LRP1B (LDL receptor related protein 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
LRP1B
locus group:
protein-coding gene
location:
2q22.1-q22.2
gene_family:
Low density lipoprotein receptors
alias symbol:
LRP-DIT|LRPDIT
alias name:
LRP-deleted in tumors
entrez id:
53353
ensembl gene id:
ENSG00000168702
ucsc gene id:
uc002tvj.2
refseq accession:
NM_018557
hgnc_id:
HGNC:6693
approved reserved:
2000-05-02

基因染色体位置

基因染色体位置

2q22.1-q22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

LRP1B（低密度脂蛋白受体相关蛋白1B）属于低密度脂蛋白受体（LDLR）基因家族，该家族成员通常参与细胞信号传导、脂质代谢和内吞作用。LRP1B基因位于2号染色体上，编码一种跨膜受体蛋白，主要在神经系统、肺和肾脏中表达。其表达产物LRP1B蛋白在细胞粘附、迁移和信号转导中发挥作用，并可能参与肿瘤抑制功能，因为它常在多种癌症（如肺癌、乳腺癌和胶质瘤）中发生缺失或突变。LRP1B的突变可能导致其功能丧失，从而影响细胞周期调控和凋亡，增加肿瘤发生的风险。研究表明，LRP1B的缺失或低表达与癌症进展和不良预后相关，而过表达可能抑制肿瘤细胞的侵袭和转移能力。此外，LRP1B可能通过调节Wnt/β-catenin和TGF-β等信号通路影响细胞行为。LRP1B基因的异常还与神经系统疾病如阿尔茨海默病和精神分裂症有关，可能通过影响突触可塑性和神经元存活发挥作用。LDLR基因家族的共性包括含有多个配体结合域（如EGF重复序列和LDLR结构域），参与内吞途径，并在脂质代谢、细胞信号传导和维持组织稳态中起关键作用。LRP1B的功能复杂性使其成为癌症治疗和神经退行性疾病研究的潜在靶点。

LRP1B belongs to the low density lipoprotein (LDL) receptor gene family. These receptors play a wide variety of roles in normal cell function and development due to their interactions with multiple ligands (Liu et al., 2001 [PubMed 11384978]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

LRP1B属于低密度脂蛋白（LDL）受体基因家族。这些受体发挥各种各样的正常细胞功能和发育作用，由于其具有多个配位体相互作用（Liu等人，2001 [搜索PubMed 11384978]）。[由OMIM，2008年3月提供的]

OMIM数据库中对LRP1B基因的介绍     Wikipedia数据库中对LRP1B基因的介绍

基因序列

基因序列

LRP1B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

LRP1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs994860       rs1369537       rs1435595       rs1541976       rs1898016       rs1992000       rs5834874       rs6429925       rs7569470       rs7570381       rs10172953       rs10176459       rs10185119       rs10496902       rs10496903       rs11894216       rs12691621      

基因表达

基因表达

LRP1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGACAACCTATTATCAATGGAGG
60
ATTTGTTGGCTTTGTTGGGT
59
TCACGTGACTTGTGTCTCC
60
CATGTTCTGGAGGTATCTAAAGAC
59
GTCTTTAGATACCTGTCCCGA
59
ACACATTTGTTGGTACCAAGG
59
GAGAACTGTGAAAGAGGAGG
58
CCAGAAATGTAGTTTGCAGAG
57
TTCAGACGAGTCTTTAGATACC
57
GTACAGACTGTAAGCTGAGAG
58
ATCTCTGTGATGAGTGTTCG
58
AACAGACAATTCCTCTTCCAG
58
CGAGATGCAAATGCTCCAC
60
CTGATATGATCAGACTTGCTGC
59
CATTGTGACTGCTGGAAACC
60
TGGCACACGTAGTACTGAC
60
GAGTCTTTAGATACCTGTCCCG
60
ACATTTGTTGGTACCAAGGC
59
CATGTATGAGGTAGATCATGATCAC
59
GTAATTTGTTGGCTTTGTTGGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

LRP1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LRP1B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
A0A087WUR9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A087WUR9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
H0Y7T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y7T7 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H7C0A8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9NZR2 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
Q9NZR2 (UniProtKB)
TAS
GO:0015031
Q9NZR2 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q9NZR2 (UniProtKB)
IEA
GO:0043235
Q9NZR2 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 LRP1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Systemic arterial pressure 0.122367032 1 2 GAD_GWASCAT
Blood pressure finding 0.122367032 1 2 GAD_GWASCAT
Motion Sickness 0.12 1 2 GWASCAT
Renal Cell Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
melanoma 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma 0.002995792 1 0 BeFree_LHGDN
Osteoporosis 0.002367032 1 1 GAD
Malignant tumor of optic nerve 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Disorder of the optic nerve 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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