NID1 (nidogen 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NID1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q42.3
gene_family:
alias symbol:
entactin
alias name:
None
entrez id:
4811
ensembl gene id:
ENSG00000116962
ucsc gene id:
uc001hxo.4
refseq accession:
NM_002508
hgnc_id:
HGNC:7821
approved reserved:
1989-05-25

基因染色体位置

基因染色体位置

1q42.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NID1（Nidogen-1）是一种基底膜蛋白，属于Nidogen基因家族（包括NID1和NID2），其主要功能是作为基底膜的重要结构组分，参与细胞外基质的组装和稳定。NID1通过与层粘连蛋白（Laminin）和IV型胶原（Collagen IV）等基底膜成分相互作用，促进基底膜的形成和维持组织结构的完整性。它在胚胎发育、组织修复和细胞迁移等过程中发挥关键作用。NID1主要表达于肾脏、肺、皮肤和血管等组织的基底膜中。NID1的突变可能导致基底膜结构异常，进而引发多种疾病，如肾脏疾病（如Alport综合征）、皮肤脆弱性疾病和某些类型的癌症（如乳腺癌和前列腺癌），因为基底膜完整性的破坏会影响细胞行为和信号传导。NID1过表达可能与肿瘤侵袭和转移相关，因为它可能促进癌细胞突破基底膜屏障；而NID1表达降低可能导致组织脆弱或发育缺陷，如肾脏或肺部的功能障碍。Nidogen基因家族的共性在于它们都编码基底膜蛋白，具有类似的结构域（如G2和G3结构域），能够与多种细胞外基质蛋白结合，起到连接和稳定基底膜网络的作用。NID1还参与调节生长因子（如TGF-β）的活性，影响细胞增殖和分化。研究表明，NID1在炎症反应和纤维化过程中也可能发挥作用。总的来说，NID1是维持组织结构和功能的重要分子，其表达水平的异常与多种病理过程密切相关。

This gene encodes a member of the nidogen family of basement membrane glycoproteins. The protein interacts with several other components of basement membranes, and may play a role in cell interactions with the extracellular matrix. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的巢蛋白家族基底膜的糖蛋白中的一员。该蛋白质与基底膜的几个其他组件进行交互，并且可以在细胞相互作用的作用与细胞外基质。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对NID1基因的介绍     Wikipedia数据库中对NID1基因的介绍

基因序列

基因序列

NID1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

NID1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs873       rs982       rs13984       rs715956       rs715957       rs735623       rs746996       rs746997       rs749167       rs911273       rs911274       rs911275       rs927730       rs1041111       rs1048253       rs1048311       rs1048316      

基因表达

基因表达

NID1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGAATCCCTGCTACATCGG
59
TTTCTCCACCTCATAGCAGG
59
GGTTGTCACTTGGGAATCC
59
TGGAACGTGTTTCTCTTGC
59
GTATCTACACAGGAGGCTCC
59
CATCTACATCTTGGCAGGC
58
GTTGTCACTTGGGAATCCG
59
CTGGAACGTGTTTCTCTTGC
60
AGAATCCCTGCTACATCGG
59
TTCTCCACCTCATAGCAGG
59
TATCTACACAGGAGGCTCCT
59
CATCTACATCTTGGCAGGC
58
TAGACAAGATCTTGGAAGTCCAG
60
TCCAGGTTAGAGTCTGTCCA
60
AGAATCCCTGCTACATCGG
59
TCTCCACCTCATAGCAGGT
60
TATCTACACAGGAGGCTCC
58
CATCTACATCTTGGCAGGC
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NID1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NID1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0005518
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0005576
P14543 (UniProtKB)
TAS
GO:0005576
P14543 (UniProtKB)
TAS
GO:0005604
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0005605
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0007160
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0010811
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0022617
P14543 (UniProtKB)
TAS
GO:0030198
P14543 (UniProtKB)
TAS
GO:0031012
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0032836
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0043236
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0043237
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0043394
P14543 (UniProtKB)
IPI
GO:0070062
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0071711
P14543 (UniProtKB)
TAS
GO:0071944
P14543 (UniProtKB)
IEA
GO:0031012
P14543 (UniProtKB)
IDA
GO:0031012
P14543 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NID1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

MINT

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Weight Gain 0.12 1 0 CTD_human
Hydrocephalus Adverse Event 0.12 0 1 CLINVAR
Nevi and Melanomas 0.002367032 1 1 GAD
Hirschsprung Disease 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant tumor of colon 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of endometrium 0.000271442 1 0 BeFree
Diabetic Retinopathy 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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