NTM (neurotrimin)

symbol:
NTM
locus group:
protein-coding gene
location:
11q25
gene_family:
I-set domain containing
alias symbol:
HNT|NTRI|IGLON2|CEPU-1
alias name:
neurotrimin|IgLON family member 2
entrez id:
50863
ensembl gene id:
ENSG00000182667
ucsc gene id:
uc001qgp.4
refseq accession:
NM_016522
hgnc_id:
HGNC:17941
approved reserved:
2009-01-12
11q25
基因染色体位置图

NTM(Neurotrimin)是一种神经细胞粘附分子,属于免疫球蛋白超家族中的LAMP(limbic system-associated membrane protein)家族成员。该家族还包括OPCML和LAMP,它们共同特点是参与神经系统的发育和突触可塑性调节,尤其在神经元之间的识别、粘附和信号传递中发挥关键作用。NTM通过其免疫球蛋白样结构域与其他细胞表面分子相互作用,影响神经回路的形成和功能。NTM主要在大脑边缘系统(如海马、杏仁核)高表达,与情绪调节、学习记忆密切相关。其功能异常可能导致突触连接紊乱,研究发现NTM基因的突变或表达失调与精神分裂症、自闭症谱系障碍等神经精神疾病相关。若NTM过表达,可能增强神经元间的异常连接,导致突触过度活跃;而表达降低则可能损害突触稳定性,影响认知功能。动物模型中,NTM缺失会引发社交行为缺陷和记忆障碍。此外,NTM通过调控钙黏素等粘附分子影响神经迁移,并与GABA能神经元发育相关。该基因的表观遗传修饰(如甲基化)也被发现与精神疾病易感性有关。LAMP家族成员的共性包括:均含有Ig-like和GPI锚定结构域,介导细胞间相互作用;参与轴突导向和突触成熟;并在神经退行性疾病中扮演调控角色。

This gene encodes a member of the IgLON (LAMP, OBCAM, Ntm) family of immunoglobulin (Ig) domain-containing glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchored cell adhesion molecules. The encoded protein may promote neurite outgrowth and adhesion via a homophilic mechanism. This gene is closely linked to a related family member, opioid binding protein/cell adhesion molecule-like (OPCML), on chromosome 11. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jan 2009]

该基因编码的IgLON(LAMP,OBCAM,NTM)家族的免疫球蛋白(Ig)的结构域的糖基(GPI)锚定的细胞粘附分子的成员。所编码的蛋白质可经由嗜同机制促进神经突向外生长和粘附力。该基因是密切相关的相关的家庭成员,阿片类物质结合蛋白/细胞粘附分子样(OPCML),染色体上11多个转录变异体编码不同亚型也发现了这种基因。 [由RefSeq的,2009年1月提供]

NTM基因的碱基序列:[NCBI]
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NTM基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs318980       rs365491       rs370825       rs371425       rs371539       rs373665       rs374598       rs377332       rs377523       rs382319       rs385190       rs385926       rs412486       rs417378       rs422581       rs423399       rs425354      

NTM基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AAATTCAGGGCATCACCAG
58
TATGGTGGATAGTTCACGGT
58
ATCTCTAGAATGGAGTGCCC
59
GGTGAGGCTAATATTGTTCCC
59
CATTGTGCAAGTATCTCCCA
58
CAGGTGAGGCTAATATTGTTCC
59
GTGTCTCTTCCAAGGTAAGTG
58
ATTTCCACCTCTTCCCACC
59
GTGTCTCTTCCAAGGAGTG
58
GACCCGGTTGTCAATAGTG
58
CAGCATCATGCTATTTGAAGTG
59
AAATTTGAGAAGCAGGTGCA
59
AGCATTCCCTTACATGGTCC
60
AGGTGCAAGACCAGAAGAG
59
AAGAGGTGGAAATGGAAGGG
60
AATAGTGCACCTGAGGGTG
59
GTGTCTCTTCCAAGGTAAGTG
58
ATTTCCACCTCTTCCCACC
59
TAACACAACAAACAGGTCCAG
59
AGGTGCAAGACCAGAAGAG
59
      尚未收录相关数据

NTM基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

NTM基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9P121 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q9P121 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q9P121 (UniProtKB)
IEA
GO:0008038
Q9P121 (UniProtKB)
TAS
GO:0031225
Q9P121 (UniProtKB)
IEA

可能调控 NTM基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Mental disorders 0.002367032 1 1 GAD
Asperger Syndrome 0.002367032 1 1 GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Major Depressive Disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Alzheimer Disease, Late Onset 0.000271442 1 0 BeFree
Aortic Aneurysm, Thoracic 0.000271442 1 0 BeFree
Tuberculosis 0.000271442 1 0 BeFree
Tuberculosis, Pulmonary 0.000271442 1 0 BeFree
Unipolar Depression 0.000271442 1 0 BeFree
Glaucoma, Primary Open Angle 0.000271442 1 0 BeFree

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