RPRD1A (regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A)

symbol:
RPRD1A
locus group:
protein-coding gene
location:
18q12.2
gene_family:
alias symbol:
P15RS|FLJ10656|HsT3101
alias name:
cyclin-dependent kinase 2B-inhibit…
entrez id:
55197
ensembl gene id:
ENSG00000141425
ucsc gene id:
uc002kzg.4
refseq accession:
NM_018170
hgnc_id:
HGNC:25560
approved reserved:
2008-07-28
18q12.2
基因染色体位置图

RPRD1A(Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A)是一种参与转录调控和RNA加工的基因,属于RPRD基因家族。该家族成员通常含有保守的RNA识别结构域(RRM),并参与转录延伸、RNA剪接和转录终止等过程。RPRD1A编码的蛋白质通过与RNA聚合酶II(Pol II)和其他转录因子相互作用,调控基因表达。它在细胞周期调控、DNA损伤修复和细胞分化中发挥重要作用。RPRD1A的主要作用位点包括细胞核,尤其是转录活跃区域。突变或异常表达可能导致转录失调,影响细胞增殖和基因组稳定性,与多种癌症(如乳腺癌、肺癌)和神经退行性疾病相关。RPRD1A过表达可能增强某些促癌基因的转录活性,促进肿瘤发生;而降低表达则可能导致转录异常,引发细胞周期阻滞或凋亡。此外,RPRD1A还参与调控其他基因的表达,如细胞周期相关基因(如CDK2、Cyclin D1)和DNA修复基因(如BRCA1)。RPRD基因家族的共性包括参与转录调控、RNA代谢以及与Pol II的相互作用,成员通常具有保守的RRM结构域,并在发育和疾病中发挥关键作用。

This gene encodes a cell-cycle and transcription regulatory protein. The encoded protein interacts with the cell cycle inhibitor cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B and may function as a negative regulator of G(1)/S phase progression. This protein also forms homo- and hetrodimers with the protein, regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, to form a scaffold that interacts with the C-terminal domain of RNA polymerase II subunit B1 and regulates several aspects of transcription. Alternate splicing results in multiple transcript variants. A pseudogene of this gene is found on chromosome 16. [provided by RefSeq, Dec 2014]

这个基因编码的细胞周期和转录调节蛋白。所编码的蛋白质与细胞周期抑制剂细胞??周期蛋白依赖性激酶4抑制物乙相互作用,并且可以为G(1)/ S期进展的负调节物起作用。这种蛋白也形成均聚物和hetrodimers与蛋白质,核前mRNA结构域的蛋白1B的调节,以形成与RNA聚合酶II亚基B1的C末端结构域相互作用并调节转录的若干方面的支架。选择性剪接结果在多个抄本变形。该基因的假基因是在[由RefSeq的,2014年12月提供] 16号染色体发现

RPRD1A基因的碱基序列:[NCBI]
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RPRD1A基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs1060324       rs1060326       rs4799407       rs4799835       rs7239009       rs73946754       rs77769140       rs78544189       rs112569323       rs116112987       rs137948973       rs142765380       rs144101833       rs149535282       rs150292421       rs181751729       rs186159260      

RPRD1A基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CATCAGAGGATAGCTTCTTTACCT
60
GCCTTTCTCCAGATTCTTTATCTG
60
AATTGGAAGAGTACAAGCGC
59
ATAAGTCTGGCAGGCTCTG
59
TTTATGAGTTCTGTCTCTGGC
58
ACTGTCCAAGAGATCTTGCT
59
AACTCACTCGAATGTTAGCAG
59
CTTGCGCTTGTACTCTTCC
59
AACTCACTCGAATGTTAGCAG
59
CTTGCGCTTGTACTCTTCC
59
CATCAGAGGATAGCTTCTTTACCT
59
GCCTTTCTCCAGATTCTTTATCTG
59
AGAAGCTGTCGGAGTTGAG
59
CAGAAACTCTTTCTTTCCGCA
59
AGATGGAGACAGTGCAGAG
59
CTCTGGGTATGGGTTCCAC
60
CAACTCACTCGAATGTTAGCA
59
GCCCATGTCCAATATTTCCA
58
CACCTCTCAATAGGAGAAAGCT
60
CCAAACAGAAACTCTTTCTTGC
59
      尚未收录相关数据

RPRD1A基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RPRD1A基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
Q96P16 (UniProtKB)
IPI
GO:0005654
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0005654
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0016591
Q96P16 (UniProtKB)
IDA
GO:0042795
Q96P16 (UniProtKB)
TAS
GO:0070940
Q96P16 (UniProtKB)
IMP

可能调控 RPRD1A基因的相关microRNA:     

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human

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