REXO2 (RNA exonuclease 2)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
REXO2
locus group:
protein-coding gene
location:
11q23.2
gene_family:
Exonucleases
alias symbol:
DKFZP566E144|SFN|CGI-114
alias name:
None
entrez id:
25996
ensembl gene id:
ENSG00000076043
ucsc gene id:
uc058hnt.1
refseq accession:
NM_015523
hgnc_id:
HGNC:17851
approved reserved:
2005-08-19

基因染色体位置

基因染色体位置

11q23.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

REXO2（RNA exonuclease 2）是一种RNA外切酶，属于REXO基因家族的一员，该家族还包括REXO1和REXO4。REXO家族基因的共同特点是编码具有3'-5'外切酶活性的蛋白质，这些酶在RNA代谢过程中发挥重要作用，特别是参与RNA的加工和降解。REXO2的主要功能是参与核糖体RNA（rRNA）的成熟过程，通过修剪rRNA前体的3'端，确保rRNA的正确加工和功能完整性。此外，REXO2还可能在维持RNA稳定性和质量控制中发挥作用，防止异常RNA的积累。REXO2的作用位点主要在细胞核内，特别是在核仁区域，这是rRNA加工的主要场所。突变或功能异常可能导致rRNA加工缺陷，进而影响核糖体组装和蛋白质合成，最终对细胞生长和增殖产生负面影响。研究表明，REXO2的突变或表达异常可能与某些癌症和神经退行性疾病相关，因为异常的RNA代谢可能导致细胞功能紊乱或凋亡。如果REXO2过表达，可能会加速RNA的降解，导致某些重要RNA分子的不足，影响细胞的正常功能；而降低表达则可能导致RNA代谢异常，未加工的RNA积累，干扰细胞稳态。REXO2与其他RNA代谢相关基因（如EXOSC家族成员）可能存在功能上的协同或拮抗作用，共同维持RNA代谢网络的平衡。总的来说，REXO2在RNA加工和质量控制中扮演关键角色，其功能异常可能对细胞和机体健康产生广泛影响。

This gene encodes a 3'-to-5' exonuclease specific for small (primarily 5 nucleotides or less in length) single-stranded RNA and DNA oligomers. This protein may have a role in DNA repair, replication, and recombination, and in RNA processing and degradation. It may also be involved in resistance of human cells to UV-C-induced cell death through its role in the DNA repair process. [provided by RefSeq, Nov 2011]

这个基因编码（长度主要5个核苷酸或更少）具体为小3‘-至-5‘核酸外切酶的单链RNA和DNA低聚物。这种蛋白可能在DNA修复，复制和重组的作用，并在RNA加工和退化。它也可通过其在DNA修复过程中的作用涉及人类细胞的UV-C诱导的细胞死亡的抗性。 [由RefSeq的，2011年11月提供]

OMIM数据库中对REXO2基因的介绍     Wikipedia数据库中对REXO2基因的介绍

基因序列

基因序列

REXO2基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

REXO2基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs9619       rs476200       rs502254       rs505021       rs525173       rs540712       rs564513       rs566296       rs569915       rs577976       rs593558       rs622427       rs639797       rs654531       rs688101       rs2271716       rs2298770      

基因表达

基因表达

REXO2基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTGGACCTGGAGATGACAG
59
GTCCAGCAACTCATCTGGT
59
CATTGAGAAGGACCAGATTATTGAG
59
TCAGGTTAGGACCTTCAGC
58
GGCTCTTAGATGGAGGCAG
59
TCAAGTGCCCTAACCATACC
59
TAAAGAACTGTGCAGACGC
58
TTCACTAATGTCATCAAGTGCC
59
GTGGACCTGGAGATGACAG
59
GTTGAGATCAGAGTCAGTTATCAG
58
CATTGAGAAGGACCAGATTATTGAG
59
CAGGTTAGGACCTTCAGCC
59
GCTCTTAGATGGAGGCAGG
59
TCAAGTGCCCTAACCATACC
59
TTAAAGAACTGTGCAGACGC
59
TCACTAATGTCATCAAGTGCC
58
CTCTTAGATGGAGGCAGGC
59
TCAAGTGCCCTAACCATACC
59
GTGGACCTGGAGATGACAG
59
TGAGATCAGAGTCAGTTATCAGAC
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

REXO2基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

REXO2基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003676
F5GYG5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005730
F5GYG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
F5GYG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0005925
F5GYG5 (UniProtKB)
IDA
GO:0003676
F5H6P8 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
F5H784 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YF66 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YG37 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YG54 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
H0YGR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0003676
Q9BTR4 (UniProtKB)
IEA
GO:0000175
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IBA
GO:0003676
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005730
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005739
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IBA
GO:0005739
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0005758
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005759
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IEA
GO:0005925
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0006139
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0008408
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IDA
GO:0009117
Q9Y3B8 (UniProtKB)
TAS
GO:0090503
Q9Y3B8 (UniProtKB)
IEA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 REXO2基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Neoplasm Metastasis 0.000542884 2 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma in Situ 0.000271442 1 0 BeFree
Malignant neoplasm of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Cancer, Familial 0.000271442 1 0 BeFree
Adenocarcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pain 0.000271442 1 1 BeFree
Multiple Myeloma 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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