PROM1 (prominin 1)

symbol:
PROM1
locus group:
protein-coding gene
location:
4p15.32
gene_family:
CD molecules
alias symbol:
AC133|CD133|RP41|CORD12
alias name:
None
entrez id:
8842
ensembl gene id:
ENSG00000007062
ucsc gene id:
uc062vja.1
refseq accession:
NM_006017
hgnc_id:
HGNC:9454
approved reserved:
1999-04-15
4p15.32
基因染色体位置图

PROM1(Prominin 1)是一种编码跨膜糖蛋白的基因,属于Prominin基因家族。该家族成员通常具有五跨膜结构域,并在细胞膜上形成特定的拓扑结构,主要参与细胞膜微域(如纤毛、微绒毛)的形成和维持。PROM1在多种干细胞和祖细胞中高表达,尤其在视网膜光感受器细胞、神经干细胞和造血干细胞中发挥重要作用。其表达产物CD133(一种细胞表面标志物)常用于鉴定和分离干细胞或肿瘤干细胞。PROM1通过与胆固醇相互作用参与细胞膜形态的调控,并影响细胞迁移、极化和信号传导。突变可能导致其功能异常,例如某些错义突变与Stargardt病(一种遗传性视网膜退化疾病)相关,表现为视力逐渐丧失。此外,PROM1突变还与视网膜色素变性、黄斑变性和某些肾脏疾病有关。在癌症中,PROM1过表达常见于多种肿瘤(如胶质母细胞瘤、结肠癌和肝癌),可能与肿瘤干细胞特性、转移和耐药性相关。降低PROM1表达可能抑制肿瘤生长,但也会影响正常干细胞的维持。Prominin家族成员(如PROM2)在结构上相似,均参与细胞膜动力学和细胞-细胞相互作用。研究PROM1有助于理解干细胞生物学、视网膜疾病机制和肿瘤治疗靶点开发。

This gene encodes a pentaspan transmembrane glycoprotein. The protein localizes to membrane protrusions and is often expressed on adult stem cells, where it is thought to function in maintaining stem cell properties by suppressing differentiation. Mutations in this gene have been shown to result in retinitis pigmentosa and Stargardt disease. Expression of this gene is also associated with several types of cancer. This gene is expressed from at least five alternative promoters that are expressed in a tissue-dependent manner. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2009]

该基因编码一个pentaspan跨膜糖蛋白。该蛋白质定位于膜的突起和通常对成体干细胞,在那里它被认为在通过抑制分化维持干细胞特性的功能表达。在这种基因突变已显示导致色素性视网膜炎和斯塔加特病。该基因的表达也与几种类型的癌症相关联。此基因来自至少五个被以依赖于组织的方式表达的备选启动子表达。已发现该基因编码不同亚型的多个抄本变形。 [由RefSeq的,2009年03月提供]

PROM1基因的碱基序列:[NCBI]
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PROM1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs3130       rs317879       rs317880       rs317881       rs317882       rs317883       rs317884       rs317885       rs317886       rs317887       rs717176       rs725385       rs725386       rs740579       rs884227       rs884228       rs884718      

PROM1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTCTCTATGTGGTACAGCCG
59
AGATTACAGTTTCTGGCTTGTC
59
AAATGAAGAGACAGGGCCT
59
CCCTGGCTTATTTCTGTATCC
58
TTCTCTATGTGGTACAGCCG
59
AGATTACAGTTTCTGGCTTGTC
59
TAGCAGAAGCAGACAGACC
59
GTCATTCACTCAAGGCACC
59
AATTCAGTGCTAGGAGGCG
60
TTGGTCTCCTTGATCGCTG
60
TGTGTAGCTACATTATCGACCC
60
TGTTGTGATGGGTCATCGT
59
TATCTTTCTCTATGTGGTACAGCC
60
CTGCTTCATAGTAGACAATCTTGTC
60
AGGATTCTAGCTTCTCTGGA
57
CTCCCATACTTCTTAGTTTCCTC
58
CTTCTTTCCATCCACTGGG
58
GTCATTCACTCAAGGCACC
59
TTCTCTATGTGGTACAGCCG
59
AGATTACAGTTTCTGGCTTGTC
59
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
DNMT1
PROM1
Unknown
HOXB4
PROM1
Unknown
MYC
PROM1
Unknown
SP1
PROM1
Unknown
SRY
PROM1
Unknown

PROM1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PROM1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016021
D6RIF3 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y9D4 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
H0Y9Q5 (UniProtKB)
IEA
GO:0001750
O43490 (UniProtKB)
ISS
GO:0005515
O43490 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43490 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
O43490 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0005783
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0005793
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0005887
O43490 (UniProtKB)
TAS
GO:0009986
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0009986
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0010842
O43490 (UniProtKB)
ISS
GO:0016324
O43490 (UniProtKB)
IEA
GO:0031528
O43490 (UniProtKB)
IEA
GO:0031982
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0042622
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0042805
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0043231
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0045296
O43490 (UniProtKB)
IPI
GO:0045494
O43490 (UniProtKB)
IMP
GO:0060042
O43490 (UniProtKB)
IMP
GO:0060219
O43490 (UniProtKB)
ISS
GO:0060219
O43490 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
O43490 (UniProtKB)
IDA
GO:0072112
O43490 (UniProtKB)
IMP
GO:0072139
O43490 (UniProtKB)
IMP
GO:2000768
O43490 (UniProtKB)
IMP

可能调控 PROM1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Bull's eye macular dystrophy 0.48 1 1 CLINVAR_CTD_human_ORPHANET_UNIPROT
CONE-ROD DYSTROPHY 12 (disorder) 0.36 1 2 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
Stargardt disease 4 0.36 1 1 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
RETINITIS PIGMENTOSA 41 (disorder) 0.32 0 3 CLINVAR_CTD_human_MGD
Glioblastoma 0.143645237 59 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Colonic Neoplasms 0.128987376 7 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.123267234 4 0 BeFree_CTD_human_LHGDN
Retinitis Pigmentosa 0.121357209 5 0 BeFree_ORPHANET
Uterine Neoplasms 0.12 1 0 CTD_human
Stargardt's disease 0.12 0 0 ORPHANET

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