PCDH11Y (protocadherin 11 Y-linked)

symbol:
PCDH11Y
locus group:
protein-coding gene
location:
Yp11.2
gene_family:
Non-clustered protocadherins
alias symbol:
PCDHY
alias name:
None
entrez id:
83259
ensembl gene id:
ENSG00000099715
ucsc gene id:
uc004fqo.5
refseq accession:
NM_032973
hgnc_id:
HGNC:15813
approved reserved:
2001-06-15
Yp11.2
基因染色体位置图

PCDH11Y(Protocadherin 11 Y-linked)是位于人类Y染色体上的原钙粘蛋白家族成员之一,属于原钙粘蛋白基因家族(Protocadherin family)。该家族以钙依赖性细胞粘附分子为特征,主要参与神经系统的发育、突触形成及细胞间信号传递。PCDH11Y与其X染色体同源基因PCDH11X在进化中经历分化,可能与人类大脑功能进化相关。PCDH11Y编码的蛋白质具有典型的原钙粘蛋白结构域,通过介导细胞间相互作用影响神经回路构建和认知功能。研究表明,PCDH11Y基因突变或缺失可能与神经发育障碍、精神分裂症和阿尔茨海默病等神经系统疾病风险增加相关。该基因在男性特异性表达,其异常表达可能破坏神经细胞粘附平衡,导致突触可塑性异常。当PCDH11Y过表达时,可能干扰正常神经细胞迁移和轴突导向;而表达降低则可能影响神经元间连接稳定性。值得注意的是,PCDH11Y与PCDH11X共同构成人类特有的基因对,二者在剂量平衡上的改变被认为与人类大脑左右半球功能不对称性(脑偏侧化)的演化有关。原钙粘蛋白家族的共性在于它们都含有多个细胞外钙粘蛋白重复序列,通过同源或异源相互作用参与组织形态发生和细胞识别。目前针对PCDH11Y的研究仍在深入,其在性别差异相关的神经系统疾病中的作用机制是重点探索方向。专业术语解释:原钙粘蛋白(protocadherin)是一类非经典钙粘蛋白,主要参与特定细胞间识别;突触可塑性(synaptic plasticity)指突触强度可调节的特性;脑偏侧化(brain lateralization)指大脑左右半球功能专门化现象。

This gene belongs to the protocadherin family, a subfamily of the cadherin superfamily. The encoded protein consists of an extracellular domain containing seven cadherin repeats, a transmembrane domain, and a cytoplasmic tail that differs from those of the classical cadherins. This gene is located on the Y chromosome in a block of X/Y homology and is very closely related to its paralog on the X chromosome. The protein is thought to play a role in cell-cell recognition during development of the central nervous system. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基因属于protocadherin家族,钙粘着蛋白超家族的亚家族。所编码的蛋白质是由含有7钙粘蛋白重复序列??,跨膜结构域,和从那些经典钙黏着蛋白的不同之处胞质尾的胞外域的。该基因位于X / Y同源的块中的Y染色体上,并很密切的关系的X染色体上的旁系同源。该蛋白被认为是中枢神经系统的发育过程中发挥在细胞 - 细胞识别的作用。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的,2013年7月提供]

PCDH11Y基因的碱基序列:[NCBI]
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PCDH11Y基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs781523293       rs781752707       rs781152552       rs781348315       rs780974994       rs781041572       rs780787247       rs780882132       rs780510634       rs780595508       rs780748380       rs780339860       rs780505673       rs780199773       rs780040928       rs780017505       rs779644175      

PCDH11Y基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTCATTCTACTCTAAAGGCATCG
59
TCCTTAGCGCATCCATCTC
59
TCCCTACAGCGTTTCTGAC
59
CTGGAATCAGTCGGTCTGG
59
AGTACTTTGATCGTGCTACAC
58
GTCCAGGTATGAAAGTAGATTCAG
58
TATTTCAAGTGTTGTGCGGG
59
ACACCACGCATACTAGCAG
59
GACGTAGGCATAAACGGAG
58
TTTCAATGACATCGAGGCC
58
TCATTCTACTCTAAAGGCATCG
57
TCCTTAGCGCATCCATCTC
59
TGACGTAGGCATAAACGGA
58
TTCAATGACATCGAGGCCA
59
GAGTACTTTGATCGTGCTACAC
59
TCCAGGTATGAAAGTAGATTCAGG
59
CTACAGCGTTTCTGACTGTG
59
CCTGGAATCAGTCGGTCTG
59
ATTTCAAGTGTTGTGCGGG
59
AACACCACGCATACTAGCA
59
      尚未收录相关数据

PCDH11Y基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCDH11Y基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
A0A087WUC5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9BZA8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9BZA8 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q9BZA8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q9BZA8 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PCDH11Y基因的相关microRNA:     

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Prostatic Neoplasms 0.12272435 2 0 CTD_human_LHGDN
Psychotic Disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Schizoaffective Disorder 0.000271442 1 0 BeFree
Mental disorders 0.000271442 1 0 BeFree
Nonorganic psychosis 0.000271442 1 0 BeFree
Autistic Disorder 0.000271442 1 0 BeFree

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