PRKD3 (protein kinase D3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PRKD3
locus group:
protein-coding gene
location:
2p22.2
gene_family:
Pleckstrin homology domain containing
alias symbol:
EPK2
alias name:
None
entrez id:
23683
ensembl gene id:
ENSG00000115825
ucsc gene id:
uc002rqd.4
refseq accession:
NM_005813
hgnc_id:
HGNC:9408
approved reserved:
1998-10-23

基因染色体位置

基因染色体位置

2p22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PRKD3（蛋白激酶D3）属于蛋白激酶D（PKD）家族，该家族还包括PRKD1和PRKD2。PKD家族成员是丝氨酸/苏氨酸激酶，主要参与细胞信号传导，调控多种生物学过程，如细胞增殖、迁移、分化、分泌和凋亡。PRKD3在多种组织中表达，尤其在免疫系统、神经系统和内分泌系统中发挥重要作用。其表达产物通过磷酸化下游靶蛋白参与调控细胞应激反应、膜运输和基因表达。PRKD3的主要作用位点包括细胞质和细胞核，它可通过激活转录因子（如NF-κB）影响基因表达。突变或异常表达可能导致信号通路紊乱，与癌症（如乳腺癌、前列腺癌）、免疫疾病和神经退行性疾病相关。PRKD3过表达可能促进肿瘤细胞侵袭和转移，因其能增强基质金属蛋白酶（MMP）的活性，破坏细胞外基质；同时可能激活促生存信号通路，如AKT/mTOR。降低PRKD3表达则可能抑制肿瘤生长，但可能导致免疫细胞功能异常，影响炎症反应。PRKD3与PRKD1/2在调节细胞运动和分泌方面有功能重叠，但PRKD3在某些癌症中表现出独特作用，例如在前列腺癌中高表达与不良预后相关。此外，PRKD3还参与调节B细胞受体信号和胰岛素分泌，其功能异常可能与糖尿病和自身免疫疾病有关。该基因的调控涉及多种miRNA和表观遗传修饰，为潜在的治疗靶点。

This gene belongs to the multigene protein kinase D family of serine/threonine kinases, which bind diacylglycerol and phorbol esters. Members of this family are characterized by an N-terminal regulatory domain comprised of a tandem repeat of cysteine-rich zinc-finger motifs and a pleckstrin domain. The C-terminal region contains the catalytic domain and is distantly related to calcium-regulated kinases. Catalytic activity of this enzyme promotes its nuclear localization. This protein has been implicated in a variety of functions including negative regulation of human airway epithelial barrier formation, growth regulation of breast and prostate cancer cells, and vesicle trafficking. [provided by RefSeq, Jan 2015]

该基因属于多基因蛋白激酶家族?丝氨酸/苏氨酸激酶，它们结合甘油二酯和佛波醇酯的。这个家庭的成员由包括富含半胱氨酸的锌指结构的串联重复和PH结构域的N末端调节域为特征。 C-末端区包含催化域和是远亲钙调节激酶。这种酶的催化活性促进其核定位。这种蛋白已经牵涉于多种功能，包括人类呼吸道上皮屏障形成的负调节，乳腺癌和前列腺癌细胞的生长调节和囊泡运输。 [由RefSeq的，2015年1月提供]

OMIM数据库中对PRKD3基因的介绍     Wikipedia数据库中对PRKD3基因的介绍

基因序列

基因序列

PRKD3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PRKD3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs2192945       rs2241163       rs2302653       rs7570213       rs7570547       rs7573871       rs7583760       rs7584565       rs10202288       rs11370909       rs11689794       rs13015451       rs66896710       rs74828002       rs75341365       rs75359576       rs75736397      

基因表达

基因表达

PRKD3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CGTTTCATTTCCTCACTTTGC
59
GCTTTCTGACATATAGTTAGCCC
59
TTCAGGAGAATGTGGATATCAG
58
CATAAACGATGCCAAACTGG
58
CTGCTGTCAAGGATCTTGTG
59
CAAAGAATCCACACTCTGGA
58
TGAAATGTGAAGGCTGTGG
58
GTCTCTTTCTTACTCCACTACAG
58
AGGAGAATGTGGATATCAGTACTG
60
TCCATAAACGATGCCAAACTG
59
TTCATTTCCTCACTTTGCGT
59
GATGCTTTCTGACATATAGTTAGCC
60
TGCTGTCAAGGATCTTGTG
58
CCAAAGAATCCACACTCTGG
59
TATCTTTACCAGGACCCGG
58
GACATGTGACTCTTCACTGG
58
GTTTCATTTCCTCACTTTGCG
59
GCTTTCTGACATATAGTTAGCCC
59
GGAGAATGTGGATATCAGTACTG
58
CCATAAACGATGCCAAACTG
58

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PRKD3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PRKD3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004697
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0035556
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
C9JKP8 (UniProtKB)
IEA
GO:0004697
H0Y5M6 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
H0Y5M6 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
H0Y5M6 (UniProtKB)
IEA
GO:0004697
H7C172 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
H7C172 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
H7C172 (UniProtKB)
IEA
GO:0004697
O94806 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
O94806 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
O94806 (UniProtKB)
IEA
GO:0005654
O94806 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O94806 (UniProtKB)
IDA
GO:0006468
O94806 (UniProtKB)
IEA
GO:0007205
O94806 (UniProtKB)
TAS
GO:0016020
O94806 (UniProtKB)
IEA
GO:0016301
O94806 (UniProtKB)
IDA
GO:0035556
O94806 (UniProtKB)
IEA
GO:0046872
O94806 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PRKD3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Weight Gain 0.12 1 0 CTD_human
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Peripheral Neuropathy 0.12 1 0 CTD_human
Polycystic Kidney, Autosomal Dominant 0.001085767 4 0 BeFree
Malignant neoplasm of prostate 0.000542884 2 0 BeFree
Triple Negative Breast Neoplasms 0.000542884 2 0 BeFree
Prostate carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Idiopathic Pulmonary Fibrosis 0.000271442 1 0 BeFree
Xenograft Model 0.000271442 1 0 BeFree
melanoma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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