PODXL2 (podocalyxin like 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PODXL2
locus group:
protein-coding gene
location:
3q21.3
gene_family:
alias symbol:
PODLX2|endoglycan
alias name:
endoglycan
entrez id:
50512
ensembl gene id:
ENSG00000114631
ucsc gene id:
uc003ejq.4
refseq accession:
NM_015720
hgnc_id:
HGNC:17936
approved reserved:
2004-07-21

基因染色体位置

基因染色体位置

3q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PODXL2（Podocalyxin Like 2）是一种跨膜糖蛋白，属于Podocalyxin基因家族，该家族还包括PODXL（Podocalyxin Like 1）等成员。这个家族的共性在于它们都含有高度保守的细胞外粘蛋白结构域、跨膜区和胞内尾部，主要参与细胞间粘附、细胞极性和迁移等生物学过程。PODXL2在多种组织中表达，尤其在肾脏、胎盘和某些上皮组织中表达较高。它的主要功能包括调节细胞间相互作用、维持细胞极性以及参与信号传导。PODXL2通过与细胞骨架蛋白相互作用，影响细胞的形态和运动能力。突变或异常表达可能导致细胞粘附功能受损，进而影响组织发育或功能。研究表明，PODXL2在某些癌症中过表达，如乳腺癌和结直肠癌，可能与肿瘤细胞的侵袭和转移有关。过表达PODXL2可能增强细胞的迁移能力，促进肿瘤进展，而降低表达则可能抑制肿瘤细胞的侵袭性。此外，PODXL2还参与免疫调节，可能影响炎症反应。在肾脏中，PODXL2对肾小球滤过屏障的维持有重要作用，其异常表达可能与肾脏疾病相关。PODXL2的调控机制尚不完全清楚，但已知其表达受多种转录因子和表观遗传修饰的影响。该基因的深入研究可能为癌症和肾脏疾病的治疗提供新的靶点。

This gene is a member of the CD34 family of cell surface transmembrane proteins, which are characterized by an N-terminal extracellular mucin domain, globular and stalk domains, a single pass transmembrane region, and a charged cytoplasmic tail. The encoded protein is a ligand for vascular selectins. [provided by RefSeq, Oct 2012]

此基因是CD34家族的细胞表面的跨膜蛋白，其特征在于N末端胞外粘蛋白结构域，球状和茎结构域，单个跨膜区，和一个带电胞质尾中的一员。所编码的蛋白质是血管选择素的配体。 [由RefSeq的，2012年10月提供]

OMIM数据库中对PODXL2基因的介绍     Wikipedia数据库中对PODXL2基因的介绍

基因序列

基因序列

PODXL2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PODXL2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs803324       rs813633       rs1056235       rs10049266       rs11538437       rs28743069       rs41266485       rs56406548       rs59698686       rs72967675       rs73201102       rs79420858       rs111275342       rs114192697       rs115820403       rs116624783       rs139795870      

基因表达

基因表达

PODXL2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGATCTCAACCAGCAGCTC
60
AGTCCTTGCAGATCACCTG
59
TTCTACGCAGGTGATCTGC
60
GTCTATGTTCTCTGTCATGTTCAG
59
AGCCACCACAGTACTTCTG
59
AAACATAATCTGCAGTGGGTC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PODXL2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PODXL2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q9NZ53 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZ53 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NZ53 (UniProtKB)
IPI
GO:0005539
Q9NZ53 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q9NZ53 (UniProtKB)
TAS
GO:0050901
Q9NZ53 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PODXL2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

联系方式

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

电话： 0531-88819269

E-mail: product@genelibs.com

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