SCARA3 (scavenger receptor class A member 3)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCARA3
locus group:
protein-coding gene
location:
8p21.1
gene_family:
alias symbol:
CSR1|CSR|MSLR1|APC7|MSRL1
alias name:
macrophage scavenger receptor-like…
entrez id:
51435
ensembl gene id:
ENSG00000168077
ucsc gene id:
uc003xga.2
refseq accession:
NM_016240
hgnc_id:
HGNC:19000
approved reserved:
2002-09-06

基因染色体位置

基因染色体位置

8p21.1
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCARA3（Scavenger Receptor Class A Member 3）属于清道夫受体A类（SR-A）基因家族，该家族成员主要参与先天免疫反应，通过识别并结合多种配体（如修饰的低密度脂蛋白、细菌脂多糖和凋亡细胞等）在宿主防御和炎症调控中发挥重要作用。SCARA3作为该家族的一员，具有典型的SR-A结构特征，包括胶原蛋白样结构域和C端清道夫受体半胱氨酸富集域（SRCR），但其配体偏好和功能与其他成员（如SR-A1/SCARA1和MARCO/SCARA2）有所不同。SCARA3的生物学功能主要集中在氧化应激防御和DNA损伤修复中，其表达产物通过结合并内化氧化修饰的分子（如8-氧代鸟嘌呤），保护细胞免受活性氧（ROS）引起的基因突变。该基因在多种组织中表达，尤其在睾丸、肺和免疫细胞中活性较高，提示其可能参与生殖系统保护、肺屏障防御及免疫调节。SCARA3的突变可能导致其氧化应激防御能力下降，与癌症（如前列腺癌、肺癌）风险增加相关，研究发现其表达降低会加剧DNA氧化损伤并促进肿瘤发生。相反，过表达SCARA3可增强细胞对氧化应激的抵抗，减少化疗引起的DNA损伤，但可能干扰某些依赖ROS的生理过程（如免疫细胞杀菌功能）。该基因与p53通路存在交互，在DNA损伤时被p53诱导表达，形成正反馈保护环路。SCARA3还参与病毒防御，例如抑制HPV病毒复制，其表达水平变化可能影响病毒感染进程。在基因家族层面，SR-A成员均具有多配体结合特性，但SCARA3的独特之处在于其更专注于氧化损伤相关分子的清除而非病原体直接识别。研究提示SCARA3表达失调可能与慢性炎症性疾病、神经退行性变及衰老过程相关，但其在疾病中的具体机制仍需进一步探索。

This gene encodes a macrophage scavenger receptor-like protein. This protein has been shown to deplete reactive oxygen species, and thus play an important role in protecting cells from oxidative stress. The expression of this gene is induced by oxidative stress. Alternatively spliced transcript variants encoding distinct isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

这个基因编码巨噬细胞清除剂受体样蛋白。这种蛋白已经显示出消耗的活性氧，从而在保护细胞免受氧化应激中发挥重要作用。该基因的表达是由氧化应激诱导的。编码不同同种型的可变剪接转录物变体已有描述。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对SCARA3基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCARA3基因的介绍

基因序列

基因序列

SCARA3基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCARA3基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs521426       rs542375       rs549922       rs554687       rs2582372       rs7823813       rs13276615       rs60799361       rs62497992       rs66683138       rs73562236       rs75598676       rs76863263       rs77997953       rs112045356       rs112756349       rs114014628      

基因表达

基因表达

SCARA3基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCGTGGAGGAGATGAAGG
60
CAAAGTGTGACCTCGTAGGA
60
ACCATGAAAGTGAGGTCGG
60
AGATAGGTTCTTCTGGCAGC
60
ATCGTGGAGGAGATGAAGG
59
CAAAGTGTGACCTCGTAGG
58
AGACCATGAAAGTGAGGTCG
60
ATAGGTTCTTCTGGCAGCG
60
ATCGTGGAGGAGATGAAGG
59
CAAAGTGTGACCTCGTAGGA
60
ACCATGAAAGTGAGGTCGG
60
ATAGGTTCTTCTGGCAGCG
60

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCARA3基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCARA3基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0000139
Q6AZY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005044
Q6AZY7 (UniProtKB)
TAS
GO:0005515
Q6AZY7 (UniProtKB)
IPI
GO:0005581
Q6AZY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0005789
Q6AZY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
Q6AZY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0006979
Q6AZY7 (UniProtKB)
TAS
GO:0009650
Q6AZY7 (UniProtKB)
TAS
GO:0016021
Q6AZY7 (UniProtKB)
IEA
GO:0034138
Q6AZY7 (UniProtKB)
IMP

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCARA3基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

MINT

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
IGA Glomerulonephritis 0.12 1 0 CTD_human
Neoplasm Metastasis 0.003267234 2 0 BeFree_LHGDN
Prostatic Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Atherosclerosis 0.002367032 1 0 GAD
Breast Carcinoma 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of breast 0.000542884 2 0 BeFree
Malignant neoplasm of ovary 0.000271442 1 0 BeFree
Mesothelioma 0.000271442 1 0 BeFree
Carcinogenesis 0.000271442 1 0 BeFree
Waldenstrom Macroglobulinemia 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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