PCED1B (PC-esterase domain containing 1B)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PCED1B
locus group:
protein-coding gene
location:
12q13.11
gene_family:
alias symbol:
MGC16044
alias name:
None
entrez id:
91523
ensembl gene id:
ENSG00000179715
ucsc gene id:
uc021qxi.3
refseq accession:
NM_138371
hgnc_id:
HGNC:28255
approved reserved:
2006-02-10

基因染色体位置

基因染色体位置

12q13.11
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PCED1B（前列腺和结肠表达蛋白1B）属于PCED1基因家族，该家族成员主要在前列腺和结肠组织中高表达，具有组织特异性。PCED1B编码的蛋白质功能尚未完全明确，但研究表明它可能参与细胞黏附、信号传导或细胞间相互作用等过程。该基因家族成员的共性是它们在特定上皮组织中表达，可能与上皮细胞的功能维持或分化有关。PCED1B的突变或表达异常可能影响其正常功能，但目前与特定疾病的直接关联尚不明确。过表达PCED1B可能干扰细胞间的正常通讯或黏附，导致组织功能紊乱；而表达降低则可能影响上皮组织的完整性或屏障功能。由于研究有限，PCED1B在疾病中的具体作用机制仍需进一步探索。该基因与其他家族成员如PCED1A可能有功能冗余或协同作用，共同维持上皮组织的稳态。

This gene encodes a protein that belongs to the GDSL/SGNH-like acyl-esterase family. Members of this family are hydrolases thought to function in modification of biopolymers on the cell surface. Alternate splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jul 2013]

这个基因编码属于该GDSL / SGNH状酰基酯酶家族的蛋白质。这个家族的成员被认为在细胞表面上的生物聚合物的改性发挥作用水解酶。在多个备选的转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2013年7月提供]

OMIM数据库中对PCED1B基因的介绍     Wikipedia数据库中对PCED1B基因的介绍

基因序列

基因序列

PCED1B基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PCED1B基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs854890       rs854891       rs2106928       rs2269828       rs2898002       rs12301925       rs12320642       rs12812969       rs34333961       rs35667451       rs73284480       rs74083838       rs74083841       rs74703828       rs76292907       rs77380695       rs77621437      

基因表达

基因表达

PCED1B基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GAAGCTTTACGCCTAAGGAG
59
TTATTGTGAAGCAGCTGCC
59
TTTAATGACCATCCGCAGAG
58
CTTATTGTGAAGCAGCTGC
57
CTTTACGCCTAAGGAGCCA
60
ACTTATTGTGAAGCAGCTGC
59
ACGAGATCTAGAATCAACTGAG
57
ATACCTGGAGATGTCCCAG
58
GAAGCTTTACGCCTAAGGAG
59
TTATTGTGAAGCAGCTGCC
59
CTACAAATATCCATCCGCAGAG
59
TTATTGTGAAGCAGCTGCC
59
AACCATCTTGAAAGAGCTGC
59
CATACCTGGAGATGTCCCAG
59
CTAAGGAGAAGAGGAAACTGGT
59
CAGACAAAGAAGCCAGACG
59
GCAGGCTGAAGGTAATGAG
58
TTATTGTGAAGCAGCTGCC
59
AACCATCTTGAAAGAGCTGC
59
CATACCTGGAGATGTCCCA
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PCED1B基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PCED1B基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96HM7 (UniProtKB)
IPI

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PCED1B基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Alzheimer's Disease 0.002367032 1 1 GAD

基因相关服务

基因相关服务

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