PLXNB3 (plexin B3)

symbol:
PLXNB3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq28
gene_family:
Plexins
alias symbol:
PLEXR|PLEXB3
alias name:
None
entrez id:
5365
ensembl gene id:
ENSG00000198753
ucsc gene id:
uc004fii.3
refseq accession:
NM_001163257
hgnc_id:
HGNC:9105
approved reserved:
1998-08-13
Xq28
基因染色体位置图

PLXNB3(Plexin B3)是一种属于plexin基因家族的跨膜蛋白,主要参与细胞信号传导和细胞间通讯。plexin家族成员通常作为神经导向分子(如semaphorins)的受体,在神经发育、免疫调节和血管生成等过程中发挥关键作用。PLXNB3与其配体结合后,通过激活下游信号通路(如Rho GTPases)调控细胞骨架重组、细胞迁移和轴突导向。该基因在神经系统、免疫系统和某些肿瘤组织中表达较高。PLXNB3的功能突变可能导致信号传导异常,与神经发育障碍、精神分裂症和某些癌症(如胶质瘤和乳腺癌)的发生有关。PLXNB3过表达可能促进肿瘤细胞的侵袭和转移,而表达降低则可能影响神经元的正常发育和突触可塑性。plexin基因家族的共性包括:均含有保守的胞外semaphorin结合域和胞内GTP酶激活蛋白(GAP)样结构域,能够介导多种细胞反应,如细胞迁移、粘附和形态变化。PLXNB3与其他家族成员(如PLXNA1-4、PLXNB1-2)在结构和功能上具有相似性,但各自具有独特的表达模式和配体特异性。研究表明,PLXNB3可能通过与其他受体(如Met或ErbB2)的相互作用参与肿瘤微环境的调控。此外,PLXNB3在炎症反应和自身免疫疾病中也扮演一定角色,可能通过调节免疫细胞的迁移和活化影响疾病进程。

The protein encoded by this gene is a member of the plexin family. It functions as a receptor for semaphorin 5A, and plays a role in axon guidance, invasive growth and cell migration. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Sep 2009]

由该基因编码的蛋白质是丛蛋白家族的一个成员。它的功能作为用于脑信号5A的受体,并起着轴突导向,浸润性生长和细胞迁移的作用。已发现该基因编码不同亚型选择性剪接转录变异体。 [由RefSeq的,2009年09月提供]

PLXNB3基因的碱基序列:[NCBI]
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PLXNB3基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs782819171       rs782820984       rs782818597       rs782818317       rs782817781       rs782817526       rs782816847       rs782817411       rs782815623       rs782816607       rs782815431       rs782813211       rs782814781       rs782810434       rs782812513       rs782810051       rs782810416      

PLXNB3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTACTATGCGGACATTCGC
59
AGAAGTGTAGTTCCCGGAG
58
TATCGGACGAAGACTTGACC
59
CCATCTGGGACCTTGTAGTG
60
GTTATGAGGAGGACAGCCA
59
GACAGACAAAGTGACCTGG
58
GGAAATCTACCTCACCCGT
59
GTCGTCCACAAACTTCTGC
60
TATCGGACGAAGACTTGACC
59
CCATCTGGGACCTTGTAGTG
60
CTGACGGACATCATGAGGA
59
CACCATGGTCTCTGTCCTG
60
GTTATGAGGAGGACAGCCA
59
GACAGACAAAGTGACCTGG
58
TATCGGACGAAGACTTGACC
59
CCATCTGGGACCTTGTAGTG
59
GAACTACACTTCTGCTCCC
58
CCAGGGCACTGATAATCTG
58
GAAGACCAACAGTCTGCTG
59
GAGTCAATGAAGGTCTGGG
58
      尚未收录相关数据

PLXNB3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PLXNB3基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0017154
H7BZV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0071526
H7BZV5 (UniProtKB)
IEA
GO:0017154
H7C0P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0071526
H7C0P4 (UniProtKB)
IEA
GO:0017154
H7C3L0 (UniProtKB)
IEA
GO:0071526
H7C3L0 (UniProtKB)
IEA
GO:0001938
Q9ULL4 (UniProtKB)
IMP
GO:0002116
Q9ULL4 (UniProtKB)
IBA
GO:0005515
Q9ULL4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULL4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9ULL4 (UniProtKB)
IPI
GO:0005886
Q9ULL4 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9ULL4 (UniProtKB)
IBA
GO:0007162
Q9ULL4 (UniProtKB)
IDA
GO:0008360
Q9ULL4 (UniProtKB)
IBA
GO:0010593
Q9ULL4 (UniProtKB)
ISS
GO:0017154
Q9ULL4 (UniProtKB)
IDA
GO:0019904
Q9ULL4 (UniProtKB)
IPI
GO:0030336
Q9ULL4 (UniProtKB)
IMP
GO:0034260
Q9ULL4 (UniProtKB)
IMP
GO:0050772
Q9ULL4 (UniProtKB)
IBA
GO:0050918
Q9ULL4 (UniProtKB)
IDA
GO:0051022
Q9ULL4 (UniProtKB)
IEA
GO:0060326
Q9ULL4 (UniProtKB)
IDA
GO:0071526
Q9ULL4 (UniProtKB)
IDA
GO:1902287
Q9ULL4 (UniProtKB)
IBA

可能调控 PLXNB3基因的相关microRNA:     

Reactome

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Glioma 0.000542884 2 0 BeFree
Schizophrenia 0.000271442 1 0 BeFree

联系方式

山东省济南市章丘区文博路2号 齐鲁师范学院 genelibs生信实验室

山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话: 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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