PBXIP1 (PBX homeobox interacting protein 1)

symbol:
PBXIP1
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
alias symbol:
HPIP
alias name:
None
entrez id:
57326
ensembl gene id:
ENSG00000163346
ucsc gene id:
uc001ffr.4
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NM_020524
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HGNC:21199
approved reserved:
2003-05-28
1q21.3
基因染色体位置图

PBXIP1(Pre-B-cell leukemia transcription factor interacting protein 1)是一种与转录调控相关的基因,属于PBX互作蛋白家族。它编码的蛋白质主要通过与PBX(Pre-B-cell leukemia homeobox)家族转录因子相互作用,参与基因表达的调控。PBXIP1在多种组织中表达,尤其在胚胎发育和细胞分化过程中发挥重要作用。该蛋白通过与PBX蛋白结合,影响HOX基因的表达,从而调控发育过程。PBXIP1的主要作用位点包括细胞核,它在核内与其他转录因子形成复合物,共同调节下游靶基因的转录。PBXIP1的突变可能导致其与PBX蛋白的结合能力下降,进而影响HOX基因的调控,可能引发发育异常或疾病。研究表明,PBXIP1的异常表达与某些癌症(如白血病和乳腺癌)的发生发展相关。当PBXIP1过表达时,可能增强PBX介导的转录激活,促进细胞增殖,甚至导致肿瘤发生;而降低表达则可能影响正常发育过程或细胞分化。PBXIP1属于PBX互作蛋白家族,该家族的成员通常具有与PBX转录因子结合的能力,并参与调控发育相关基因的表达。家族成员的共性包括含有保守的蛋白相互作用结构域,能够与PBX蛋白形成复合物,共同调节HOX基因及其他发育相关基因的表达。PBXIP1及其家族成员在胚胎发育、器官形成和细胞命运决定中扮演重要角色,其功能异常可能导致发育缺陷或疾病。

None

PBXIP1基因的碱基序列:[NCBI]
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PBXIP1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs8454       rs9236       rs10533       rs705094       rs906594       rs1218593       rs2061690       rs2102423       rs2271201       rs2335409       rs3738026       rs3738027       rs3766919       rs6695407       rs11429731       rs12064595       rs12239625      

PBXIP1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CCATGGATGGAGAAGGGAC
60
AAACATCACCTTCCAGGGT
59
GAGGAGACTGAGGTCAAGG
59
TGGACTACTGTGTCTCCTG
58
CCATGGATGGAGAAGGGAC
60
AACATCACCTTCCAGGGTG
60
GAGGAGACTGAGGTCAAGG
59
GGACTACTGTGTCTCCTGG
59
GAGGAGACTGAGGTCAAGG
59
CTGATCCAAGCTGCTTTGG
59
GAGGAGACTGAGGTCAAGG
59
GACTACTGTGTCTCCTGGG
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
CTCF
PBXIP1
Unknown
CTCF
PBXIP1
Unknown
GATA1
PBXIP1
Unknown
GATA1
PBXIP1
Unknown

PBXIP1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PBXIP1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003714
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q96AQ6 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS
GO:0005829
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS
GO:0005874
Q96AQ6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS
GO:0030154
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS
GO:0045892
Q96AQ6 (UniProtKB)
NAS

可能调控 PBXIP1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Ductal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Ductal Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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