ROR1 (receptor tyrosine kinase like orphan receptor 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
ROR1
locus group:
protein-coding gene
location:
1p31.3
gene_family:
Receptor Tyrosine Kinases|I-set domain containing
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None
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None
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4919
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ENSG00000185483
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uc001dbj.4
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NM_005012
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HGNC:10256
approved reserved:
2000-02-29

基因染色体位置

基因染色体位置

1p31.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

ROR1（Receptor Tyrosine Kinase Like Orphan Receptor 1）是一种属于ROR（Receptor Tyrosine Kinase Like Orphan Receptor）基因家族的受体酪氨酸激酶样孤儿受体。ROR家族包括ROR1和ROR2两个成员，它们具有相似的结构特征，如胞外免疫球蛋白样结构域、富含半胱氨酸的区域和胞内酪氨酸激酶样结构域，但缺乏激酶活性。ROR1在胚胎发育过程中发挥重要作用，参与调控细胞迁移、极化和骨骼发育等过程，但在成年组织中表达水平较低。ROR1通过与Wnt5a等配体结合激活非经典Wnt信号通路，影响细胞增殖、分化和存活。ROR1的突变或异常表达与多种疾病相关，如慢性淋巴细胞白血病（CLL）、套细胞淋巴瘤（MCL）和乳腺癌等恶性肿瘤，其过表达可促进肿瘤细胞存活、迁移和耐药性。降低ROR1表达可抑制肿瘤生长和转移，因此它成为潜在的癌症治疗靶点。此外，ROR1在B细胞发育和自身免疫疾病中也有一定作用。ROR家族成员的共性包括参与发育调控和信号转导，尤其在非经典Wnt通路中发挥作用。ROR1过表达可能激活下游信号分子如Dvl和Rac1，促进肿瘤进展；而敲低ROR1则可能抑制这些通路，减少肿瘤恶性行为。由于ROR1在正常组织中表达有限，针对它的治疗可能具有较好的特异性。

This gene encodes a receptor tyrosine kinase-like orphan receptor that modulates neurite growth in the central nervous system. The encoded protein is a glycosylated type I membrane protein that belongs to the ROR subfamily of cell surface receptors. It is a pseudokinase that lacks catalytic activity and may interact with the non-canonical Wnt signalling pathway. This gene is highly expressed during early embryonic development but expressed at very low levels in adult tissues. Increased expression of this gene is associated with B-cell chronic lymphocytic leukaemia. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Jun 2012]

这个基因编码，其调节神经突生长在中枢神经系统中的受体酪氨酸激酶样孤儿受体。所编码的蛋白质是糖基化的I型膜属于细胞表面受体的ROR亚科的蛋白质。这是缺乏的催化活性，并且可以与非经典Wnt信号传导途径发生相互作用的假性。这种基因是早期胚胎发育过程中高表达，但在成人组织非常低的水平表达。该基因的表达增加与B细胞慢性淋巴细胞性白血病相关联。在多个转录剪接变异体导致编码不同亚型。 [由RefSeq的，2012年6月提供]

OMIM数据库中对ROR1基因的介绍     Wikipedia数据库中对ROR1基因的介绍

基因序列

基因序列

ROR1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

ROR1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs856283       rs958835       rs1260813       rs1260814       rs1260815       rs1260816       rs1359179       rs1359180       rs3753839       rs3835566       rs11805189       rs12750735       rs35110436       rs57221327       rs71499307       rs74081030       rs74695341      

基因表达

基因表达

ROR1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
AGCCGGTACACAATGAGAG
60
TGACAGCTCTGTTTCTCCA
59
TATAAACCCAAGAGCAAGGC
58
TTTCCAAAGGCACACTCAC
59
GGTGGTTTCTTCCACTGGA
60
TCATACTCATCTGAGTATCCTGG
59
TATAAACCCAAGAGCAAGGC
58
TTTCCAAAGGCACACTCAC
59
AAATCAGATCACAGCTGCC
58
GAAGGAATGGCGAACTGAG
59
CCAAGAAACAGAGCTGTCAG
59
GGTCAGGTAAGAATCTTTGTTGAG
60
GAGGTGGTTTCTTCCACTG
58
ATACTCATCTGAGTATCCTGGAC
59
ATAAACCCAAGAGCAAGGC
58
TTTCCAAAGGCACACTCAC
59
CCGGTACACAATGAGAGGG
60
ACTGACAGCTCTGTTTCTCC
60
ATAAACCCAAGAGCAAGGC
58
TTTCCAAAGGCACACTCAC
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
STAT3
ROR1
Unknown
20686606

基因本体信息

ROR1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

ROR1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0004672
A0A0A0MTJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0005524
A0A0A0MTJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0006468
A0A0A0MTJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0007169
A0A0A0MTJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0A0MTJ5 (UniProtKB)
IEA
GO:0004714
Q01973 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q01973 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q01973 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q01973 (UniProtKB)
IPI
GO:0005524
Q01973 (UniProtKB)
IEA
GO:0005737
Q01973 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q01973 (UniProtKB)
TAS
GO:0005886
Q01973 (UniProtKB)
TAS
GO:0005887
Q01973 (UniProtKB)
TAS
GO:0007169
Q01973 (UniProtKB)
IEA
GO:0017147
Q01973 (UniProtKB)
IPI
GO:0018108
Q01973 (UniProtKB)
IEA
GO:0043235
Q01973 (UniProtKB)
IDA
GO:0060071
Q01973 (UniProtKB)
IEA
GO:1904929
Q01973 (UniProtKB)
TAS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 ROR1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Chronic Lymphocytic Leukemia 0.008977445 14 0 BeFree_LHGDN
Precursor Cell Lymphoblastic Leukemia Lymphoma 0.00408156 5 0 BeFree_LHGDN
Bipolar Disorder 0.002638474 2 0 BeFree_GAD
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD
Acute lymphocytic leukemia 0.001357209 5 0 BeFree
Precursor B-cell lymphoblastic leukemia 0.000814326 3 0 BeFree
Renal carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
melanoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000542884 2 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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