PGLYRP4 (peptidoglycan recognition protein 4)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PGLYRP4
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
alias symbol:
SBBI67|PGRPIB|PGLYRPIbeta|PGRP-Ibeta
alias name:
peptidoglycan recognition protein …
entrez id:
57115
ensembl gene id:
ENSG00000163218
ucsc gene id:
uc001fbo.4
refseq accession:
NM_020393
hgnc_id:
HGNC:30015
approved reserved:
2004-03-17

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PGLYRP4（肽聚糖识别蛋白4）是肽聚糖识别蛋白（PGLYRP）家族的一员，该家族包括PGLYRP1、PGLYRP2、PGLYRP3和PGLYRP4。这些蛋白在先天免疫系统中发挥重要作用，能够识别并结合细菌细胞壁的肽聚糖（PGN），从而参与抗菌防御。PGLYRP家族成员通常具有保守的肽聚糖结合结构域，但它们在表达模式和功能上存在差异。PGLYRP4主要在皮肤、口腔、肠道等上皮组织中表达，其表达产物是一种分泌型蛋白，能够直接杀死某些细菌或通过激活免疫反应抑制病原体生长。PGLYRP4通过与细菌肽聚糖结合，破坏细胞壁完整性，导致细菌裂解。此外，它还可能调节炎症反应，避免过度免疫激活。PGLYRP4的突变可能影响其抗菌功能，导致对某些细菌感染的易感性增加。研究发现，PGLYRP4基因多态性与某些自身免疫性疾病（如银屑病）和炎症性肠病（IBD）的发病风险相关，可能因其免疫调节功能失衡所致。当PGLYRP4过表达时，可能增强抗菌活性，但也可能引发过度炎症反应；而降低表达则可能导致免疫防御减弱，增加感染风险。PGLYRP4与其他家族成员（如PGLYRP3）可形成异源二聚体，协同增强抗菌效果。该基因在维持黏膜屏障稳态和宿主-微生物平衡中具有关键作用，其功能异常可能影响微生物群落组成并促进慢性炎症性疾病的发展。

Summary: This gene encodes a peptidoglycan recognition protein, which belongs to the N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase 2 family. These proteins are part of the innate immune system and recognize peptidoglycan, a ubiquitous component of bacterial cell walls. This antimicrobial protein binds to murein peptidoglycans of Gram-positive bacteria. [provided by RefSeq, Oct 2014]

总结：该基因编码一个肽聚糖识别蛋白，属于N-乙酰基-L-丙氨酸酰胺酶2家族。这些蛋白质是先天免疫系统的一部分，并识别肽聚糖，细菌细胞壁的普遍存在的组件。此抗微生物蛋白结合胞壁质革兰氏阳性菌的肽聚糖。 [由RefSeq的，2014年10月提供]

OMIM数据库中对PGLYRP4基因的介绍     Wikipedia数据库中对PGLYRP4基因的介绍

基因序列

基因序列

PGLYRP4基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PGLYRP4基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs735012       rs821432       rs821433       rs821434       rs957195       rs1576291       rs1655308       rs1655309       rs1655310       rs1754132       rs1754133       rs1754134       rs1865234       rs1897695       rs2117130       rs2196080       rs2196081      

基因表达

基因表达

PGLYRP4基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AATATCCAAGGAGTGCACAC
58
GACTGTGGCCTTTCTTAGTG
59
CGTGGCTTCTTGTCTTCTC
59
TTTGTTCCAGGAGGAATCAC
58
TCTCCAGATTGGTGTCCTG
58
GTTCCAGGAGGAATCACCC
59
AATATCCAAGGAGTGCACAC
58
GACTGTGGCCTTTCTTAGTG
59
CTCCAGATTGGTGTCCTGG
59
GTTCCAGGAGGAATCACCC
59
GTGGCTTCTTGTCTTCTCTG
59
TTTGTTCCAGGAGGAATCAC
58
TTGGCACTAAGAAAGGCCA
60
CCTTCTGGACAGCATAGGT
59
TTGGCACTAAGAAAGGCCA
60
CCTTCTGGACAGCATAGGT
59
CGTGGCTTCTTGTCTTCTC
59
TTGTTCCAGGAGGAATCAC
57
CTTCACAGGTATACCACCCA
59
AGGTACCCTTTGACCATGG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PGLYRP4基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PGLYRP4基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0002221
Q96LB8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005576
Q96LB8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
Q96LB8 (UniProtKB)
NAS
GO:0008270
Q96LB8 (UniProtKB)
IEA
GO:0008745
Q96LB8 (UniProtKB)
IEA
GO:0009253
Q96LB8 (UniProtKB)
IEA
GO:0016019
Q96LB8 (UniProtKB)
IDA
GO:0016020
Q96LB8 (UniProtKB)
NAS
GO:0016045
Q96LB8 (UniProtKB)
IDA
GO:0042834
Q96LB8 (UniProtKB)
IDA
GO:0042834
Q96LB8 (UniProtKB)
IDA
GO:0045087
Q96LB8 (UniProtKB)
NAS
GO:0050830
Q96LB8 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PGLYRP4基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
EPIDERMAL DIFFERENTIATION COMPLEX 0.000271442 1 0 BeFree
Psoriasis 0.000271442 1 0 BeFree
Parkinson Disease 0.000271442 1 10 BeFree
Infectious disease of lung 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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