PEF1 (penta-EF-hand domain containing 1)

symbol:
PEF1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p35.2
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
PEF1A
alias name:
peflin
entrez id:
553115
ensembl gene id:
ENSG00000162517
ucsc gene id:
uc001bth.3
refseq accession:
NM_012392
hgnc_id:
HGNC:30009
approved reserved:
2005-05-09
1p35.2
基因染色体位置图

PEF1(也称为 Penta-EF-hand protein 1)属于 PEF 基因家族,该家族的特征是含有五个 EF-hand 钙离子结合结构域,这些结构域通常参与钙信号传导和蛋白质相互作用。PEF1 在多种组织中表达,尤其在脑、心脏和骨骼肌中较为丰富。它的主要功能包括调节细胞凋亡、细胞周期进程以及参与神经系统的发育和功能。PEF1 通过与钙离子结合并与其他蛋白质相互作用来发挥其生物学作用,例如与 ALG-2(凋亡相关基因 2 蛋白)结合,参与内质网应激反应和细胞凋亡调控。PEF1 的突变可能导致其功能异常,进而影响细胞凋亡和钙信号传导,与某些神经退行性疾病和癌症的发生有关。研究表明,PEF1 的过表达可能抑制细胞凋亡,促进细胞存活,而降低表达则可能增加细胞对凋亡信号的敏感性,影响组织稳态。此外,PEF1 还参与调控其他基因的表达或功能,例如通过影响钙依赖性信号通路间接调节下游基因的活性。PEF 基因家族的成员通常具有保守的 EF-hand 结构域,并在钙离子介导的细胞过程中发挥重要作用,如细胞运动、分泌和信号转导。PEF1 作为该家族的一员,共享这些共性,但其具体功能和作用机制可能因组织或细胞类型而异。研究 PEF1 的功能和调控机制有助于深入理解其在生理和病理过程中的作用,并为相关疾病的治疗提供潜在靶点。

This gene encodes a calcium-binding protein belonging to the penta-EF-hand protein family. The encoded protein has been shown to form a heterodimer with the programmed cell death 6 gene product and may modulate its function in Ca(2+) signaling. Alternative splicing results in multiple transcript variants and a pseudogene has been identified on chromosome 1.[provided by RefSeq, May 2010]

该基因编码属于五EF手蛋白家族一个钙结合蛋白。所编码的蛋白质已显示形成与程序性细胞死亡6基因产物的异源二聚体,并且可以调节其对Ca(2+)的信令的功能。在多个抄本变形和假剪接结果已经确定1号染色体上[由RefSeq的,2010年5月提供]

PEF1基因的碱基序列:[NCBI]
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PEF1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs13352       rs1061770       rs1065370       rs10798879       rs10798880       rs10914458       rs10914459       rs12048369       rs12090352       rs35573576       rs74422721       rs77466344       rs77538969       rs112315257       rs112387640       rs115271200       rs116032812      

PEF1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACCTCCAAGTTCCTACGG
60
CAGGATCCACATTGGGAGG
60
TCAATGATGAGACCTGCCT
58
GAGAAGCCGTAGACATCGA
59
TGGAAGAACCTCTTCCAGC
59
ATTTGGGACAGAGCTTGCT
60
CACCTCCAAGTTCCTACGG
60
CAGGATCCACATTGGGAGG
60
GCAAGAATGCACAATGCCT
60
TCAGGATCCACATTGGGAG
59
TGGAAGAACCTCTTCCAGC
59
ATTTGGGACAGAGCTTGCT
60
CACCTCCAAGTTCCTACGG
60
CAGGATCCACATTGGGAGG
60
CATGAAGGAGCTAAAGCAGG
58
GTTTATCATCATGAGGCAGGT
58
TGGAAGAACCTCTTCCAGC
59
ATTTGGGACAGAGCTTGCT
60
CCTCCAAGTTCCTACGGTG
60
TCAGGATCCACATTGGGAG
59
      尚未收录相关数据

PEF1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PEF1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004198
Q9UBV8 (UniProtKB)
IBA
GO:0005509
Q9UBV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0005737
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006508
Q9UBV8 (UniProtKB)
IBA
GO:0016020
Q9UBV8 (UniProtKB)
IEA
GO:0044822
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0046982
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0046983
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0051592
Q9UBV8 (UniProtKB)
IPI
GO:0070062
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
Q9UBV8 (UniProtKB)
IDA

可能调控 PEF1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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