PTP4A1 (protein tyrosine phosphatase 4A1)

symbol:
PTP4A1
locus group:
protein-coding gene
location:
6q12
gene_family:
Protein tyrosine phosphatases type IVA
alias symbol:
PTPCAAX1|PRL-1|PRL1
alias name:
phosphatase of regenerating liver 1
entrez id:
7803
ensembl gene id:
ENSG00000112245
ucsc gene id:
uc003pel.5
refseq accession:
NM_001385254
hgnc_id:
HGNC:9634
approved reserved:
1998-09-02
6q12
基因染色体位置图

PTP4A1(Protein Tyrosine Phosphatase 4A1)是一种蛋白酪氨酸磷酸酶,属于PTP4A基因家族(也称为PRL家族),该家族包括PTP4A1、PTP4A2和PTP4A3三个成员。这些基因的共同特点是编码小分子量的蛋白酪氨酸磷酸酶,具有保守的C端CAAX基序(可进行异戊二烯化修饰),参与细胞信号转导调控,尤其在细胞增殖、迁移和侵袭中发挥重要作用。PTP4A1通过去磷酸化靶蛋白调控多种信号通路,如MAPK、PI3K/AKT等,影响细胞生长和代谢。其主要作用位点包括细胞膜和细胞质,通过与Rho GTP酶等相互作用调节细胞骨架动态和运动能力。PTP4A1的突变或异常表达可能导致其磷酸酶活性改变,进而影响下游信号传导。例如,功能获得性突变可能增强促癌效应,而功能缺失突变可能抑制肿瘤进展。该基因与多种疾病相关,尤其是癌症(如乳腺癌、结肠癌、肝癌),其过表达通常促进肿瘤细胞增殖、转移和耐药性,而低表达可能抑制恶性表型。此外,PTP4A1还参与炎症和免疫调节,与自身免疫性疾病有关。在过表达情况下,PTP4A1可能通过激活致癌通路(如ERK或AKT)加速肿瘤发展,并上调MMPs等侵袭相关基因;而敲低表达则可能抑制这些效应,甚至诱导细胞凋亡。PTP4A家族成员的共性包括:分子量小(约20kDa)、C端脂修饰介导膜定位、保守的磷酸酶结构域,以及在肿瘤中普遍高表达的特性。该家族基因的异常常导致细胞迁移和转移能力增强,成为癌症治疗的潜在靶点。

This gene encodes a member of a small class of prenylated protein tyrosine phosphatases (PTPs), which contain a PTP domain and a characteristic C-terminal prenylation motif. The encoded protein is a cell signaling molecule that plays regulatory roles in a variety of cellular processes, including cell proliferation and migration. The protein may also be involved in cancer development and metastasis. This tyrosine phosphatase is a nuclear protein, but may associate with plasma membrane by means of its prenylation motif. Pseudogenes related to this gene are located on chromosomes 1, 2, 5, 7, 11 and X. [provided by RefSeq, Jun 2013]

这个基因编码的小的类异戊二烯蛋白酪氨酸磷酸酶(PTPs),其中包含一个PTP结构域和特性C-末端异戊二烯化基序中的一个成员。所编码的蛋白质是一种细胞信号分子,发挥调控作用的各种细胞过程,包括细胞增殖和迁移的。蛋白质还可以是参与癌症发展和转移。这酪氨酸磷酸酶是一种核蛋白质,但可与质膜由其异戊二烯化基序的装置相关联。与此相关的基因假位于,7,11和X染色体1 2,第5,[通过的RefSeq,2013年6月提供]

PTP4A1基因的碱基序列:[NCBI]
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PTP4A1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1879       rs976724       rs1062179       rs1062193       rs1062324       rs1125771       rs1201698       rs1618240       rs1681943       rs1744159       rs1744162       rs1744163       rs1967636       rs2075656       rs2734851       rs2734854       rs2734855      

PTP4A1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GCTCTACATCTACCCTTTCTCC
60
AACACCACAGAATTGCTGC
59
CATATTCCTCAATTCTGTGGTG
57
CACTGCCCTTCAGAAACTC
59
GGGTTCTGCTAGCAATTCTG
59
TGTGCCTGGCAGTAATCTC
60
CCATGTTCTTGATTGGCCT
58
AACAACCAGGTTCTTCACG
58
TCTACATCTACCCTTTCTCCC
58
GAACACCACAGAATTGCTG
57
CATATTCCTCAATTCTGTGGTG
57
CACTTGTCTGCATAGAGGTC
58
GGTTCTGCTAGCAATTCTGTG
60
TGTGCCTGGCAGTAATCTC
60
CCACAATAGTAAGAGTATGTGAAGC
60
AAAGGCCAATCAAGAACATGG
60
CCACAATAGTAAGAGTATGTGAAGC
60
AAGGCCAATCAAGAACATGG
59
CATATTCCTCAATTCTGTGGTG
57
CTTGTCTGCATAGAGGTCG
58
转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接(PubMed)
EGR1
PTP4A1
Unknown

PTP4A1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTP4A1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0016311
A0A0D9SGK2 (UniProtKB)
IEA
GO:0016791
A0A0D9SGK2 (UniProtKB)
IEA
GO:0004725
Q93096 (UniProtKB)
IBA
GO:0004725
Q93096 (UniProtKB)
NAS
GO:0005634
Q93096 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
Q93096 (UniProtKB)
IDA
GO:0005769
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0005783
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0005819
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0007049
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0007275
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0008138
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0009898
Q93096 (UniProtKB)
IDA
GO:0030335
Q93096 (UniProtKB)
IBA
GO:0035335
Q93096 (UniProtKB)
IEA
GO:0070062
Q93096 (UniProtKB)
IDA

可能调控 PTP4A1基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.007077352 7 0 BeFree_LHGDN
Adenocarcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
Squamous cell carcinoma 0.00272435 1 0 LHGDN
B-Cell Lymphomas 0.002367032 1 0 GAD
T-Cell Lymphoma 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of ovary 0.002367032 1 0 GAD
Malignant neoplasm of lung 0.000814326 3 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000814326 3 0 BeFree
Alcoholic Intoxication, Chronic 0.000542884 2 0 BeFree

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山东省济南市高新区舜华路750号大学科技园北区F座4单元2楼

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