PCDH18 (protocadherin 18)

symbol:
PCDH18
locus group:
protein-coding gene
location:
4q28.3
gene_family:
Non-clustered protocadherins
alias symbol:
KIAA1562|PCDH68L
alias name:
None
entrez id:
54510
ensembl gene id:
ENSG00000189184
ucsc gene id:
uc003ihe.5
refseq accession:
NM_019035
hgnc_id:
HGNC:14268
approved reserved:
2000-12-19
4q28.3
基因染色体位置图

PCDH18(Protocadherin 18,原钙黏蛋白18)属于原钙黏蛋白基因家族(Protocadherin family),这是一类在细胞间黏附和信号传导中起关键作用的跨膜蛋白。该家族成员具有钙离子依赖性黏附特性,其结构包含多个细胞外钙黏蛋白重复域(EC domains,负责细胞间相互作用)、跨膜区(嵌入细胞膜)和胞内尾部(参与细胞内信号传递)。PCDH18主要在神经系统(如大脑皮层、海马体等)中表达,参与神经元迁移、突触形成及神经回路建立等发育过程,对大脑功能(如认知、记忆)至关重要。其突变可能导致神经发育异常,如自闭症谱系障碍(ASD)和智力障碍,部分研究还发现它与某些癌症(如胶质瘤)的转移相关。若PCDH18过表达,可能破坏细胞间正常黏附,促进肿瘤细胞侵袭;而表达降低则可能影响神经元连接,导致神经功能障碍。该基因家族(Protocadherins)的共性包括:通过同源或异源相互作用介导细胞识别,调控组织形态发生和神经系统特异性连接。专业术语解释:钙黏蛋白重复域(EC domains)是蛋白质中依赖钙离子维持结构的区域,介导细胞黏附;跨膜区(transmembrane domain)指穿过细胞膜的部分;胞内尾部(cytoplasmic tail)位于细胞内,可结合下游信号分子。目前中文术语"原钙黏蛋白"(Protocadherin)为直译,尚无更优替代。

This gene belongs to the protocadherin gene family, a subfamily of the cadherin superfamily. This gene encodes a protein which contains 6 extracellular cadherin domains, a transmembrane domain and a cytoplasmic tail differing from those of the classical cadherins. Although its specific function is undetermined, the cadherin-related neuronal receptor is thought to play a role in the establishment and function of specific cell-cell connections in the brain. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因属于protocadherin基因家族,钙粘着蛋白超家族的亚家族。该基因编码含有6细胞外钙粘蛋白结构域,跨膜结构域和胞质尾不同于经典钙黏着蛋白的不同的蛋白质。虽然其具体功能是未定,钙黏着蛋白相关的神经元受体认为在大脑中的特定细胞 - 细胞连接的建立和功能的作用。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PCDH18基因的碱基序列:[NCBI]
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PCDH18基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1135219       rs1135220       rs7436190       rs7440183       rs7440743       rs9286351       rs9330353       rs9330354       rs9684994       rs9715105       rs10004843       rs10006580       rs10010962       rs10018837       rs10020997       rs10049822       rs11541660      

PCDH18基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TCTTTCAATGCTTCACCAGG
58
AGGGCATATCTGTAGCTCC
58
TTTCAATGCTTCACCAGGG
58
AAGGGCATATCTGTAGCTCC
59
TTTCAATGCTTCACCAGGG
58
AGGGCATATCTGTAGCTCC
58
      尚未收录相关数据

PCDH18基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCDH18基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0007155
A0A087WTW3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
A0A087WTW3 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
B4DLR6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
B4DLR6 (UniProtKB)
IEA
GO:0007155
B4DQ29 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
B4DQ29 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
D6RIG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
D6RIG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
D6RIG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
D6RIG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
D6RIG4 (UniProtKB)
IEA
GO:0005509
Q9HCL0 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
Q9HCL0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007156
Q9HCL0 (UniProtKB)
IEA
GO:0007420
Q9HCL0 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
Q9HCL0 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PCDH18基因的相关microRNA:     

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.002367032 1 1 GAD
Lupus Erythematosus, Systemic 0.002367032 1 1 GAD
Osteoporosis 0.002367032 1 1 GAD

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