LSG1 (large 60S subunit nuclear export GTPase 1)

symbol:
LSG1
locus group:
protein-coding gene
location:
3q29
gene_family:
alias symbol:
FLJ11301
alias name:
None
entrez id:
55341
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ENSG00000041802
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uc003fui.3
refseq accession:
NM_018385
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HGNC:25652
approved reserved:
2005-12-22
3q29
基因染色体位置图

LSG1(Large Subunit GTPase 1)是一种编码GTP结合蛋白的基因,属于GTP酶家族,特别是与核糖体生物发生相关的GTP酶亚家族。LSG1在真核细胞中高度保守,主要参与核糖体大亚基的成熟和细胞质中的最终组装过程。其表达产物LSG1蛋白通过水解GTP提供能量,确保核糖体大亚基的正确形成,从而维持蛋白质翻译的准确性。LSG1的作用位点主要在细胞质中,与核糖体大亚基前体(如60S亚基)相互作用,促进其成熟和功能激活。若LSG1发生突变,可能导致核糖体组装缺陷,进而影响蛋白质合成效率,甚至引发核糖体病(ribosomopathies),这类疾病通常表现为发育异常、贫血或癌症倾向。研究表明,LSG1的异常表达与某些癌症(如肝癌和结直肠癌)的进展相关,可能通过扰乱蛋白质合成导致细胞增殖失控。当LSG1过表达时,可能干扰核糖体稳态,引发未成熟核糖体亚基的积累,影响翻译保真度;而降低表达则会导致核糖体大亚基组装受阻,抑制细胞生长。LSG1属于YlqF/YawG GTP酶家族,该家族成员普遍参与RNA代谢和核糖体生物发生,其共性包括具有保守的GTP结合结构域,通过GTP水解调控核糖体成熟或RNA加工过程。此外,LSG1的功能与其它核糖体组装因子(如NMD3和TIF6)密切相关,共同协调核糖体大亚基的输出和激活。

This gene encodes a protein related to the yeast large subunit GTPase 1. The encoded protein is necessary for cell viability and may localize in the endoplasmic reticulum, nucleus and cytoplasm.[provided by RefSeq, Feb 2009]

该基因编码与酵母大亚基GTP酶1编码的蛋白质是必需的细胞生存力和在内质网,细胞核和细胞质可本地化的蛋白质[通过的RefSeq,2009年2月提供]

LSG1基因的碱基序列:[NCBI]
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LSG1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1491       rs1493       rs9258       rs15304       rs711994       rs748962       rs754175       rs754176       rs789989       rs789990       rs898816       rs898817       rs898818       rs898819       rs898820       rs898821       rs898824      

LSG1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGAACACAAAGTTGCACAC
59
GCTCTGTTCAGTCACTGAC
58
CACAAAGCACTTTCAGACTC
57
ATTTCTGCCTTGGTAGACAC
58
TACTGGAGCTCTTTAAGGAGC
59
CATTAGGGTAGCCCACCAG
60
GCTTATGGATACATGCGAGG
59
TAGTCCTTCAGGATGTAGCG
59
AAGGCAGAAATGACTTGCAG
59
CGTTATGATTAGTGATACAGGAGG
59
ATGCGAGGATTCATGACAG
58
CAGCTTACCACTGACATAGTC
58
GTCTTTCGAGGAGAGCCAG
60
TTCCAGTTTGGTCTCCTCG
59
AATGGTGACTCTGAGGAAGAG
59
CTGGTCGAAACTGGAATGTC
59
TCCATCAAGAGAATGTGAGGG
60
TGCAGTCACTACACCACTC
59
CACAAAGCACTTTCAGACTC
57
ATTTCTGCCTTGGTAGACAC
58
      尚未收录相关数据

LSG1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LSG1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005525
H7C2X7 (UniProtKB)
IEA
GO:0003924
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005525
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005634
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9H089 (UniProtKB)
IBA
GO:0015030
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0015031
Q9H089 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9H089 (UniProtKB)
IDA
GO:0042254
Q9H089 (UniProtKB)
IBA
GO:0051168
Q9H089 (UniProtKB)
IDA

可能调控 LSG1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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