RTL3 (retrotransposon Gag like 3)

symbol:
RTL3
locus group:
protein-coding gene
location:
Xq21.1
gene_family:
Zinc fingers, CCHC-type
alias symbol:
FLJ38865|Mar3|Mart3|ZHC5|SIRH9
alias name:
Sushi-Ichi retrotransposon homolog…
entrez id:
203430
ensembl gene id:
ENSG00000179300
ucsc gene id:
uc004edc.1
refseq accession:
NM_152694
hgnc_id:
HGNC:22997
approved reserved:
2003-08-14
Xq21.1
基因染色体位置图

RTL3(Retrotransposon Gag Like 3)属于逆转录转座子Gag样基因家族,该家族成员通常编码与逆转录病毒Gag蛋白相似的蛋白质,参与转座子或病毒样颗粒的形成。RTL3基因在人类和其他哺乳动物中保守存在,其功能尚未完全明确,但研究表明它可能在生殖系统发育、免疫调节及表观遗传调控中发挥作用。RTL3的表达产物可能参与RNA结合或核酸代谢,其作用位点可能与染色质或转座子元件相关。突变或异常表达可能影响生殖细胞发育或导致基因组不稳定性,与某些不孕症或癌症(如睾丸癌)的潜在关联正在研究中。若RTL3过表达,可能干扰正常转座子沉默机制,引发基因组异常重组或激活休眠转座子,进而影响邻近基因表达;而表达降低可能导致生殖细胞功能缺陷或免疫应答异常。该基因家族(Gag样家族)的共性包括编码具有衣壳或核酸结合域的结构蛋白,部分成员参与病毒防御或转座子调控。目前对RTL3的研究仍有限,其具体机制及疾病关联需进一步验证。

This gene is a member of a family of gag-related retrotransposon genes. These genes appear to have lost the ability to retrotranspose; however, their open reading frames have remained intact, which may indicate that these genes have acquired new functions in the cell. [provided by RefSeq, Nov 2009]

该基??因是一个家族的GAG相关座子基因的一个成员。这些基因似乎已经失去了retrotranspose的能力;然而,他们的开放阅读框架仍然完好,这可能表明,这些基因在细胞中已获得新的功能。 [由RefSeq的,2009年11月提供]

RTL3基因的碱基序列:[NCBI]
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RTL3基因的碱基突变:           仅显示部分snp

RTL3基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
      尚未收录相关数据

RTL3基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

RTL3基因的本体(GO)信息:

可能调控 RTL3基因的相关microRNA:     

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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