MGAT5B (alpha-1,6-mannosylglycoprotein 6-beta-N-acetylglucosaminyltransferase B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
MGAT5B
locus group:
protein-coding gene
location:
17q25.2
gene_family:
Mannosyl-glycoprotein N-acetylglucosaminyltransferases
alias symbol:
GnT-IX|FLJ25132|GnT-VB
alias name:
None
entrez id:
146664
ensembl gene id:
ENSG00000167889
ucsc gene id:
uc002jth.4
refseq accession:
NM_144677
hgnc_id:
HGNC:24140
approved reserved:
2004-02-20

基因染色体位置

基因染色体位置

17q25.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

MGAT5B（Mannosyl (Alpha-1,6-)-Glycoprotein Beta-1,6-N-Acetylglucosaminyltransferase, Isozyme B）属于糖基转移酶家族中的MGAT家族（N-乙酰氨基葡萄糖转移酶家族），该家族成员主要负责在蛋白质糖基化过程中催化N-糖链的分支结构形成。MGAT5B是MGAT5的亚型之一，与MGAT5A共同参与调控N-糖链的β1,6分支合成，影响细胞表面糖蛋白的结构和功能。MGAT5B主要在睾丸中高表达，其功能与精子发生和男性生殖系统发育密切相关。该基因编码的酶通过催化GlcNAc（N-乙酰葡萄糖胺）转移到糖链的α1,6-甘露糖残基上，形成β1,6分支结构，这种修饰对细胞黏附、信号传导和免疫调节等过程具有重要影响。 MGAT5B的突变可能导致糖基化异常，影响精子形成或男性生育能力。研究表明，MGAT5B的表达水平变化可能与某些生殖系统疾病相关，如少精症或无精症。此外，由于糖基化在肿瘤发生中的作用，MGAT5B的异常表达也可能影响肿瘤细胞的迁移和侵袭能力。如果MGAT5B过表达，可能增强糖蛋白的β1,6分支结构，促进细胞迁移或肿瘤转移；而降低表达则可能削弱精子发生过程中的糖基化修饰，导致生殖功能障碍。 MGAT家族（包括MGAT1、MGAT2、MGAT3、MGAT4、MGAT5等）的共性在于它们均参与N-糖链的生物合成，通过添加GlcNAc残基调控糖蛋白的复杂结构，进而影响蛋白质的稳定性、细胞间相互作用和信号转导。MGAT5B与MGAT5A功能相似，但组织分布不同，MGAT5B主要在睾丸中发挥作用，而MGAT5A在多种组织中广泛表达。总体而言，MGAT5B在男性生殖系统中具有关键作用，其表达异常可能影响生育能力或与某些疾病相关，但具体机制仍需进一步研究。

The MGAT5B gene encodes a beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase (EC 2.4.1.155) that functions in the synthesis of complex cell surface N-glycans (Kaneko et al., 2003 [PubMed 14623122]).[supplied by OMIM, Nov 2008]

的MGAT5B基因编码的β-1,6-N乙酰葡糖（EC 2.4.1.155），在复杂的细胞表面N-聚糖合成（Kaneko等，2003 [搜索PubMed 14623122]。）函数[。通过OMIM，2008年11月提供]

OMIM数据库中对MGAT5B基因的介绍     Wikipedia数据库中对MGAT5B基因的介绍

基因序列

基因序列

MGAT5B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

MGAT5B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs76936       rs472078       rs474589       rs485153       rs485262       rs487598       rs487952       rs487953       rs488972       rs490997       rs491209       rs491682       rs491914       rs493388       rs494468       rs496994       rs499223      

基因表达

基因表达

MGAT5B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCAGAAGATGCCTGGTCAC
59
GAGACGTCATCAGGAAGCA
60
CTAATCTGTGAGCCCTCCT
58
TACAGGTGGTTCATCTCCG
59
CTAATCTGTGAGCCCTCCT
58
GTACAGGTGGTTCATCTCC
57
TGAAGAAGCGGACCAAGAG
60
GACCAGGATCTGCTTCTGG
60
TCTGACTGCACTCTATGTCC
59
CCTCAGTCTCCTTTGCCTC
60
GTCTTCCAGGTCACCAGAG
59
GTTACTGCCGGGTTATTTACAC
60
CTAATCTGTGAGCCCTCCT
58
GTACAGGTGGTTCATCTCC
57
CATGACCATGTTTCCTCATACC
59
CTTTGATGAGCCGCTTCTC
59
CATGACCATGTTTCCTCATACC
59
CTTTGATGAGCCGCTTCTC
59
TCATGACCATGTTTCGGGA
59
CTGGCTCTCGTAGTACACG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

MGAT5B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MGAT5B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006487
H3BQ65 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H3BQ65 (UniProtKB)
IEA
GO:0030144
H3BQ65 (UniProtKB)
IEA
GO:0006487
H3BR20 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H3BR20 (UniProtKB)
IEA
GO:0030144
H3BR20 (UniProtKB)
IEA
GO:0000139
Q3V5L5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q3V5L5 (UniProtKB)
IPI
GO:0006487
Q3V5L5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q3V5L5 (UniProtKB)
IEA
GO:0030144
Q3V5L5 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
Q3V5L5 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 MGAT5B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Polycystic Ovary Syndrome 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Invasiveness 0.00272435 1 0 LHGDN
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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