PART1 (prostate androgen-regulated transcript 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PART1
locus group:
non-coding RNA
location:
5q12.1
gene_family:
Long non-coding RNAs (published)
alias symbol:
DKFZP586D0823|NCRNA00206
alias name:
non-protein coding RNA 206
entrez id:
25859
ensembl gene id:
ENSG00000152931
ucsc gene id:
uc003jsg.3
refseq accession:
NR_024617
hgnc_id:
HGNC:17263
approved reserved:
2009-09-28

基因染色体位置

基因染色体位置

5q12.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

基因是携带遗传信息的DNA片段，通过编码蛋白质或RNA分子发挥生物学功能。基因表达产物（如蛋白质或功能性RNA）参与细胞结构构建、代谢调控、信号传导等关键生命活动。其作用位点包括细胞核（如转录因子）、细胞膜（如受体蛋白）、或胞内特定细胞器（如线粒体酶）。基因突变可能导致功能丧失（loss-of-function）、功能获得（gain-of-function）或表达量改变，进而引发疾病——例如抑癌基因TP53突变与癌症相关，CFTR基因突变导致囊性纤维化。若基因过表达可能打破细胞稳态（如原癌基因MYC过表达促进肿瘤），而表达不足可能导致代谢缺陷（如胰岛素分泌不足引发糖尿病）。许多基因属于进化相关的家族，如HOX基因家族（调控胚胎发育的转录因子家族），其成员具有保守的DNA结合结构域且呈簇状排列。基因家族共性包括：序列相似性、功能冗余性或协同性，以及常通过基因复制进化产生新功能。特定基因的异常表达还可能通过调控网络影响下游基因（如NF-κB过度激活会促发炎症因子级联反应）。术语解释：转录因子（调控基因开关的蛋白质）、功能冗余（多个基因执行相似功能以保障生物稳健性）、基因簇（染色体上相邻的多个功能相关基因）。若涉及术语翻译争议会标注英文，例如"敲除knock-out"。

This gene is induced by androgen in prostate adenocarcinoma cells. Multiple alternatively transcript variants have been described for this gene, none of which are predicted to encode a protein product. [provided by RefSeq, Sep 2009]

该基因是由前列腺腺癌细胞诱导雄激素。多种备选的转录变体已为这种基因，其中没有一个被预测为编码蛋白质产物所述。 [由RefSeq的，2009年09月提供]

OMIM数据库中对PART1基因的介绍     Wikipedia数据库中对PART1基因的介绍

基因序列

基因序列

PART1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PART1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs26948       rs26949       rs26950       rs26953       rs26954       rs26955       rs26956       rs27221       rs27564       rs27565       rs27653       rs27960       rs35381       rs35382       rs35383       rs35384       rs35385      

基因表达

基因表达

PART1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
CATATAGTCACCGAAGGCAG
58
ACCCTTTCACTATGAAGGACC
59
TTTACCCGTCCAGTTCTGG
59
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
ACGTCTTCTCAGTCCTCAG
58
CCTTTCACTATGAAGGACCC
57
AATTTACCCGTCCAGTTCTG
57
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
ATATAGTCACCGAAGGCAGC
59
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
CGTCTTCTCAGTCCTCAGG
59
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
GTCTTCTCAGTCCTCAGGC
59
CCCTTTCACTATGAAGGACC
57
ATTTACCCGTCCAGTTCTG
57
CTTGGCAATCTCAGCTGTG
59
TATAGTCACCGAAGGCAGC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PART1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PART1基因的本体（GO）信息：

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PART1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
HIV Infections 0.001357209 5 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.001085767 4 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.001085767 4 0 BeFree
Diabetes Mellitus 0.000814326 3 0 BeFree
Cerebrovascular accident 0.000814326 3 0 BeFree
Dermatitis, Atopic 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Acute leukemia 0.000542884 2 0 BeFree
Mitochondrial Myopathies 0.000542884 2 0 BeFree
Lymphoma 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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