SCARF1 (scavenger receptor class F member 1)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCARF1
locus group:
protein-coding gene
location:
17p13.3
gene_family:
alias symbol:
SREC|KIAA0149|SREC1
alias name:
scavenger receptor expressed by en…
entrez id:
8578
ensembl gene id:
ENSG00000074660
ucsc gene id:
uc002fsz.3
refseq accession:
NM_003693
hgnc_id:
HGNC:16820
approved reserved:
2002-09-06

基因染色体位置

基因染色体位置

17p13.3
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCARF1（Scavenger Receptor Class F Member 1，清道夫受体F类成员1）属于清道夫受体（Scavenger Receptor，SR）家族，该家族以识别并结合多种配体（如修饰脂蛋白、病原体相关分子模式PAMPs和凋亡细胞碎片）参与先天免疫反应和脂质代谢而著称。SCARF1是一种I型跨膜蛋白，主要表达于内皮细胞、巨噬细胞和树突状细胞等免疫相关细胞表面，其功能包括介导内吞作用（细胞摄取外部物质的过程）、调控炎症反应及参与凋亡细胞的清除（efferocytosis）。该基因通过结合氧化低密度脂蛋白（oxLDL）和β-淀粉样蛋白（Aβ）等分子，在动脉粥样硬化和阿尔茨海默病等疾病中发挥保护性作用。SCARF1的突变可能导致其配体结合能力下降，从而削弱对oxLDL的清除能力，促进血管内脂质沉积，或加剧神经退行性疾病中Aβ的积累。研究发现，SCARF1缺失小鼠表现出自身免疫倾向和炎症反应增强，而过表达则可能通过增强病原体清除和抑制炎症因子释放来改善免疫稳态。SCARF1与家族其他成员（如SR-A、CD36）的共性在于共享类似配体谱（如结合修饰脂蛋白），但各成员在组织分布和具体功能上存在差异。目前SCARF1的异常表达与系统性红斑狼疮（SLE）和类风湿关节炎等自身免疫疾病相关，其表达降低可能导致免疫耐受缺陷，而过表达可能通过促进凋亡细胞清除减轻自身免疫症状。该基因的调控机制尚在研究中，但其在免疫平衡和代谢疾病中的双重作用使其成为潜在治疗靶点。

The protein encoded by this gene is a scavenger receptor that is expressed in endothelial cells. It regulates the uptake of chemically modified low density lipoproteins, including acetylated low density lipoprotein (Ac-LDL), and it may be involved in atherogenesis. This gene is regulated by the transcription factors ZNF444/EZF-2 and SP1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2013]

由该基因编码的蛋白质是在内皮细胞中表达清道夫受体。它调节化学修饰低密度脂蛋白，包括乙酰化低密度脂蛋白（AC-LDL）的摄取，并且它可能参与动脉粥样硬化。此基因是通过转录调控因子ZNF444 / EZF-2和SP 1。选择性剪接结果在多个抄本变形。 [由RefSeq的，2013年4月提供]

OMIM数据库中对SCARF1基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCARF1基因的介绍

基因序列

基因序列

SCARF1基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCARF1基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs11000       rs2272010       rs2293067       rs7212294       rs11078552       rs34588939       rs62088048       rs73289307       rs75242198       rs78988476       rs79615036       rs112166919       rs112508686       rs112591950       rs113338929       rs138255659       rs138782493      

基因表达

基因表达

SCARF1基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
GATCAAGAATGCACCATCCC
59
CAAAGAATCCAGGCTTGCA
58
GGTGACAGTCTCACATCAC
58
GGATGAGAAGGAGTCATCAG
57
GTATCCAGGCCTGAGATCAG
60
CGAGATGGATCTCTGCTGG
60
AAGGATCAAGAATGCACCA
57
CAAAGAATCCAGGCTTGCA
59
GGTGACAGTCTCACATCAC
58
GGATGAGAAGGAGTCATCAG
57
CCTGTGATACTGTGACAGG
57
TTGTTTCCATGGAAACCGG
59
AGATACTGGCCACTGTCAG
59
GTCACAGTATCACAGGACCC
60
GGTGACAGTCTCACATCAC
58
GGATGAGAAGGAGTCATCAG
57
GGTGACAGTCTCACATCAC
58
GGATGAGAAGGAGTCATCAG
57
GATCAGACCTCAAGGACAGG
59
GATGTGAGACTGTCACCCA
59

转录因子

转录因子

转录因子
影响基因
影响类型
参考文献链接（PubMed）
ZNF444
SCARF1
Activation
11978792

基因本体信息

SCARF1基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCARF1基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005044
A0A0A0MR54 (UniProtKB)
IEA
GO:0006898
A0A0A0MR54 (UniProtKB)
IEA
GO:0016021
A0A0A0MR54 (UniProtKB)
IEA
GO:0004888
Q14162 (UniProtKB)
TAS
GO:0005044
Q14162 (UniProtKB)
IDA
GO:0005886
Q14162 (UniProtKB)
TAS
GO:0006707
Q14162 (UniProtKB)
IC
GO:0006898
Q14162 (UniProtKB)
TAS
GO:0006898
Q14162 (UniProtKB)
TAS
GO:0007155
Q14162 (UniProtKB)
IEA
GO:0007165
Q14162 (UniProtKB)
IEA
GO:0010976
Q14162 (UniProtKB)
ISS
GO:0016021
Q14162 (UniProtKB)
IDA
GO:0016322
Q14162 (UniProtKB)
ISS
GO:0016358
Q14162 (UniProtKB)
IEA
GO:0030169
Q14162 (UniProtKB)
IDA
GO:0030666
Q14162 (UniProtKB)
TAS
GO:0048680
Q14162 (UniProtKB)
ISS

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCARF1基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

Reactome

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

基因相关服务

基因相关服务

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