置

基因染色体位置

3q29
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LMLN（也称为LIM域和肌动蛋白结合蛋白1，英文原称LIM and actin-binding protein 1）属于LIM蛋白家族，该家族的特征是含有LIM结构域（一种由两个锌指结构组成的蛋白质相互作用模块，参与细胞信号传导和骨架组织）。LMLN基因编码的蛋白通过与肌动蛋白（细胞骨架的主要成分）结合，参与细胞形态维持、运动及胞内运输等过程。其主要作用位点包括细胞质和细胞膜附近，尤其在细胞伪足和迁移前沿富集，影响细胞黏附与运动能力。若LMLN发生功能丧失性突变，可能导致细胞迁移异常，与肿瘤转移或神经发育障碍相关；而增益性突变可能过度激活细胞运动通路，促进侵袭性表型。研究发现LMLN在乳腺癌、胶质瘤等癌症中高表达，与不良预后相关，可能通过调控上皮-间质转化（EMT，一种使细胞获得迁移能力的生物学过程）促进转移。当LMLN过表达时，会增强肌动蛋白聚合，加速细胞迁移，但可能破坏组织稳态；低表达则导致细胞运动能力下降，影响伤口愈合等生理过程。该基因家族（LIM蛋白家族）的共性是通过LIM结构域介导蛋白质-蛋白质相互作用，广泛参与基因表达调控、细胞骨架重排和机械信号转导。目前针对LMLN的研究多集中于癌症领域，其调控机制涉及多种信号通路如Rho GTP酶（调控细胞骨架的关键分子），但神经系统等其它功能仍需进一步探索。

This gene encodes a zinc-metallopeptidase. The encoded protein may play a role in cell migration and invasion. Studies of a similar protein in Drosophila indicate a potential role in mitotic progression. Alternatively spliced transcript variants have been described. [provided by RefSeq, Feb 2009]

该基因编码一个锌金属肽酶。所编码的蛋白质可在细胞迁移和侵袭的作用。在果蝇的类似蛋白的研究表明在有丝分裂进程的潜在作用。可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的，2009年2月提供]

OMIM数据库中对LMLN基因的介绍     Wikipedia数据库中对LMLN基因的介绍

基因序列

基因序列

LMLN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LMLN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs7374500       rs9834267       rs60602324       rs73894232       rs73894233       rs73894234       rs75206882       rs75551758       rs76170643       rs79684034       rs80029528       rs112408295       rs113060473       rs113924962       rs114003654       rs114435468       rs114533726      

基因表达

基因表达

LMLN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAACATCTCCAGCAATGCC
59
TGAGATGCCTTCTTGGTCTG
60
CGTGTTGTTGAGGAAGCAC
60
CAATGGTTGAGCTCAGTGC
60
GGAACATCTCCAGCAATGC
59
AGATGCCTTCTTGGTCTGG
59
GTGTTGTTGAGGAAGCACG
60
CCAATGGTTGAGCTCAGTG
59
GTGTTGTTGAGGAAGCACG
60
CAATGGTTGAGCTCAGTGC
60
GAACATCTCCAGCAATGCC
59
AGATGCCTTCTTGGTCTGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LMLN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LMLN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004222
C9JF40 (UniProtKB)
IEA
GO:0006508
C9JF40 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
C9JF40 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
C9JF40 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
F8WCE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
F8WCE5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
F8WCE5 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
F8WCE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
F8WCE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
F8WCE5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004222
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q96KR4 (UniProtKB)
IDA
GO:0005811
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
Q96KR4 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007067
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0051301
Q96KR4 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LMLN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malaria 0.012214884 45 0 BeFree
Cervix carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.001085767 4 0 BeFree
Coinfection 0.001085767 4 0 BeFree
Malaria, Falciparum 0.001085767 4 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000814326 3 0 BeFree
Malignant tumor of cervix 0.000814326 3 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000814326 3 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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