PTP4A3 (protein tyrosine phosphatase 4A3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
PTP4A3
locus group:
protein-coding gene
location:
8q24.3
gene_family:
Protein tyrosine phosphatases type IVA
alias symbol:
PRL-3|PRL-R|PRL3
alias name:
phosphatase of regenerating liver 3
entrez id:
11156
ensembl gene id:
ENSG00000184489
ucsc gene id:
uc010mes.5
refseq accession:
NM_032611
hgnc_id:
HGNC:9636
approved reserved:
1999-09-09

基因染色体位置

基因染色体位置

8q24.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

PTP4A3（Protein Tyrosine Phosphatase Type IVA, Member 3），也称为PRL-3（Phosphatase of Regenerating Liver-3），属于PTP4A基因家族，该家族还包括PTP4A1和PTP4A2。这个家族的共性是其成员均为小分子蛋白酪氨酸磷酸酶（PTPs），具有保守的C端CAAX基序（可进行异戊二烯化修饰），从而定位到细胞膜或内体膜上，参与调控细胞信号转导。PTP4A3在多种组织中表达，尤其在肝脏再生过程中显著上调，但其在肿瘤发生和转移中的作用更为突出。PTP4A3通过去磷酸化底物蛋白调控细胞增殖、迁移和侵袭，其过表达与多种癌症（如结直肠癌、胃癌、乳腺癌和肝癌）的进展、转移和不良预后密切相关。突变或异常表达可能破坏其磷酸酶活性，导致下游信号通路（如PI3K/AKT、MAPK和STAT3）的持续激活，促进肿瘤细胞存活和转移。降低PTP4A3表达可通过抑制这些通路减少肿瘤侵袭性，而过表达则增强转移潜力。此外，PTP4A3还参与血管生成和免疫微环境调控，可能通过影响基质金属蛋白酶（MMPs）或整合素信号促进肿瘤微环境重塑。目前，PTP4A3被视为癌症治疗的潜在靶点，针对其活性或膜定位的小分子抑制剂正在研究中。

This gene encodes a member of the protein-tyrosine phosphatase family. Protein tyrosine phosphatases are cell signaling molecules that play regulatory roles in a variety of cellular processes. Studies of this class of protein tyrosine phosphatase in mice demonstrates that they are prenylated in vivo, suggesting their association with cell plasma membrane. The encoded protein may enhance cell proliferation, and overexpression of this gene has been implicated in tumor metastasis. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Jul 2013]

该基因编码的蛋白质 - 酪氨酸磷酸酶家族的一个成员。蛋白酪氨酸磷酸酶是细胞信号分子，在多种细胞过程中起调节作用。此类小鼠蛋白酪氨酸磷酸酶的研究表明，它们在体内异戊二烯化，这表明它们与细胞质膜关联。所编码的蛋白质可增强细胞的增殖，并且该基因的过表达已在肿瘤转移被牵连。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年7月提供]

OMIM数据库中对PTP4A3基因的介绍     Wikipedia数据库中对PTP4A3基因的介绍

基因序列

基因序列

PTP4A3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

PTP4A3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs6995766       rs6995766       rs7459696       rs7459696       rs7461810       rs7461810       rs7464176       rs7464176       rs7830943       rs7830943       rs12156167       rs12156167       rs12156359       rs12156359       rs12680354       rs12680354       rs13256290      

基因表达

基因表达

PTP4A3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TGAGCTACAAACACATGCG
59
CTCTCAATGAAGGTGCTGAG
58
GGTGAGCTACAAACACATGC
60
CTTCAGGTCCTCAATGAAGGT
60
GTGAGCTACAAACACATGC
57
CTTCAGGTCCTCAATGAAGG
58
TACAAACACATGCGCTTCC
59
GCTCTCAATGAAGGTGCTG
59
TACAAACACATGCGCTTCC
59
CTCTCAATGAAGGTGCTGAG
58
TGAGCTACAAACACATGCG
59
TCTTCAGGTCCTCAATGAAGG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

PTP4A3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTP4A3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004727
O75365 (UniProtKB)
TAS
GO:0005634
O75365 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
O75365 (UniProtKB)
IBA
GO:0005769
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0005886
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0007219
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0008138
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0043117
O75365 (UniProtKB)
IEA
GO:0043542
O75365 (UniProtKB)
IMP
GO:1900746
O75365 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 PTP4A3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Colonic Neoplasms 0.120542884 2 0 BeFree_CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.039991339 59 0 BeFree_LHGDN
Stomach Neoplasms 0.011440285 5 0 BeFree_LHGDN
Colorectal Neoplasms 0.008173051 3 0 LHGDN
Liver carcinoma 0.006263026 4 0 BeFree_LHGDN
Mammary Neoplasms 0.0054487 2 0 LHGDN
Stomach Carcinoma 0.004071628 15 0 BeFree
Malignant neoplasm of stomach 0.004071628 15 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.004071628 15 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.003800186 14 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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