RAB25 (RAB25, member RAS oncogene family)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
RAB25
locus group:
protein-coding gene
location:
1q22
gene_family:
RAB, member RAS oncogene GTPases
alias symbol:
CATX-8
alias name:
None
entrez id:
57111
ensembl gene id:
ENSG00000132698
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uc001fnc.4
refseq accession:
NM_020387
hgnc_id:
HGNC:18238
approved reserved:
2002-02-18

基因染色体位置

基因染色体位置

1q22
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

RAB25属于RAS超家族中的RAB小G蛋白家族，该家族成员主要参与调控细胞内囊泡运输和膜转运过程。RAB25是一种小分子GTP酶，主要在极化上皮细胞中表达，如肠道、肾脏和乳腺组织。它的生物学功能集中在调控内体分选和蛋白质运输，特别是参与顶端回收途径，影响细胞极性维持和受体循环。RAB25通过与效应蛋白如RAB11-FIP2相互作用，促进含有生长因子受体的囊泡定向运输，从而参与细胞增殖和存活信号通路的调控。突变或异常表达会显著影响其功能，例如RAB25过表达常见于多种癌症（如卵巢癌、乳腺癌和结肠癌），它通过增强EGFR等生长因子受体的循环来促进肿瘤细胞存活、侵袭和化疗抵抗。相反，RAB25表达降低可能导致上皮细胞极性丧失和转运缺陷，与炎症性肠病等疾病相关。RAB基因家族的共性包括：依赖GTP/GDP结合状态切换来调控膜运输、具有保守的效应蛋白结合域，并通过C端异戊二烯化修饰锚定在膜上。RAB25的独特之处在于其组织特异性表达和对顶端运输的特化作用。研究表明，RAB25过表达会激活PI3K/AKT通路促进肿瘤进展，而敲除后可能影响紧密连接蛋白（如occludin）的定位，破坏上皮屏障功能。此外，RAB25与溶酶体相关膜蛋白（LAMP1）的互作还暗示其在自噬调控中的作用，这可能是其影响癌症代谢重编程的机制之一。

RAB proteins, such as RAB25, are members of the RAS superfamily of small GTPases that are involved in membrane trafficking. Members of the RAB11 subfamily, including RAB25, control the return of internalized membrane-associated moieties to the cell surface (Caswell et al., 2007 [PubMed 17925226]).[supplied by OMIM, Aug 2009]

RAB蛋白质，例如Rab25基因，是参与膜运输小GTP酶的RAS超家族的成员。的RAB11亚科的成员，包括Rab25基因，控制内化膜相关部分的与细胞表面的返回（Caswell等人，2007年[搜索PubMed 17925226]）。[由OMIM，2009年08月供给]

OMIM数据库中对RAB25基因的介绍     Wikipedia数据库中对RAB25基因的介绍

基因序列

基因序列

RAB25基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

RAB25基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1056666       rs2275073       rs2275074       rs2275075       rs4661145       rs11577398       rs12021890       rs12030567       rs12049195       rs34022829       rs34372695       rs35110585       rs35522492       rs61748951       rs61751627       rs61758743       rs61995861      

基因表达

基因表达

RAB25基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CTTTGTCTTCAAGGTGGTGC
60
ATCTGAGCCTTGACAGCAG
60
TGTCTTCAAGGGTACTATCGTG
60
CTCCACCACAGCATAGGTC
60
CTTTGTCTTCAAGGTGGTGC
60
ATCTGAGCCTTGACAGCAG
60
TGTCTTCAAGGGTACTATCGTG
60
CTCCACCACAGCATAGGTC
60
GACTGCTCTTCCTGGAGAC
60
TCGCAAAGATTTCTTTCAGGAC
60
GACTGCTCTTCCTGGAGAC
60
TCGCAAAGATTTCTTTCAGGAC
60
CTTTGTCTTCAAGGTGGTGC
60
ATCTGAGCCTTGACAGCAG
60
TCTTCAAGGGTACTATCGTGG
59
CTCCACCACAGCATAGGTC
60
TTGTCTTCAAGGTGGTGCT
60
GATCTGAGCCTTGACAGCA
60
CTCTTCCTGGAGACCTCAG
59
CCTTCGCAAAGATTTCTTTCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

RAB25基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RAB25基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005525
A0A0C4DGX5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005622
A0A0C4DGX5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
A0A0C4DGX5 (UniProtKB)
IEA
GO:0003382
P57735 (UniProtKB)
ISS
GO:0005515
P57735 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P57735 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P57735 (UniProtKB)
IPI
GO:0005525
P57735 (UniProtKB)
IEA
GO:0007264
P57735 (UniProtKB)
IEA
GO:0008284
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0010634
P57735 (UniProtKB)
IMP
GO:0015031
P57735 (UniProtKB)
IEA
GO:0016023
P57735 (UniProtKB)
IEA
GO:0031143
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0031260
P57735 (UniProtKB)
IEA
GO:0031268
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0031410
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0031410
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0031489
P57735 (UniProtKB)
IPI
GO:0060627
P57735 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
P57735 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P57735 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 RAB25基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Parkinson Disease 0.122367032 1 1 GAD_GWASCAT
ovarian neoplasm 0.00272435 1 0 LHGDN
Ovarian Carcinoma 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.001900093 7 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.001357209 5 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000814326 3 0 BeFree
Squamous cell carcinoma of the head and neck 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Colon Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Epithelial ovarian cancer 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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