PDCD1 (programmed cell death 1)

symbol:
PDCD1
locus group:
protein-coding gene
location:
2q37.3
gene_family:
CD molecules|V-set domain containing
alias symbol:
CD279|PD1|hSLE1|PD-1
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None
entrez id:
5133
ensembl gene id:
ENSG00000188389
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uc002wcq.5
refseq accession:
NM_005018
hgnc_id:
HGNC:8760
approved reserved:
1994-05-24
2q37.3
基因染色体位置图

PDCD1(Programmed Cell Death 1)是一种重要的免疫调节基因,编码PD-1蛋白,属于免疫检查点分子,主要表达于活化的T细胞、B细胞和自然杀伤细胞(NK细胞)表面。PD-1与其配体PD-L1和PD-L2结合后,传递抑制性信号,下调T细胞活性,防止免疫系统过度激活,从而维持免疫耐受并避免自身免疫反应。PDCD1在肿瘤微环境中常被肿瘤细胞利用,通过高表达PD-L1逃避免疫监视,导致T细胞功能耗竭,促进肿瘤进展。PDCD1基因突变可能影响其功能,导致自身免疫疾病(如系统性红斑狼疮、类风湿关节炎)或免疫缺陷。PD-1抑制剂(如纳武利尤单抗、帕博利珠单抗)通过阻断PD-1/PD-L1通路,恢复T细胞抗肿瘤活性,已成为多种癌症(如黑色素瘤、非小细胞肺癌)的重要治疗手段。PDCD1过表达会过度抑制免疫反应,可能引发慢性感染或肿瘤免疫逃逸;而表达降低可能导致自身免疫疾病或炎症过度。PDCD1属于CD28基因家族,该家族成员(如CTLA-4、ICOS)均具有免疫调节功能,通过共刺激或抑制信号调控T细胞应答。这一家族在维持免疫平衡中起核心作用,其异常与癌症、自身免疫病及感染性疾病密切相关。

This gene encodes a cell surface membrane protein of the immunoglobulin superfamily. This protein is expressed in pro-B-cells and is thought to play a role in their differentiation. In mice, expression of this gene is induced in the thymus when anti-CD3 antibodies are injected and large numbers of thymocytes undergo apoptosis. Mice deficient for this gene bred on a BALB/c background developed dilated cardiomyopathy and died from congestive heart failure. These studies suggest that this gene product may also be important in T cell function and contribute to the prevention of autoimmune diseases. [provided by RefSeq, Jul 2008]

该基因编码的免疫球蛋白超家族的细胞表面的膜蛋白。此蛋白质在原B细胞上表达,并且被认为在它们的分化中发挥作用。在小鼠中,该基因的表达在胸腺被诱导时抗CD3抗体注射和大量的胸腺细胞凋亡。缺陷的小鼠此基因繁殖上的BALB / c背景开发扩张型心肌病,以及充血性心脏衰竭死亡。这些研究表明,该基因产物还可以是在T细胞的功能是重要的,并有助于预防自身免疫性疾病。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

PDCD1基因的碱基序列:[NCBI]
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PDCD1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs2227981       rs2227981       rs2227982       rs2227982       rs4973695       rs4973695       rs5839829       rs5839829       rs6605258       rs6605258       rs6705653       rs6705653       rs6710479       rs6710479       rs6747063       rs6747063       rs6747318      

PDCD1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGTGACAGGGACAATAGGA
58
TAGTCCACAGAGAACACAGG
58
CAGGATGGTTCTTAGACTCCC
59
GATGTGTTGGAGAAGCTGC
59
AGGATGGTTCTTAGACTCCC
58
CGATGTGTTGGAGAAGCTG
58
GGTGACAGGGACAATAGGAG
59
AGTCCACAGAGAACACAGG
59
GGTGACAGGGACAATAGGA
58
AGTCCACAGAGAACACAGG
59
AGGATGGTTCTTAGACTCCC
58
GATGTGTTGGAGAAGCTGC
59
      尚未收录相关数据

PDCD1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PDCD1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002644
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0004871
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q15116 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q15116 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0006915
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0006959
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0007165
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0009897
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0031295
Q15116 (UniProtKB)
TAS
GO:0043066
Q15116 (UniProtKB)
IEA
GO:0070234
Q15116 (UniProtKB)
IDA

可能调控 PDCD1基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Lupus Erythematosus, Systemic 0.180080714 37 2 BeFree_CTD_human_GAD_LHGDN
Multiple Sclerosis 0.122909916 3 0 BeFree_CTD_human_GAD
melanoma 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Colorectal Neoplasms 0.08 1 0 RGD
Anti-Glomerular Basement Membrane Disease 0.08 1 0 RGD
SYSTEMIC LUPUS ERYTHEMATOSUS, SUSCEPTIBILITY TO, 2 (disorder) 0.08 0 0 MGD
Lupus Erythematosus 0.022117613 12 0 BeFree_GAD
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.016916611 11 0 BeFree_GAD
Infection 0.016346101 6 0 LHGDN
Rheumatoid Arthritis 0.015449781 12 1 BeFree_GAD_LHGDN

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