LRRC8E (leucine rich repeat containing 8 VRAC subunit E)

symbol:
LRRC8E
locus group:
protein-coding gene
location:
19p13.2
gene_family:
alias symbol:
FLJ23420
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None
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80131
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NM_025061
hgnc_id:
HGNC:26272
approved reserved:
2005-06-29
19p13.2
基因染色体位置图

LRRC8E(Leucine-Rich Repeat Containing 8 Family Member E)是LRRC8基因家族的一员,该家族共有五个成员(LRRC8A-E),它们共同编码体积调节性阴离子通道(VRACs)的亚基。这些通道在细胞体积调节、渗透压平衡和多种溶质(如氯离子、氨基酸和神经递质)的跨膜转运中起关键作用。LRRC8E通常与其他家族成员(尤其是LRRC8A)形成异源多聚体通道,LRRC8A是功能核心亚基,缺乏它通道无法正常组装。LRRC8E的表达具有组织特异性,尤其在神经系统和肾脏中较丰富,可能影响通道的渗透压敏感性和底物选择性。突变或表达异常可能导致细胞体积失调,与神经系统疾病(如癫痫)、癌症(如胶质瘤的化疗耐药性)或肾脏功能紊乱相关。过表达LRRC8E可能改变VRAC通道的特性(如增大通道孔径),增强特定溶质(如抗癌药物顺铂)的摄取,但也可能破坏离子稳态;而敲低表达可能导致细胞应对渗透压变化的能力下降,影响神经元兴奋性或肾脏的电解质平衡。LRRC8基因家族的共性包括:均含有保守的亮氨酸重复序列(参与蛋白质相互作用)、跨膜结构域,且依赖LRRC8A形成功能性通道,但各成员通过组合不同赋予通道组织特异性和功能多样性。研究提示LRRC8E可能通过调节VRAC活性影响神经信号传导或肿瘤微环境,但其具体机制仍需进一步探索。

This gene encodes a member of a small, conserved family of proteins with similar structure, including a string of extracellular leucine-rich repeats. A related protein was shown to be involved in B-cell development. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jun 2012]

该基因编码具有相似的结构,包括胞外富含亮氨酸的重复序列的字符串蛋白的小,保守家族的一个成员。一个相关的蛋白质被证明参与B细胞的发展。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的,2012年6月提供]

LRRC8E基因的碱基序列:[NCBI]
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LRRC8E基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2046921       rs530460344       rs532384283       rs538046275       rs539380395       rs547307266       rs552654779       rs566884247       rs480285       rs483808       rs486497       rs496702       rs507264       rs511611       rs511650       rs524029       rs525123      

LRRC8E基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
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ATCTTGTCCTGTGTCACCTG
60
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60
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60
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59
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60
GTTCAAGGTGCTCAAACCC
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TCTTGTCCTGTGTCACCTG
59
      尚未收录相关数据

LRRC8E基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LRRC8E基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
M0QZ48 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
M0R2D8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
M0R2K8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005225
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IMP
GO:0005515
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005789
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IMP
GO:0044070
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0098656
Q6NSJ5 (UniProtKB)
IMP

可能调控 LRRC8E基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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