MKS1 (MKS transition zone complex subunit 1)

symbol:
MKS1
locus group:
protein-coding gene
location:
17q22
gene_family:
alias symbol:
FLJ20345|POC12|BBS13
alias name:
POC12 centriolar protein homolog (…
entrez id:
54903
ensembl gene id:
ENSG00000011143
ucsc gene id:
uc002ivr.3
refseq accession:
NM_017777
hgnc_id:
HGNC:7121
approved reserved:
1995-11-07
17q22
基因染色体位置图

MKS1(Meckel综合征1型)基因位于人类第17号染色体上(17q22),属于MKS基因家族(也称为B9基因家族),该家族成员编码的蛋白质主要参与纤毛的形成和功能调控。MKS1基因编码的蛋白质是一种纤毛基体过渡区(transition zone)的关键组分,与多个蛋白质(如B9D1、B9D2)形成复合物,负责维持纤毛的结构完整性和信号传导功能。纤毛是细胞表面的毛发状突起,在胚胎发育、细胞运动、感觉信号传递(如光、声音)及体液流动调节中起重要作用。MKS1蛋白通过与其他纤毛相关蛋白(如TMEM67、CC2D2A)相互作用,参与Hedgehog等关键信号通路的调控。若MKS1发生功能丧失性突变(如无义突变或移码突变),会导致纤毛结构或功能缺陷,引发纤毛病(ciliopathies),典型疾病为Meckel综合征(Meckel-Gruber syndrome),表现为多囊肾、神经管缺陷(如脑膨出)、多指/趾畸形及肝脏纤维化等致命性发育异常。此外,MKS1突变还与Joubert综合征、Bardet-Biedl综合征等其他纤毛疾病相关,表现为智力障碍、视网膜变性或肥胖等症状。MKS1表达异常(如过表达)可能破坏纤毛蛋白复合物的平衡,干扰纤毛依赖性信号通路(如Wnt或PDGFRα),导致细胞增殖或迁移异常,与某些癌症(如肾细胞癌)的进展相关;而表达降低则直接损害纤毛组装,加剧发育缺陷。MKS基因家族的共性在于其成员均编码纤毛过渡区或基底体相关蛋白,通过维持纤毛的“分子门控”功能,选择性调控物质进出纤毛腔,确保信号分子的精确传递。该家族突变普遍导致纤毛结构紊乱,影响多个器官系统,尤其是肾脏、眼睛和中枢神经系统。研究MKS1有助于理解纤毛疾病的分子机制,并为相关诊断或靶向治疗提供依据。

The protein encoded by this gene localizes to the basal body and is required for formation of the primary cilium in ciliated epithelial cells. Mutations in this gene result in Meckel syndrome type 1 and in Bardet-Biedl syndrome type 13. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

由该基因编码的蛋白质定位于基体,并且需要用于形成在纤毛上皮细胞中的纤毛的。这个基因导致梅克尔综合征1型和巴比二氏综合征型突变13.编码不同亚型的多个抄本变形也发现了这种基因。 [由RefSeq的,2009年09月提供]

MKS1基因的碱基序列:[NCBI]
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MKS1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1045619       rs2302312       rs2302313       rs17174788       rs71372830       rs142408069       rs193246491       rs374636359       rs386465709       rs534858118       rs538594262       rs545361117       rs546824291       rs549529445       rs553592651       rs554284436       rs556702479      

MKS1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACCAATTTGGAGGAGGGAG
59
TGGTTGTTCCTGACAAACTC
58
CCAATTTGGAGGAGCACTG
59
TGACATTTGCCATTCGCTC
59
TGAGGATGAATCTTCTGATGCA
60
GTACCTCTGCCAGAAGTCC
60
TCCCTGGCAATGATAACCT
58
AAAGGAGTGTCATAGGGTGG
59
CCAATTTGGAGGAGCACTG
59
TGACATTTGCCATTCGCTC
59
CTTTAGCCAGTTTGAAGTAGATCTG
60
CCAGCTTCAGGATCTCCTG
60
CACAATGTGCTAGAGGCCT
60
CTGTGAGCTAGGAGACCAG
59
TTCATTATCAGCCTGCTGC
58
CATTCTCTGACAGTGTGGC
59
TGAAGCTGGAGAATTCGGG
60
CATGGAGCCAAGTACCTCC
60
AATTGCCAACTGCTCACTG
59
GTAGGAGAAGTGAGCCACC
59
      尚未收录相关数据

MKS1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

MKS1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001843
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9NXB0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NXB0 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q9NXB0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q9NXB0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005813
Q9NXB0 (UniProtKB)
IDA
GO:0005814
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005829
Q9NXB0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NXB0 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NXB0 (UniProtKB)
TAS
GO:0007368
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0010669
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0016020
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0035058
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0036038
Q9NXB0 (UniProtKB)
ISS
GO:0036064
Q9NXB0 (UniProtKB)
IDA
GO:0036064
Q9NXB0 (UniProtKB)
IDA
GO:0042384
Q9NXB0 (UniProtKB)
IMP
GO:0042733
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048706
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0048754
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0060122
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0060271
Q9NXB0 (UniProtKB)
ISS
GO:0060322
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0060828
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:0061009
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:1901620
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:1903887
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:1990403
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA
GO:2000095
Q9NXB0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 MKS1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Meckel syndrome type 1 0.327719925 11 18 BeFree_CLINVAR_CTD_human_GAD_MGD
Bardet-Biedl Syndrome 0.243810118 4 0 BeFree_CTD_human_LHGDN_ORPHANET
Meckel-Gruber syndrome 0.240814326 3 1 BeFree_CLINVAR_ORPHANET
BARDET-BIEDL SYNDROME 13 0.24 1 4 CLINVAR_UNIPROT
Polydactyly 0.005634266 4 0 BeFree_GAD_LHGDN
Congenital Abnormality 0.002367032 1 0 GAD
Sarcoma 0.001085767 4 0 BeFree
Uterine Corpus Sarcoma 0.000814326 3 0 BeFree
Familial aplasia of the vermis 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000542884 2 0 BeFree

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