RNASEH2A (ribonuclease H2 subunit A)

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RNASEH2A
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protein-coding gene
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19p13.13
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RNASEHI|RNHIA|RNHL|AGS4
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None
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HGNC:18518
approved reserved:
2002-06-05
19p13.13
基因染色体位置图

RNASEH2A是核糖核酸酶H2复合体的一个亚基,属于RNASEH2基因家族。这个基因家族的主要功能是识别并降解RNA-DNA杂交体中的RNA链,在DNA复制、修复和转录过程中维持基因组稳定性。RNASEH2A编码的蛋白质与RNASEH2B和RNASEH2C共同形成具有活性的核糖核酸酶H2复合体。该基因在细胞核中表达,对清除R-loop(RNA-DNA杂交体和游离的单链DNA形成的三链结构)至关重要。RNASEH2A突变会导致Aicardi-Goutières综合征(AGS),这是一种罕见的遗传性自身炎症性疾病,表现为脑病、皮肤病变和干扰素信号通路异常激活。突变会损害酶活性,导致未降解的RNA-DNA杂交体积累,触发先天免疫反应。RNASEH2A过表达可能增强基因组稳定性,减少R-loop积累,但过度活跃可能干扰正常的转录过程。表达降低则会导致R-loop积累,增加DNA损伤和基因组不稳定性风险,可能促进癌症发展。该基因家族成员都具有水解RNA-DNA杂交体中RNA链的能力,但各亚基在复合体形成和功能发挥中具有不同作用。RNASEH2A在维持基因组稳定性和预防自身免疫反应中起关键作用。

The protein encoded by this gene is a component of the heterotrimeric type II ribonuclease H enzyme (RNAseH2). RNAseH2 is the major source of ribonuclease H activity in mammalian cells and endonucleolytically cleaves ribonucleotides. It is predicted to remove Okazaki fragment RNA primers during lagging strand DNA synthesis and to excise single ribonucleotides from DNA-DNA duplexes. Mutations in this gene cause Aicardi-Goutieres Syndrome (AGS), a an autosomal recessive neurological disorder characterized by progressive microcephaly and psychomotor retardation, intracranial calcifications, elevated levels of interferon-alpha and white blood cells in the cerebrospinal fluid.[provided by RefSeq, Aug 2009]

由该基因编码的蛋白质是异源的II型核糖核酸酶H酶(RNAseH2)的一个组件。 RNAseH2是核糖核酸酶H活性的哺乳动物细胞和endonucleolytically切割核糖核苷酸的主要来源。据预测滞后链DNA合成过程中,除去冈崎片段的RNA引物,切除的DNA-DNA双链单核苷酸。在该基因引起Aicardi-Goutieres综合症(AGS)的突变,其特征是进行性小脑和精神运动迟缓,颅内钙化一个常染色体隐性神经疾病,在脑脊液干扰素-α和白血细胞水平升高。[通过的RefSeq提供2009年08月]

RNASEH2A基因的碱基序列:[NCBI]
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RNASEH2A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1064144       rs1135005       rs1205171       rs8104763       rs8107906       rs10413408       rs10421102       rs10422248       rs10427027       rs12151144       rs34231866       rs34577345       rs34793895       rs35372151       rs35501398       rs36027230       rs73503441      

RNASEH2A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GTCTACGCCATCTGTTATTGTC
59
CAATAGGGTCTTTGAGTCTGC
59
GAAGAAATGGCAGTTCGTG
57
TTTGTCTTGGGATCATTGGG
58
GTCTACGCCATCTGTTATTGTC
59
CAATAGGGTCTTTGAGTCTGC
59
AAGACCCTATTGGAGAGCG
59
CAGGTTGTATTTGACCCGC
59
GAAGAAATGGCAGTTCGTG
57
TTTGTCTTGGGATCATTGGG
58
GTCTACGCCATCTGTTATTGTC
59
CAATAGGGTCTTTGAGTCTGC
59
CTACGCCATCTGTTATTGTCC
59
TCCAATAGGGTCTTTGAGTCTG
60
CGGAAGATGTTATATGGGAGGA
59
CTTCATTGAGGAAGTAGGATGTG
59
AGACCCTATTGGAGAGCGA
60
CAGGTTGTATTTGACCCGC
59
CTACGCCATCTGTTATTGTCC
59
TCCAATAGGGTCTTTGAGTCTG
60
      尚未收录相关数据

RNASEH2A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RNASEH2A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003723
O75792 (UniProtKB)
IEA
GO:0004523
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0004540
O75792 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0006260
O75792 (UniProtKB)
TAS
GO:0006298
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0006401
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0032299
O75792 (UniProtKB)
IDA
GO:0043137
O75792 (UniProtKB)
IBA
GO:0046872
O75792 (UniProtKB)
IEA
GO:0090502
O75792 (UniProtKB)
IEA

可能调控 RNASEH2A基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
AICARDI-GOUTIERES SYNDROME 4 0.36 2 12 CLINVAR_CTD_human_UNIPROT
AICARDI-GOUTIERES SYNDROME 0.120271442 1 0 BeFree_ORPHANET
Myeloid Leukemia, Chronic 0.000814326 3 0 BeFree
Ki-1+ Anaplastic Large Cell Lymphoma 0.000814326 3 0 BeFree
AICARDI-GOUTIERES SYNDROME 1 0.000814326 3 0 BeFree
Liver carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of testis 0.000271442 1 0 BeFree
Trisomy 0.000271442 1 0 BeFree
Hepatitis 0.000271442 1 0 BeFree
Breast Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree

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