PIDD1 (p53-induced death domain protein 1)

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PIDD1
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protein-coding gene
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11p15.5
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HGNC:16491
approved reserved:
2001-09-04
11p15.5
基因染色体位置图

PIDD1(也称为LRDD或p53-induced protein with a death domain 1)是一个由TP53基因(即著名的抑癌基因p53)调控的基因,编码一种含有死亡结构域(death domain,一种介导蛋白质相互作用和细胞凋亡信号传递的结构)的蛋白质。PIDD1的主要功能与细胞应激反应相关,特别是在DNA损伤或细胞压力条件下被激活,参与调控细胞凋亡(程序性细胞死亡)或细胞存活。它通过形成多蛋白复合物发挥作用,例如与RIPK1和Caspase-2结合形成PIDDosome复合物,从而激活Caspase-2并触发凋亡。PIDD1的表达水平受p53直接调控,是p53下游靶基因之一。突变或异常表达可能影响其功能,例如某些突变可能导致PIDD1无法正常形成复合物,从而削弱细胞凋亡能力,与肿瘤发生或化疗耐药性相关。研究发现PIDD1在多种癌症中表达异常,如神经母细胞瘤和结直肠癌,可能作为促癌或抑癌因子取决于上下文环境。过表达PIDD1可能增强细胞凋亡,但长期激活也可能导致组织损伤;而低表达可能减少凋亡,促进细胞异常增殖。PIDD1属于含有死亡结构域的蛋白质家族(death domain-containing protein family),该家族成员通常参与凋亡、炎症和免疫反应的信号传导。这类蛋白质通过死亡结构域与其他分子相互作用,形成信号复合物。目前PIDD1的中文译名较统一,但需注意其别名如“LRDD”或“死亡结构域p53诱导蛋白1”可能在不同文献中出现。其功能复杂性体现在既可促凋亡,又在某些情况下通过NF-κB通路促进存活,这种双重角色使其在癌症和神经退行性疾病研究中备受关注。

The protein encoded by this gene contains a leucine-rich repeat and a death domain. This protein has been shown to interact with other death domain proteins, such as Fas (TNFRSF6)-associated via death domain (FADD) and MAP-kinase activating death domain-containing protein (MADD), and thus may function as an adaptor protein in cell death-related signaling processes. The expression of the mouse counterpart of this gene has been found to be positively regulated by the tumor suppressor p53 and to induce cell apoptosis in response to DNA damage, which suggests a role for this gene as an effector of p53-dependent apoptosis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Aug 2010]

由该基因编码的蛋白质中含有富含亮氨酸重复和死亡域。这种蛋白已经显示出与其它死亡结构域的蛋白质,如中Fas(TNFRSF6)通过死亡结构域(FADD)相关和MAP激酶活化死亡结构域的蛋白(MADD)相互作用,并且因此可以作为一个适配器蛋白质发挥功能细胞死亡相关的信令进程。该基因的小鼠对应物的表达已经发现由肿瘤抑制基因p53被正调控,并诱导细胞凋亡响应于DNA损伤,这表明对于该基因作为p53依赖性细胞凋亡的效应的作用。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的,2010年8月提供]

PIDD1基因的碱基序列:[NCBI]
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PIDD1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs11820580       rs12277141       rs28649421       rs59801538       rs61740097       rs113279451       rs113383631       rs114489794       rs137894394       rs138629595       rs139695620       rs140655529       rs141616633       rs141645334       rs142372869       rs143338496       rs144262676      

PIDD1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTCAGTGGCTTTGTCAGAG
58
CAGAGCAGCTGTTTCAGAC
59
GATGACATCACAGCTCAGGT
60
GTACCAGAGCCAGTACCAG
59
GGGCAGAATCTGCTTTGTC
59
CACGGTAGAAGGACACCTC
60
GAATTCTTGCGTCTGAGCA
59
AGATCGACCCTTTGAGGAC
59
GATGACATCACAGCTCAGG
58
GTACCAGAGCCAGTACCTG
59
GAATTCTTGCGTCTGAGCA
59
AGATCGACCCTTTGAGGAC
59
GACCTACCTGGAGGAAGAG
58
AAGGAACCAGGAGAAGTGG
59
GATGACATCACAGCTCAGGT
60
GTACCAGAGCCAGTACCAG
59
ACCTGAAGAATGTGAAGGAGG
60
CACGGTAGAAGGACACCTG
60
TTGACTCCTTGGTGGTTCC
60
CAAGACTCCGTCTCACTGAG
60
      尚未收录相关数据

PIDD1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PIDD1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0006915
H0YE55 (UniProtKB)
IEA
GO:0006974
H0YE55 (UniProtKB)
IEA
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Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
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Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
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IPI
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IPI
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Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
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Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
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Q9HB75 (UniProtKB)
IPI
GO:0005634
Q9HB75 (UniProtKB)
IMP
GO:0005654
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005737
Q9HB75 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9HB75 (UniProtKB)
IMP
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Q9HB75 (UniProtKB)
IDA
GO:0005829
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0006919
Q9HB75 (UniProtKB)
IEA
GO:0006974
Q9HB75 (UniProtKB)
IDA
GO:0006977
Q9HB75 (UniProtKB)
IMP
GO:0007165
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0042981
Q9HB75 (UniProtKB)
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GO:0043065
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:0043066
Q9HB75 (UniProtKB)
IMP
GO:0051092
Q9HB75 (UniProtKB)
TAS
GO:1902043
Q9HB75 (UniProtKB)
IEA

可能调控 PIDD1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Renal Cell Carcinoma 0.12 1 0 CTD_human
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Cessation of life 0.00272435 1 0 LHGDN
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree
Neutropenia 0.000271442 1 0 BeFree
Leukopenia 0.000271442 1 0 BeFree

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