NKD2 (NKD inhibitor of WNT signaling pathway 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
NKD2
locus group:
protein-coding gene
location:
5p15.33
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
Naked2
alias name:
naked cuticle-2|Dvl-binding protei…
entrez id:
85409
ensembl gene id:
ENSG00000145506
ucsc gene id:
uc003jbt.3
refseq accession:
NM_033120
hgnc_id:
HGNC:17046
approved reserved:
2001-10-19

基因染色体位置

基因染色体位置

5p15.33
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

NKD2（Naked Cuticle Homolog 2）是Wnt信号通路中的一个重要调控基因，属于NKD基因家族（包括NKD1和NKD2）。该家族基因的共同特点是能够通过抑制Wnt/β-catenin信号通路（一种调控细胞增殖、分化和胚胎发育的关键通路）来维持组织稳态。NKD2的生物学功能主要体现在其作为Wnt通路的负反馈调节因子，通过结合并抑制关键蛋白Dishevelled（Dvl）来阻断β-catenin的核转移，从而抑制下游靶基因（如c-Myc、Cyclin D1）的表达，防止细胞过度增殖。其表达产物是一种胞质蛋白，在胚胎发育（如神经管形成）和成体组织（如肠道上皮）中广泛分布，尤其在Wnt高活性区域（如隐窝基底）表达显著。NKD2突变可能导致其抑制功能丧失，引发Wnt信号过度激活，这与多种癌症（如结直肠癌、肝癌）的发生密切相关。例如，NKD2启动子甲基化（一种基因沉默机制）或缺失突变会使其表达下调，导致β-catenin异常积累，促进肿瘤进展。反之，NKD2过表达可抑制Wnt驱动的肿瘤生长，但可能干扰正常组织再生（如肠道干细胞更新）。此外，NKD2还参与非经典Wnt通路（如Wnt/PCP通路）的调控，影响细胞极性（细胞的空间定向）和迁移。在基因家族层面，NKD1和NKD2均含有EF-hand结构域（钙离子结合位点）和Dvl结合域，但NKD2对某些Wnt配体（如Wnt3a）的抑制作用更强。研究表明，NKD2表达水平异常（过高或过低）可能破坏Wnt与其他通路（如Notch、Hedgehog）的交叉调控，进而影响组织发育或修复。例如，在骨质疏松中，NKD2下调会增强Wnt信号，加速破骨细胞（负责骨吸收的细胞）分化；而在神经退行性疾病中，其过表达可能抑制神经前体细胞增殖。这些特性使NKD2成为癌症和发育障碍的潜在治疗靶点。

This gene encodes a member of a family of proteins that function as negative regulators of Wnt receptor signaling through interaction with Dishevelled family members. The encoded protein participates in the delivery of transforming growth factor alpha-containing vesicles to the cell membrane. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Aug 2012]

这个基因编码一个家庭，起作用的Wnt受体通过与散乱家族成员相互作用的信令为负调节蛋白的成员。所编码的蛋白质参与转化生长因子含有的α-囊泡到细胞膜的递送。编码多种亚型选择性剪接的转录物变体已经观察到这种基因。 [由RefSeq的，2012年8月提供]

OMIM数据库中对NKD2基因的介绍     Wikipedia数据库中对NKD2基因的介绍

基因序列

基因序列

NKD2基因的碱基序列：[NCBI]
Loading Gene Browser...

基因突变

基因突变

NKD2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs879352       rs879352       rs881334       rs881334       rs881335       rs881335       rs882622       rs882622       rs882623       rs882623       rs1065335       rs1065335       rs1560174       rs1560174       rs1864093       rs1864093       rs1864094      

基因表达

基因表达

NKD2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AACTACACGTCCAGATTCG
57
ATGTGTATCTGGCTCCTGG
59
TATGACTTTGACAACTGCGG
59
TAGATGGTGTGCATGAGGC
60
ACTACACGTCCAGATTCGG
59
ATGTGTATCTGGCTCCTGG
59
CCTCAACATTGACGCACTC
59
AAAGTCATAGAGCGTGAACG
58
CCTCAACATTGACGCACTC
59
AAAGTCATAGAGCGTGAACG
58
ACTACACGTCCAGATTCGG
59
CATGTGTATCTGGCTCCTG
58
GTGTGAAGCTAACCGTCAG
59
CAGTTCACCCTCCATCCTG
60
CTCAACATTGACGCACTCC
59
AAAGTCATAGAGCGTGAACG
58
ATGACTTTGACAACTGCGG
59
ATAGATGGTGTGCATGAGG
57
CTCAACATTGACGCACTCC
59
AAAGTCATAGAGCGTGAACG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

NKD2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NKD2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
Q969F2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0006887
Q969F2 (UniProtKB)
IEA
GO:0010954
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016023
Q969F2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016055
Q969F2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016323
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0019838
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0031410
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0031625
Q969F2 (UniProtKB)
IPI
GO:0032436
Q969F2 (UniProtKB)
IMP
GO:0048210
Q969F2 (UniProtKB)
IMP
GO:0071944
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0072661
Q969F2 (UniProtKB)
IMP
GO:0090004
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0090090
Q969F2 (UniProtKB)
IMP
GO:0090090
Q969F2 (UniProtKB)
IDA
GO:0016328
Q969F2 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 NKD2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Sarcoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Malignant Peripheral Nerve Sheath Tumor 0.000271442 1 0 BeFree
Glioblastoma 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.000271442 1 0 BeFree
Stomach Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

微信公众号

关注微信订阅号，实时查看信息，关注医学生物学动态。

版权所有 © 2025.Genelibs 济南弘晖生物技术有限公司 鲁ICP备13024435号-2