OPCML (opioid binding protein/cell adhesion molecule like)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
OPCML
locus group:
protein-coding gene
location:
11q25
gene_family:
I-set domain containing
alias symbol:
OPCM|OBCAM|IGLON1
alias name:
IgLON family member 1
entrez id:
4978
ensembl gene id:
ENSG00000183715
ucsc gene id:
uc001qgs.4
refseq accession:
NM_001012393
hgnc_id:
HGNC:8143
approved reserved:
1993-12-13

基因染色体位置

基因染色体位置

11q25
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

OPCML（Opioid Binding Protein/Cell Adhesion Molecule-Like）是一种属于免疫球蛋白超家族的基因，主要编码一种细胞粘附分子，参与细胞间的相互作用和信号传导。它在多种组织中表达，尤其在神经系统和上皮细胞中较为丰富。OPCML通过其Ig样结构域与其他分子相互作用，调节细胞增殖、迁移和凋亡，并在肿瘤抑制中发挥重要作用。研究表明，OPCML的缺失或突变与多种癌症（如卵巢癌、肝癌和肺癌）的发生发展密切相关，其功能丧失可能导致肿瘤细胞的侵袭和转移能力增强。OPCML属于IgLON（Immunoglobulin Superfamily containing LAMP, OBCAM, NTM）基因家族，该家族成员均含有免疫球蛋白样结构域，主要参与神经系统的发育和功能调控。当OPCML过表达时，可以抑制肿瘤细胞的生长和转移，而降低表达则可能促进肿瘤的恶性进展。此外，OPCML还参与阿片类物质的结合，可能与疼痛调节有关。其表观遗传沉默（如甲基化）是癌症中常见的失活机制之一。因此，OPCML不仅是一个潜在的肿瘤抑制基因，也可能成为癌症诊断和治疗的靶点。

This gene encodes a member of the IgLON subfamily in the immunoglobulin protein superfamily. The encoded protein is localized in the plasma membrane and may have an accessory role in opioid receptor function. This gene has an ortholog in rat and bovine. The opioid binding-cell adhesion molecule encoded by the rat gene binds opioid alkaloids in the presence of acidic lipids, exhibits selectivity for mu ligands and acts as a GPI-anchored protein. Since the encoded protein is highly conserved in species during evolution, it may have a fundamental role in mammalian systems. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的免疫球蛋白超家族的IgLON亚科的成员。所编码的蛋白质在细胞膜本地化，并且可以具有在阿片类受体功能的附件的作用。这个基因具有在大鼠和牛直系同源物。由大鼠基因编码的类阿片结合细胞粘附分子结合在酸性脂质的存在下阿片生物碱，表现出对亩的配体，并作为一个GPI锚定蛋白的选择性。由于所编码的蛋白质在物种进化过程中高度保守的，它可以具有在哺乳动物系统中的基本作用。已发现该基因编码不同亚型的两个转录变异体。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对OPCML基因的介绍     Wikipedia数据库中对OPCML基因的介绍

基因序列

基因序列

OPCML基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

OPCML基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11625       rs552196       rs554846       rs571867       rs632268       rs632285       rs658882       rs658894       rs669209       rs722449       rs948202       rs948203       rs948204       rs948205       rs1106737       rs1230356       rs1815781      

基因表达

基因表达

OPCML基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCTTGTCTCAATACAGGCC
59
AGGCTTTCATATTCAATCTGCC
59
TTCCTTGTACCCACAGGAG
59
TATGGTACACCTAAGGGTGG
58
TCGAGATGTACCATCCTGC
59
GTCATCTATGGTACACCTGGG
60
CTATGGACAACGTGACGGT
60
TCATCTATGGTACACCTGAGG
59
TTCCTTGTACCCACAGGAG
59
TATGGTACACCTGAGGGTG
58
CATCACATTGTATGGGCCTG
59
GTCCCTGATAGCCAGAGAC
59
CTCTTCATCCCAGGAGTGC
60
GTTACCCGGTCATCTATGGT
59
TTCCTTGTACCCACAGGAG
59
TATGGTACACCTAAGGGTGG
58
AGGAAGAAACCAGGTTAGC
57
TGAAGAAAGTCAGAGTGGAC
57
TCACATTGTATGGGCCTGG
60
GTCCCTGATAGCCAGAGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

OPCML基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

OPCML基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005886
Q14982 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
Q14982 (UniProtKB)
IEA
GO:0008038
Q14982 (UniProtKB)
TAS
GO:0031225
Q14982 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q14982 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 OPCML基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
ovarian neoplasm 0.245720142 3 1 BeFree_CLINVAR_CTD_human_LHGDN
Blood pressure finding 0.122367032 2 3 GAD_GWASCAT
Systemic arterial pressure 0.122367032 2 3 GAD_GWASCAT
Malignant neoplasm of ovary 0.121357209 5 0 BeFree_UNIPROT
Amyotrophic Lateral Sclerosis 0.12 1 1 GWASCAT
BREAST-OVARIAN CANCER, FAMILIAL, SUSCEPTIBILITY TO, 1 0.12 0 0 CTD_human
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Neoplasm Metastasis 0.00272435 1 0 LHGDN
Stomach Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Schizophrenia 0.002638474 1 1 BeFree_GAD

基因相关服务

基因相关服务

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