PGLYRP3 (peptidoglycan recognition protein 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PGLYRP3
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
alias symbol:
PGRPIA|PGLYRPIalpha|PGRP-Ialpha
alias name:
peptidoglycan recognition protein …
entrez id:
114771
ensembl gene id:
ENSG00000159527
ucsc gene id:
uc001fbn.1
refseq accession:
NM_052891
hgnc_id:
HGNC:30014
approved reserved:
2004-03-17

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PGLYRP3（肽聚糖识别蛋白3）是肽聚糖识别蛋白（PGLYRP）家族的一员，该家族还包括PGLYRP1、PGLYRP2和PGLYRP4。这些蛋白在先天免疫系统中发挥重要作用，主要通过识别细菌细胞壁的肽聚糖（PGN）来激活免疫反应。PGLYRP3主要在皮肤、眼睛、口腔和肠道等上皮组织中表达，其功能涉及抗菌防御和炎症调节。PGLYRP3能与细菌肽聚糖结合，触发免疫细胞的杀菌活性或调节炎症反应，从而保护宿主免受感染。此外，PGLYRP3可能通过抑制过度炎症反应来维持免疫平衡。PGLYRP家族的共性在于它们均含有保守的肽聚糖结合结构域，能够识别不同细菌的肽聚糖，但各成员的组织分布和具体功能存在差异。PGLYRP3的突变可能影响其抗菌或免疫调节功能，导致感染易感性增加或炎症性疾病。研究表明，PGLYRP3的异常表达可能与某些炎症性皮肤病（如银屑病）或自身免疫疾病相关。PGLYRP3过表达可能增强抗菌能力，但也可能引发过度炎症反应；而降低表达可能导致免疫防御减弱，增加感染风险。此外，PGLYRP3与其他免疫分子（如Toll样受体）可能存在协同或拮抗作用，进一步调节免疫应答。总体而言，PGLYRP3在维持黏膜免疫稳态和防御病原体入侵中具有重要作用，其功能异常可能参与多种疾病的发病机制。

This gene encodes a peptidoglycan recognition protein, which belongs to the N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase 2 family. These proteins are part of the innate immune system and recognize peptidoglycan, a ubiquitous component of bacterial cell walls. This antimicrobial protein binds to murein peptidoglycans of Gram-positive bacteria. [provided by RefSeq, Oct 2014]

此基因编码一种肽聚糖识别蛋白，属于N-乙酰基-L-丙氨酸酰胺酶2家族。这些蛋白质是先天免疫系统的一部分，并识别肽聚糖，细菌细胞壁的普遍存在的组件。此抗微生物蛋白结合胞壁质革兰氏阳性菌的肽聚糖。 [由RefSeq的，2014年10月提供]

OMIM数据库中对PGLYRP3基因的介绍     Wikipedia数据库中对PGLYRP3基因的介绍

基因序列

基因序列

PGLYRP3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PGLYRP3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs821416       rs821417       rs821418       rs821419       rs821420       rs821421       rs821422       rs821423       rs821424       rs821425       rs821426       rs821427       rs821428       rs821429       rs821430       rs821431       rs843971      

基因表达

基因表达

PGLYRP3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTGGCAATAAGATAGGCAGC
58
CCTTCTGGATGGCATAGGA
59
CATTGGATATCACTTCCTGGT
58
TAAGTGTGAGAGCCTTGGA
58
GTGACATTGGATATCACTTCCTG
59
TGTGAGAGCCTTGGATGTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PGLYRP3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PGLYRP3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002221
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
Q96LB9 (UniProtKB)
NAS
GO:0008270
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0008745
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0009253
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0016019
Q96LB9 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q96LB9 (UniProtKB)
NAS
GO:0016045
Q96LB9 (UniProtKB)
IDA
GO:0032689
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0032827
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0042834
Q96LB9 (UniProtKB)
IDA
GO:0042834
Q96LB9 (UniProtKB)
IDA
GO:0044117
Q96LB9 (UniProtKB)
IEA
GO:0045087
Q96LB9 (UniProtKB)
NAS
GO:0050830
Q96LB9 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PGLYRP3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Dermatitis, Atopic 0.002367032 1 0 GAD
Parkinson Disease 0.000271442 1 10 BeFree
Infectious disease of lung 0.000271442 1 0 BeFree
EPIDERMAL DIFFERENTIATION COMPLEX 0.000271442 1 0 BeFree
Gastroenteritis 0.000271442 1 0 BeFree
Psoriasis 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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