S100A10 (S100 calcium binding protein A10)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
S100A10
locus group:
protein-coding gene
location:
1q21.3
gene_family:
S100 calcium binding proteins
alias symbol:
P11|42C|CLP11
alias name:
annexin II tetramer (AIIt) p11 sub…
entrez id:
6281
ensembl gene id:
ENSG00000197747
ucsc gene id:
uc001ezl.4
refseq accession:
NM_002966
hgnc_id:
HGNC:10487
approved reserved:
1992-09-10

基因染色体位置

基因染色体位置

1q21.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

S100A10（也称为p11或钙粒蛋白A10）是一种属于S100蛋白家族的钙结合蛋白，该家族由约25个成员组成，其共同特点是含有EF手型结构域（一种能结合钙离子的特定蛋白结构），并通过钙离子依赖或非依赖的方式调控细胞功能。S100A10与其他家族成员不同，它因突变丧失了钙结合能力，但仍通过与配体蛋白（如膜联蛋白A2）形成异源四聚体复合物发挥作用，主要参与细胞膜运输、细胞骨架重组、炎症反应及信号转导等过程。其表达产物在神经元、巨噬细胞、内皮细胞等广泛分布，尤其在突触可塑性（神经元连接强度的调节能力）和抑郁症病理中起关键作用——S100A10低表达与抑郁行为相关，而过表达可增强5-HT1B血清素受体的膜定位，改善抑郁症状。该基因突变可能导致复合物形成障碍，影响胞吐作用（细胞释放物质的过程）和创伤修复，并与癌症转移（如促进肿瘤细胞侵袭）及心血管疾病（如血栓形成）相关。在过表达情况下，S100A10可能通过上调基质金属蛋白酶（MMP2/9）加剧肿瘤侵袭性，或通过稳定特定受体增强细胞迁移；而表达降低时则可能损害突触功能或削弱炎症反应。S100蛋白家族的共性包括：分子量较小（10-12kDa）、形成同/异源二聚体、依赖钙信号调节靶蛋白活性，并参与细胞增殖、分化及应激响应等广泛生理过程。目前中文术语"钙粒蛋白"（Calgranulin）存在争议，部分文献直译为S100蛋白。

The protein encoded by this gene is a member of the S100 family of proteins containing 2 EF-hand calcium-binding motifs. S100 proteins are localized in the cytoplasm and/or nucleus of a wide range of cells, and involved in the regulation of a number of cellular processes such as cell cycle progression and differentiation. S100 genes include at least 13 members which are located as a cluster on chromosome 1q21. This protein may function in exocytosis and endocytosis. [provided by RefSeq, Jul 2008]

由该基因编码的蛋白质是S100家族含有2 EF手钙结合基序的蛋白质的成员。 S100蛋白是局部在广泛的细胞的细胞质和/或细胞核，并参与了许多细胞过程的调控，如细胞周期进程和分化。 S100基因包括至少13名成员分别位于作为染色体1q21集群。这种蛋白质可能在胞外分泌和内吞作用。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对S100A10基因的介绍     Wikipedia数据库中对S100A10基因的介绍

基因序列

基因序列

S100A10基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

S100A10基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs1038745       rs1552607       rs1873311       rs2879129       rs2932588       rs3007705       rs3007706       rs3007708       rs3791153       rs3838479       rs4845720       rs11204922       rs11459749       rs11542015       rs12083193       rs12143837       rs16833741      

基因表达

基因表达

S100A10基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GGATAAAGGCTACTTAACAAAGGAG
60
CACCTCTCGAGAACTTCCA
59
GAGTGCTGAAGCCAATCAC
59
CTCTACACTGGTCCAGGTC
59
CCAAGAGGAAGCTTCAACG
59
CCTTTGTTAAGTAGCCTTTATCCC
60
GGACCTGAGAGTACTCATGG
59
CTCTACACTGGTCCAGGTC
59
ACACCTTACCGCTTCTGAC
60
TGATTATGGTGATTGGCTTCAG
59
ACACCTTACCGCTTCTGAC
60
ATTATGGTGATTGGCTTCAGC
59
GGACCTGAGAGTACTCATGG
59
TCCATGCCATCAACCAGAG
60
GATAAAGGCTACTTAACAAAGGAGG
60
CCACCTCTCGAGAACTTCC
60
GACCTGAGAGTACTCATGGA
58
TCTCTACACTGGTCCAGGT
59
CAAGAGGAAGCTTCAACGG
59
CCTTTGTTAAGTAGCCTTTATCCC
60

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
STAT1
S100A10
Activation
12645529

基因本体信息

S100A10基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

S100A10基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0001765
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0005509
P60903 (UniProtKB)
IEA
GO:0005515
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0005515
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0006900
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0019897
P60903 (UniProtKB)
IEA
GO:0042803
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0043547
P60903 (UniProtKB)
IMP
GO:0044325
P60903 (UniProtKB)
IPI
GO:0051099
P60903 (UniProtKB)
IEA
GO:0051290
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0051290
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0051496
P60903 (UniProtKB)
IMP
GO:0051894
P60903 (UniProtKB)
IMP
GO:0070062
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0070062
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0090002
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:1900026
P60903 (UniProtKB)
IMP
GO:0008289
P60903 (UniProtKB)
IDA
GO:0045121
P60903 (UniProtKB)
IDA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 S100A10基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Depressive disorder 0.202714419 11 0 BeFree_CTD_human_RGD
Medulloblastoma 0.120271442 1 0 BeFree_CTD_human
Leukemia, Myelocytic, Acute 0.12 1 0 CTD_human
Keloid 0.12 1 0 CTD_human
Major Depressive Disorder 0.005819831 4 0 BeFree_GAD
Inflammatory Bowel Diseases 0.00272435 1 0 LHGDN
Carcinoma, Papillary 0.00272435 1 0 LHGDN
Mental Depression 0.002442977 9 0 BeFree
Dermatitis, Atopic 0.002367032 1 0 GAD
Unipolar Depression 0.001085767 4 0 BeFree

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基因相关服务

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