MICA (MHC class I polypeptide-related sequence A)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
MICA
locus group:
protein-coding gene
location:
6p21.33
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C1-set domain containing
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PERB11.1
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NM_001177519
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HGNC:7090
approved reserved:
1994-05-16

基因染色体位置

基因染色体位置

6p21.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

MICA（MHC class I polypeptide-related sequence A）属于MHC I类相关基因家族（MIC基因家族），该家族还包括MICB等其他成员，共同特点是编码与经典MHC I类分子结构相似但功能不同的蛋白质。MICA基因位于人类6号染色体短臂的MHC区域，主要表达于上皮细胞和成纤维细胞表面。其编码的MICA蛋白是一种应激诱导分子，当细胞受到感染、热休克或DNA损伤等压力时表达上调。MICA作为配体与自然杀伤（NK）细胞、γδ T细胞和CD8+ αβ T细胞表面的NKG2D受体结合，激活这些免疫细胞的杀伤功能，在抗感染和肿瘤免疫监视中起关键作用。MICA基因具有高度多态性，目前已发现超过100种等位基因变异。某些突变会导致MICA蛋白表达异常或功能丧失，例如跨膜区缺失突变会产生可溶性MICA，这种可溶性蛋白会竞争性抑制膜型MICA与NKG2D的结合，削弱免疫监视功能，与多种癌症（如胃癌、肝癌）的进展和转移相关。MICA过表达可增强对肿瘤细胞的免疫清除，但持续高表达可能导致NK细胞耗竭；而表达降低则会使肿瘤细胞逃避免疫监视。此外，MICA基因多态性与自身免疫性疾病（如类风湿关节炎）、移植排斥反应和某些感染性疾病的易感性有关。MIC基因家族的共性在于它们都编码非经典的MHC I类分子，不参与抗原呈递而是作为应激信号分子，通过NKG2D受体通路调节先天免疫和获得性免疫应答。

This gene encodes the highly polymorphic major histocompatability complex class I chain-related protein A. The protein product is expressed on the cell surface, although unlike canonical class I molecules it does not seem to associate with beta-2-microglobulin. It is a ligand for the NKG2-D type II integral membrane protein receptor. The protein functions as a stress-induced antigen that is broadly recognized by intestinal epithelial gamma delta T cells. Variations in this gene have been associated with susceptibility to psoriasis 1 and psoriatic arthritis, and the shedding of MICA-related antibodies and ligands is involved in the progression from monoclonal gammopathy of undetermined significance to multiple myeloma. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jan 2014]

该基因编码的高度多态性主要组织相容性复合体I类链相关蛋白A的蛋白质产物在细胞表面上表达的，虽然不像经典I类分子似乎不与β-2微球蛋白相关联。它是为NKG2-D II型整合膜蛋白受体的配体。该蛋白质用作应激诱导抗原是大致由肠上皮的γδT细胞识别。在这种基因的变化已经与易感性相关银屑病1和银屑病关节炎和MICA相关抗体和配体的脱落是参与从多发性骨髓瘤意义不明的单克隆丙种球蛋白病的进展。这个基因的选择性剪接的结果在多个转录变体。 [由RefSeq的，2014年1月提供]

OMIM数据库中对MICA基因的介绍     Wikipedia数据库中对MICA基因的介绍

基因序列

基因序列

MICA基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

MICA基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2251731       rs2251731       rs2428474       rs2428474       rs2428475       rs2428475       rs2507970       rs2523453       rs2523453       rs2523454       rs2523454       rs2523455       rs2523455       rs2523456       rs2523456       rs2523457       rs2523457      

基因表达

基因表达

MICA基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAAGAAGGCTTGCATTCC
57
GTAGAAATGCTGGGAGCTC
58
AGAAAGAAGGCTTGCATTCC
59
TAGAAATGCTGGGAGCTCC
59
AGGACCAGAAAGAAGTGCC
60
AGGTCAGTATGATATTCCGGG
59
GAAAGAAGGCTTGCATTCCC
60
TAGAAATGCTGGGAGCTCC
59
GAAAGAAGGCTTGCATTCC
57
GTAGAAATGCTGGGAGCTC
58
AGGACCAGAAAGAAGTGCC
60
GATAGAAGCTGGAAGCCCT
59
AGGACCAGAAAGAAGTGCC
60
ATAGAAGCTGGAAGCCCTG
59
GAAAGAAGGCTTGCATTCCC
60
TAGAAATGCTGGGAGCTCC
59
GAGACCAGGGACTTGACAG
59
AATGCAAGCCTTCTTTCTGG
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
HDAC1
MICA
Unknown
17625602
HIF1A
MICA
Activation
21092233
HSF1
MICA
Activation
19139882
NFKB1
MICA
Unknown
15494508
RELA
MICA
Unknown
15494508
SP1
MICA
Activation
19139882
STAT3
MICA
Repression
21257710; 23686482

基因本体信息

MICA基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MICA基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006955
A0A024RCL3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0G2JJ55 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A0G2JK11 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T986 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T9B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T9I5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T9P3 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T9T9 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
A0A140T9Z8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006955
H0Y615 (UniProtKB)
IEA
GO:0001913
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0002418
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0003823
Q29983 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q29983 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q29983 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q29983 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q29983 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q29983 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0006974
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0009408
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0016032
Q29983 (UniProtKB)
IEA
GO:0019835
Q29983 (UniProtKB)
IEA
GO:0019882
Q29983 (UniProtKB)
IBA
GO:0032815
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0042267
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0042742
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0042742
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0045953
Q29983 (UniProtKB)
IMP
GO:0046629
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0046703
Q29983 (UniProtKB)
IPI
GO:0046703
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0050776
Q29983 (UniProtKB)
TAS
GO:0051607
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0051607
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0030881
Q29983 (UniProtKB)
IDA
GO:0006955
Q96QC4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q96QC4 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 MICA基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Liver carcinoma 0.243800186 15 2 BeFree_CTD_human_GWASCAT
Ankylosing spondylitis 0.128729747 10 1 BeFree_GAD_GWASCAT
Oral Submucous Fibrosis 0.122638474 2 0 BeFree_CTD_human_GAD
Coronary Aneurysm 0.12 1 0 CTD_human
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.020716797 27 0 BeFree_GAD
Behcet Syndrome 0.013811198 18 1 BeFree_GAD
Ulcerative Colitis 0.009544073 10 0 BeFree_GAD
Inflammatory Bowel Diseases 0.008458305 6 0 BeFree_GAD
Autoimmune Diseases 0.00764398 5 0 BeFree_GAD
Celiac Disease 0.007177041 9 0 BeFree_GAD

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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