PPP6C (protein phosphatase 6 catalytic subunit)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PPP6C
locus group:
protein-coding gene
location:
9q33.3
gene_family:
Protein phosphatases, catalytic subunits
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PP6
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None
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5537
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ENSG00000119414
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uc004bpg.5
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NM_016294
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HGNC:9323
approved reserved:
1996-12-19

基因染色体位置

基因染色体位置

9q33.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PPP6C是蛋白磷酸酶6的催化亚基，属于PPP（磷酸蛋白磷酸酶）基因家族中的一员。这个家族以丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶为特征，参与多种细胞过程的调控，如细胞周期、信号转导和应激反应。PPP6C通过去磷酸化作用调节多种底物蛋白，影响细胞增殖、分化和凋亡等关键生物学过程。PPP6C在多种组织中广泛表达，尤其在脑组织中表达较高，表明它可能在神经系统中发挥重要作用。PPP6C的突变或表达异常与多种疾病相关，包括癌症和神经退行性疾病。例如，在某些癌症中，PPP6C的突变可能导致其功能丧失，进而影响细胞周期调控，促进肿瘤的发生和发展。PPP6C的过表达可能干扰正常的信号转导途径，导致细胞增殖失控，而降低表达则可能影响细胞的正常分化和凋亡过程。此外，PPP6C还与其他基因或蛋白相互作用，如与Aurora激酶家族成员共同调控有丝分裂过程。PPP基因家族的成员通常具有保守的催化结构域，能够特异性地识别和去磷酸化不同的底物蛋白，从而在细胞信号网络中扮演重要角色。PPP6C作为该家族的一员，其功能异常可能对整个信号网络产生广泛影响，进而影响细胞和机体的稳态。

This gene encodes the catalytic subunit of protein phosphatase, a component of a signaling pathway regulating cell cycle progression. Splice variants encoding different protein isoforms exist. The pseudogene of this gene is located on chromosome X. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码的蛋白磷酸酶，信号传导途径调节细胞周期进程的一个组成部分的催化亚基。剪接变异体编码不同的蛋白质亚型存在。该基因的假位于[由RefSeq的，2008年7月提供] X染色体

OMIM数据库中对PPP6C基因的介绍     Wikipedia数据库中对PPP6C基因的介绍

基因序列

基因序列

PPP6C基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PPP6C基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2535       rs6744       rs165540       rs173391       rs359574       rs359575       rs359576       rs359577       rs360004       rs360005       rs360006       rs360007       rs360008       rs397583       rs458046       rs459311       rs459941      

基因表达

基因表达

PPP6C基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTAAAGGAGCGGCTATGTG
58
CTGTTACTGGTGTTGATACTGG
59
GTAGCAGCTTTAATAGATGAGC
57
GGTTCGAATTTGATCCAGTG
57
GTAGCAGCTTTAATAGATGAGCAG
60
TGGTTCGAATTTGATCCAGTG
59
GATATCCATGGACAGGGTG
57
GCCATTTAGCCTTTAATGCA
57
GGTCAAATGCGGCTATGTG
60
TGTCCATGGATATCTCCACAC
59
TCTAAAGGAGCGGCTATGTG
60
GTTACTGGTGTTGATACTGGC
59
GTAGCAGCTTTAATAGATGAGC
57
GGTTCGAATTTGATCCAGTG
57
GCCAAACCAAATATGGAAATGC
59
CATCTATTAAAGCTGCTACTGTGAG
59
AGATATCCATGGACAGGGTG
59
AGCCTTTAATGCAAGAAGGT
58
GGTCAAATGCGGCTATGTG
60
CACTGTTACTGGTGTTGATACTG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PPP6C基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PPP6C基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000082
O00743 (UniProtKB)
TAS
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O00743 (UniProtKB)
IEA
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IDA
GO:0004722
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TAS
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IPI
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IPI
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O00743 (UniProtKB)
IPI
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O00743 (UniProtKB)
IPI
GO:0005829
O00743 (UniProtKB)
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GO:0005829
O00743 (UniProtKB)
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GO:0006470
O00743 (UniProtKB)
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O00743 (UniProtKB)
IEA
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O00743 (UniProtKB)
TAS
GO:0004721
Q5T1S7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006470
Q5T1S7 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PPP6C基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
melanoma 0.121085767 5 0 BeFree_CTD_human
Liver carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinoma, Papillary 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of thyroid 0.000271442 1 0 BeFree
Celiac Disease 0.000271442 1 0 BeFree
Thyroid carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Metastatic melanoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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