RRAGD (Ras related GTP binding D)

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RRAGD
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protein-coding gene
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6q15
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2003-07-07
6q15
基因染色体位置图

RRAGD(Ras-related GTP-binding protein D)属于RRAG基因家族,该家族成员(包括RRAGA、RRAGB、RRAGC和RRAGD)均为小GTP酶,参与调控mTORC1信号通路,在细胞生长、代谢和自噬中发挥核心作用。RRAGD编码的蛋白通过结合GTP或GDP在溶酶体膜上形成异源二聚体(通常与RRAGC配对),帮助mTORC1感知氨基酸水平并定位至溶酶体激活下游信号。其生物学功能主要体现在营养感应和能量代谢调控中,当细胞内氨基酸充足时,RRAGD-GTP与Ragulator复合物协作招募mTORC1至溶酶体,促进蛋白质合成并抑制自噬。该基因主要作用位点包括溶酶体膜和细胞质,其突变可能导致功能异常,如持续激活突变(如Q121L)会过度激活mTORC1通路,与肿瘤发生相关;而失活突变则可能引起代谢紊乱或自噬过度激活。RRAGD表达异常与多种疾病相关,过表达常见于肾癌、肝癌等恶性肿瘤,通过持续激活mTOR通路促进肿瘤细胞增殖;而表达降低可能影响发育(如小鼠模型中显示胚胎致死性)或导致肌肉萎缩等代谢疾病。在基因家族共性方面,RRAG成员均含有GTP结合结构域,通过构象变化传递氨基酸信号,但不同亚型具有组织特异性表达模式(如RRAGD在胎盘和睾丸高表达)和功能差异。该基因还与其他基因存在交互,如与SLC38A9协同感知溶酶体氨基酸,其表达水平变化可影响ULK1、TFEB等自噬相关基因的活性。

RRAGD is a monomeric guanine nucleotide-binding protein, or G protein. By binding GTP or GDP, small G proteins act as molecular switches in numerous cell processes and signaling pathways.[supplied by OMIM, Apr 2004]

RRAGD是单体鸟嘌呤核苷酸 - 结合蛋白或G蛋白。通过结合GTP或GDP,小G蛋白作为分子开关在许多细胞过程和信号通路。[由OMIM,2004年四月供应]

RRAGD基因的碱基序列:[NCBI]
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RRAGD基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs754606       rs754607       rs754608       rs854908       rs854919       rs854920       rs854921       rs854922       rs854923       rs854924       rs854925       rs1062108       rs1160882       rs1305041       rs1321821       rs1321822       rs1358852      

RRAGD基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
CACAGAGGAGGGAGTTCTG
59
CTTTCTGAATAGACGACTTGCC
60
CTGATAGTACTCCGGTGGA
58
CTCCATCTTCTTTGAGACCA
57
ACTCACAGGATGATTACATGG
58
CGAAGTTGATGTCAGTATTCAC
58
TGACCCTACATTTGACTATGAG
57
TCCATGTAATCATCCTGTGAG
57
TGACCCTACATTTGACTATGAG
57
TTCCATGTAATCATCCTGTGAG
58
TATGCAAACCTATGAGCTCTG
58
CTCCATCTTCTTTGAGACCA
57
CACAGAGGAGGGAGTTCTG
59
TTTCTGAATAGACGACTTGCC
59
TATGCAAACCTATGAGCTCTG
58
CTCCATCTTCTTTGAGACCA
57
TGCAAACCTATGAGCTCTG
57
CTCCATCTTCTTTGAGACCA
57
TGACCCTACATTTGACTATGAG
57
TCCATGTAATCATCCTGTGAG
57
      尚未收录相关数据

RRAGD基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RRAGD基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0003924
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
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Q9NQL2 (UniProtKB)
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
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Q9NQL2 (UniProtKB)
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Q9NQL2 (UniProtKB)
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
Q9NQL2 (UniProtKB)
IDA
GO:0005737
Q9NQL2 (UniProtKB)
IDA
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Q9NQL2 (UniProtKB)
IDA
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
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Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0005829
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0007050
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0009267
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
GO:0010506
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
GO:0016236
Q9NQL2 (UniProtKB)
TAS
GO:0032008
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
GO:0032008
Q9NQL2 (UniProtKB)
NAS
GO:0034448
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
GO:0034613
Q9NQL2 (UniProtKB)
ISS
GO:0046982
Q9NQL2 (UniProtKB)
IPI
GO:0071230
Q9NQL2 (UniProtKB)
ISS
GO:0071230
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA
GO:1990131
Q9NQL2 (UniProtKB)
IBA

可能调控 RRAGD基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Tobacco Use Disorder 0.002367032 1 0 GAD

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