LY6G6F (lymphocyte antigen 6 family member G6F)

symbol:
LY6G6F
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
gene_family:
V-set domain containing
alias symbol:
G6f|NG32
alias name:
None
entrez id:
259215
ensembl gene id:
ENSG00000204424
ucsc gene id:
uc003nwa.2
refseq accession:
NM_001003693
hgnc_id:
HGNC:13933
approved reserved:
2002-08-05
6p21.33
基因染色体位置图

LY6G6F(淋巴细胞抗原6复合物基因G6F)属于LY6基因家族,该家族编码一类通过糖基磷脂酰肌醇(GPI)锚定在细胞膜上的小分子蛋白,其成员通常参与免疫调节、细胞信号传导和细胞间相互作用。LY6G6F的生物学功能尚未完全明确,但基于家族共性推测可能参与免疫细胞(如T细胞、B细胞或自然杀伤细胞)的激活或抑制过程,其表达产物可能通过与其他膜蛋白(如受体或配体)相互作用调控免疫应答。该基因主要表达于免疫相关组织(如脾脏、淋巴结),其突变可能影响免疫细胞功能,导致自身免疫疾病或免疫缺陷风险增加。目前研究发现LY6G6F在多种癌症(如胃癌、结直肠癌)中异常表达,可能与肿瘤免疫逃逸相关。过表达LY6G6F可能抑制免疫细胞活性,促进肿瘤进展;而低表达可能削弱免疫监视功能。该基因家族(LY6/uPAR家族)的共性包括:含有保守的LY6/uPAR结构域(一种由8-10个半胱氨酸形成的三指蛋白折叠结构),通过GPI锚定于细胞膜,并参与细胞黏附、信号转导等过程。需要注意的是,部分中文文献可能将LY6G6F翻译为"淋巴细胞抗原6家族成员G6F",但更准确的命名应保留英文编号(因LY6家族成员命名规则尚未完全统一中文译法)。目前针对该基因的研究较少,其具体机制仍需进一步探索。

The human G6f protein is a type I transmembrane protein belonging to the immunoglobin (Ig) superfamily, which is comprised of cell-surface proteins involved in the immune system and cellular recognition (de Vet et al., 2003 [PubMed 12852788]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

人类G6f蛋白质是I型跨膜蛋白属于免疫球蛋白(Ig)的超家族,它包括参与免疫系统和细胞识别(德兽医等细胞表面蛋白的人,2003 [搜索PubMed 12852788 ])。[由OMIM,2008年3月供应]

LY6G6F基因的碱基序列:[NCBI]
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LY6G6F基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs143980993       rs148571474       rs180754148       rs181719594       rs185013980       rs189394597       rs200413967       rs537519472       rs538622860       rs542949894       rs548335663       rs553536929       rs555819566       rs561028587       rs805287       rs805288       rs805289      

LY6G6F基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CAGGGAGTTGTCATCCTGG
60
TGAGGAATCGAGGCATCTC
59
CCAGGGAGTTGTCATCCTG
60
AGGAATCGAGGCATCTCTG
59
CAGGGAGTTGTCATCCTGG
60
AGGAATCGAGGCATCTCTG
59
      尚未收录相关数据

LY6G6F基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

LY6G6F基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q5SQ64 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q5SQ64 (UniProtKB)
IEA

可能调控 LY6G6F基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Spontaneous abortion 0.002367032 1 0 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 0 GAD
Frontotemporal Lobar Degeneration 0.000271442 1 0 BeFree

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