OCM (oncomodulin)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
OCM
locus group:
protein-coding gene
location:
7p22.1
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
OCM1
alias name:
oncomodulin 1|beta parvalbumin
entrez id:
654231
ensembl gene id:
ENSG00000122543
ucsc gene id:
uc064bff.1
refseq accession:
NM_001097622
hgnc_id:
HGNC:8105
approved reserved:
1992-04-16

基因染色体位置

基因染色体位置

7p22.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

OCM（Oncomodulin）是一种钙结合蛋白，属于S100蛋白家族，该家族成员通常具有EF手型钙结合结构域，参与细胞内的钙信号传导。OCM主要在哺乳动物的耳蜗毛细胞中表达，对听觉功能至关重要，它通过调节钙离子浓度影响毛细胞的机械电转导过程，从而参与声音信号的传递。此外，OCM在视网膜神经节细胞中也有表达，研究表明它能够促进神经轴突再生，可能对中枢神经系统的损伤修复有潜在作用。OCM的突变可能导致听力损失或神经再生障碍，但目前相关研究较少。如果OCM过表达，可能增强神经再生能力，但过高的钙结合活性可能干扰细胞内钙稳态，影响正常生理功能；而降低表达则可能导致听觉功能受损或神经修复能力下降。S100蛋白家族的共性包括参与炎症反应、细胞增殖、分化及凋亡等过程，多数成员通过钙依赖性方式调控下游信号通路。OCM与某些听觉疾病或神经损伤相关疾病可能有关联，但其具体机制仍需进一步研究。

Oncomodulin is a high-affinity calcium ion-binding protein. It belongs to the superfamily of calmodulin proteins, also known as the EF-hand proteins. Oncomodulin is an oncodevelopmental protein found in early embryonic cells in the placenta and also in tumors. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Oncomodulin是一种高亲和性钙离子结合蛋白。它属于钙调蛋白，??也被称为EF-hand蛋白质的家族。 Oncomodulin是在胎盘以及在肿瘤早期胚胎细胞中发现的oncodevelopmental蛋白。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对OCM基因的介绍     Wikipedia数据库中对OCM基因的介绍

基因序列

基因序列

OCM基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

OCM基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs308065       rs308066       rs1971650       rs1971651       rs2108071       rs2345660       rs2345661       rs2881189       rs3890913       rs3896469       rs4286854       rs4343990       rs4404832       rs4451217       rs4724744       rs6943500       rs6943745      

基因表达

基因表达

OCM基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCGAGTCAGAAACCAAGTC
58
TTTCCTGGAATTCCTCTGC
57
CCGAGTCAGAAACCAAGTC
58
TTTCCTGGAATTCCTCTGC
57
CGAGTCAGAAACCAAGTCC
58
ATTTCCTGGAATTCCTCTGC
58
CGAGTCAGAAACCAAGTCC
58
ATTTCCTGGAATTCCTCTGC
58
CGAGTCAGAAACCAAGTCCT
60
ATTTCCTGGAATTCCTCTGCT
60
CGAGTCAGAAACCAAGTCCT
60
ATTTCCTGGAATTCCTCTGCT
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

OCM基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OCM基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
P0CE72 (UniProtKB)
NAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 OCM基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Uveal melanoma 0.002442977 9 0 BeFree
melanoma 0.001357209 5 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant melanoma of choroid 0.000542884 2 0 BeFree
Hepatoma, Morris 0.000271442 1 0 BeFree
Lymphoma, Non-Hodgkin 0.000271442 1 0 BeFree
Monosomy 0.000271442 1 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000271442 1 0 BeFree
Tumor Progression 0.000271442 1 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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