OLIG2 (oligodendrocyte transcription factor 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
OLIG2
locus group:
protein-coding gene
location:
21q22.11
gene_family:
Basic helix-loop-helix proteins
alias symbol:
RACK17|OLIGO2|bHLHe19
alias name:
oligodendrocyte-specific bHLH tran…
entrez id:
10215
ensembl gene id:
ENSG00000205927
ucsc gene id:
uc002yqx.3
refseq accession:
NM_005806
hgnc_id:
HGNC:9398
approved reserved:
1999-10-19

基因染色体位置

基因染色体位置

21q22.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

OLIG2（Oligodendrocyte transcription factor 2）是一种在神经系统中发挥关键作用的转录因子，属于OLIG基因家族（包括OLIG1和OLIG3）。该家族成员均含有碱性螺旋-环-螺旋（bHLH）结构域，主要参与中枢神经系统发育，尤其在少突胶质细胞（负责形成髓鞘的细胞）和运动神经元的命运决定中起核心作用。OLIG2通过调控下游靶基因的表达，促进少突胶质细胞的分化与成熟，并影响神经元亚型的特化。其主要作用位点包括脊髓、大脑皮层及基底节等区域。若OLIG2发生功能丧失突变，可能导致少突胶质细胞发育缺陷，引发髓鞘形成障碍（如白质营养不良），或运动神经元减少（与肌萎缩侧索硬化症ALS相关）；而某些增益性突变则可能干扰细胞分化平衡，与神经胶质瘤（如少突胶质细胞瘤）的发生有关。该基因过表达会加速少突胶质细胞分化，但可能导致其他神经前体细胞（如星形胶质细胞）比例异常，破坏神经细胞多样性；同时可能通过抑制ASCL1等促神经元基因，间接影响神经发生。反之，OLIG2表达降低将导致少突胶质细胞生成受阻，髓鞘修复能力下降（多发性硬化症中观察到该现象），并可能引起运动神经元缺失。OLIG2还与PDGFRA、SOX10等基因形成调控网络，其表达异常会波及整个髓鞘化相关通路。在疾病关联方面，除上述肿瘤和神经退行性疾病外，OLIG2变异还被发现与精神分裂症等精神障碍的易感性相关，可能通过影响前额叶皮层神经环路形成发挥作用。

This gene encodes a basic helix-loop-helix transcription factor which is expressed in oligodendroglial tumors of the brain. The protein is an essential regulator of ventral neuroectodermal progenitor cell fate. The gene is involved in a chromosomal translocation t(14;21)(q11.2;q22) associated with T-cell acute lymphoblastic leukemia. Its chromosomal location is within a region of chromosome 21 which has been suggested to play a role in learning deficits associated with Down syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码其在脑的少突胶质细胞瘤中表达的碱性螺旋 - 环 - 螺旋转录因子。蛋白质是神经外胚层腹侧祖细胞命运的重要调节器。该基因是参与染色体易位t（14; 21）（q11.2; Q22）与T细胞急性淋巴细胞性白血病相关联。其染色体位置是已被建议发挥学习与唐氏综合征相关的障碍作用21号染色体的一个区域内。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对OLIG2基因的介绍     Wikipedia数据库中对OLIG2基因的介绍

基因序列

基因序列

OLIG2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

OLIG2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs762178       rs1005573       rs1059004       rs1122807       rs2009130       rs6517135       rs6517136       rs6517137       rs7278343       rs7509766       rs7509885       rs9653711       rs9975039       rs9982080       rs10653491       rs11908971       rs13046814      

基因表达

基因表达

OLIG2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTATAGATCGACGCGACACC
60
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60
TACATCCTCATGCTCACCA
58
CGTAGATCTCGCTCACCAG
60
TTATAGATCGACGCGACACC
59
AATCTGGATGCGATTTGAGG
58
GCGACAACAGCTCTTTCTG
60
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60
TATAGATCGACGCGACACC
59
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60
CGACAACAGCTCTTTCTGC
60
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60
CTACATCCTCATGCTCACCA
59
GTAGATCTCGCTCACCAGTC
60
TTATAGATCGACGCGACAC
57
AATCTGGATGCGATTTGAGG
58
CTCCTCAAATCGCATCCAG
58
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60
GACAACAGCTCTTTCTGCC
59
GAAGATAGTCGTCGCAGCT
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
OLIG2
LGR5
Unknown
23793848

基因本体信息

OLIG2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OLIG2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000122
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0003677
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0003705
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0006351
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0021522
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0021530
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0021794
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0042552
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0042803
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0045665
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0048663
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0048714
Q13516 (UniProtKB)
IEA
GO:0071837
Q13516 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 OLIG2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Down Syndrome 0.120542884 3 0 BeFree_CTD_human
Muscle Weakness 0.12 1 0 CTD_human
Schizophrenia 0.011811416 6 0 BeFree_GAD_LHGDN
Glioblastoma 0.009248887 14 0 BeFree_LHGDN
oligodendroglioma 0.008163119 11 0 BeFree_LHGDN
Astrocytoma 0.006534468 5 0 BeFree_LHGDN
Glioma 0.006524536 14 0 BeFree_LHGDN
leukemia 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
melanoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Mammary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN

基因相关服务

基因相关服务

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