PTPRN (protein tyrosine phosphatase receptor type N)

symbol:
PTPRN
locus group:
protein-coding gene
location:
2q35
gene_family:
Protein tyrosine phosphatases, receptor type
alias symbol:
IA-2|ICA512
alias name:
insulinoma-associated tyrosine-pho…
entrez id:
5798
ensembl gene id:
ENSG00000054356
ucsc gene id:
uc002vkz.3
refseq accession:
NM_001199763
hgnc_id:
HGNC:9676
approved reserved:
1995-02-17
2q35
基因染色体位置图

PTPRN(Protein Tyrosine Phosphatase Receptor Type N)是一种属于蛋白酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的基因,该家族的主要功能是通过去磷酸化调控细胞内的信号转导通路,从而影响细胞生长、分化、代谢和免疫反应等过程。PTPRN也被称为IA-2(Islet Antigen-2),最初因其在胰岛β细胞中的高表达而被发现,是1型糖尿病(T1D)的自身抗原之一。PTPRN编码的蛋白是一种跨膜受体型磷酸酶,主要定位于神经内分泌细胞的分泌颗粒膜上,参与调节胰岛素的分泌过程。PTPRN在胰腺、大脑和肾上腺等组织中表达较高,尤其在胰岛β细胞中发挥重要作用。PTPRN的功能与其磷酸酶活性密切相关,它通过去磷酸化下游靶蛋白调控胰岛素分泌颗粒的胞吐作用,从而影响血糖水平的稳态。PTPRN基因突变或表达异常可能导致胰岛素分泌功能障碍,与1型糖尿病的发病机制相关。研究发现,PTPRN的自身抗体是1型糖尿病的重要生物标志物,可用于疾病的早期预测和诊断。PTPRN过表达可能增强胰岛素分泌,但长期过表达可能导致β细胞功能紊乱或自身免疫反应加剧。相反,PTPRN表达降低会损害胰岛素分泌,导致血糖调控异常,甚至引发糖尿病。PTPRN属于PTP基因家族,该家族成员均含有保守的磷酸酶结构域,能够特异性去磷酸化酪氨酸残基,负调控酪氨酸激酶介导的信号通路。PTP家族在细胞增殖、分化和免疫调节中发挥关键作用,其成员异常与多种疾病如癌症、糖尿病和自身免疫疾病相关。PTPRN作为PTP家族的重要成员,其功能研究不仅有助于理解1型糖尿病的发病机制,也为开发新的治疗策略提供了潜在靶点。

The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP possesses an extracellular region, a single transmembrane region, and a single catalytic domain, and thus represents a receptor-type PTP. This PTP was found to be an autoantigen that is reactive with insulin-dependent diabetes mellitus (IDDM) patient sera, and thus may be a potential target of autoimmunity in diabetes mellitus. Alternate splicing results in multiple transcript variants.[provided by RefSeq, Dec 2010]

由该基因编码的蛋白质是蛋白质酪氨酸磷酸酶(PTP)家族的一个成员。的PTPs已知是信令调节多种细胞过程,包括细胞生长,分化,有丝分裂周期,和致癌性转化的分子。此PTP具有一个胞外区,一个跨膜区和一个催化结构域,并因此代表了受体型PTP。此PTP被发现是一种自身抗原是与胰岛素依赖型糖尿病(IDDM)患者血清反应性的,并且因此可能在糖尿病的自身免疫的一个潜在目标。选择性剪接结果在多个抄本变形。[由RefSeq的,2010年12月提供]

PTPRN基因的碱基序列:[NCBI]
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PTPRN基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs4674374       rs6436132       rs11887718       rs12621717       rs59726321       rs72955491       rs75297529       rs76884407       rs77242849       rs77891885       rs111853777       rs112728964       rs112910848       rs140623114       rs145433981       rs145546871       rs147159908      

PTPRN基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCAGTAGCAAAGGCAGG
59
CCTCAGGTACAGCTATTGG
57
CCACGGCTGTCTATTTGAC
59
CACTCACCCTGAATACAGAC
58
GTGAAGGAGATTGACATCGC
59
AAACTGGTCCTTAGAGCGG
59
AGTTCCACTTCCTCAGCTG
59
GCACTTGTTCACCTTCCTG
59
TTCTCTGTGAGTGGGTGTC
59
AACAAGCCATCCTGAATACAG
58
AAATCTTGCAGACAGGAGTG
58
CCTGGTACTCAAAGGTAGTG
57
ACAATGAGCAGAACCTGTC
58
TCGCAGAGATATTTACCTGCT
59
TATTCAGGATGGCTTGTTTGG
59
TTGTAAGCGTTGGAGAACTG
59
TATTCAGGATGGCTTGTTTGG
59
ATCACATACTGGGTGAGGTC
59
CTCTGTGAGTGGGTGTCTG
60
AAACAAGCCATCCTGAATACAG
59
      尚未收录相关数据

PTPRN基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

PTPRN基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004725
H7C0U9 (UniProtKB)
IEA
GO:0035335
H7C0U9 (UniProtKB)
IEA
GO:0000302
Q16849 (UniProtKB)
IDA
GO:0001553
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0016021
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0019221
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0030054
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0030073
Q16849 (UniProtKB)
IGI
GO:0030141
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0030507
Q16849 (UniProtKB)
IPI
GO:0030658
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0032868
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0035773
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0043025
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0043204
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0043627
Q16849 (UniProtKB)
IEA
GO:0043679
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0045202
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0051020
Q16849 (UniProtKB)
IEA
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IEA
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Q16849 (UniProtKB)
IGI
GO:0004725
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0008021
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0005768
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0005794
Q16849 (UniProtKB)
ISS
GO:0005886
Q16849 (UniProtKB)
ISS

可能调控 PTPRN基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Diabetes Mellitus, Insulin-Dependent 0.088153188 22 0 BeFree_LHGDN_RGD
Autoimmune Diseases 0.00272435 1 0 LHGDN
Diabetes 0.002171535 8 0 BeFree
Diabetes Mellitus 0.002171535 8 0 BeFree
insulinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Adrenoleukodystrophy 0.000271442 1 0 BeFree
early pregnancy 0.000271442 1 0 BeFree
Impaired glucose tolerance 0.000271442 1 0 BeFree
Prediabetes syndrome 0.000271442 1 0 BeFree
Addison Disease 0.000271442 1 0 BeFree

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