SCGN (secretagogin, EF-hand calcium binding protein)

基因基本信息

基因基本信息

symbol:
SCGN
locus group:
protein-coding gene
location:
6p22.2
gene_family:
EF-hand domain containing
alias symbol:
SECRET|DJ501N12.8|SEGN|CALBL
alias name:
calbindin-like
entrez id:
10590
ensembl gene id:
ENSG00000079689
ucsc gene id:
uc003nfb.4
refseq accession:
NM_006998
hgnc_id:
HGNC:16941
approved reserved:
2002-05-23

基因染色体位置

基因染色体位置

6p22.2
基因染色体位置图

基因简述

基因简述

SCGN（Secretagogin）是一种钙结合蛋白，属于EF-hand钙结合蛋白家族（EF-hand calcium-binding protein family），该家族成员通常具有钙离子结合结构域（EF-hand domain），参与细胞内钙信号传导。SCGN主要在神经内分泌细胞、胰腺β细胞和部分神经元中表达，其生物学功能包括调节激素分泌（如胰岛素）、维持钙稳态以及参与神经保护。SCGN通过结合钙离子调控胞内钙浓度，进而影响胞吐作用（exocytosis），即细胞释放激素或神经递质的过程。其作用位点包括分泌颗粒膜和突触前膜，通过与突触相关蛋白（如SNAP-25）相互作用促进分泌。SCGN突变可能导致其钙结合能力下降，影响激素分泌功能，与糖尿病、神经退行性疾病（如阿尔茨海默病）和某些内分泌肿瘤相关。SCGN过表达可能增强胰岛素分泌，改善血糖调控，但过度激活也可能导致分泌紊乱；而降低表达则可能引发激素分泌不足或神经功能障碍。SCGN与家族成员（如calbindin、parvalbumin）的共性是依赖EF-hand结构域传递钙信号，但各成员的组织分布和功能特异性不同。目前“secretagogin”的中文译名“分泌钙蛋白”或“促分泌素”尚未完全统一，建议保留英文注释。

The encoded protein is a secreted calcium-binding protein which is found in the cytoplasm. It is related to calbindin D-28K and calretinin. This protein is thought to be involved in KCL-stimulated calcium flux and cell proliferation. [provided by RefSeq, Jul 2008]

的编码的蛋白是在细胞质中分泌的钙结合蛋白。据说这是钙结合蛋白D-28K和钙结合蛋白有关。这种蛋白质被认为是参与KCL刺激钙流和细胞增殖。 [由RefSeq的，2008年7月提供]

OMIM数据库中对SCGN基因的介绍     Wikipedia数据库中对SCGN基因的介绍

基因序列

基因序列

SCGN基因的碱基序列：[NCBI]
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基因突变

基因突变

SCGN基因的碱基突变：           仅显示部分snp
rs10105       rs11794       rs760698       rs1883259       rs2049968       rs2205936       rs2294346       rs3765236       rs3922681       rs4409177       rs4419666       rs4464786       rs4478398       rs4513787       rs4566883       rs4612154       rs4711092      

基因表达

基因表达

SCGN基因在不同组织中的表达：    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图

基因引物

基因引物

正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
ACTGGGTACTGATGACACG
59
TTAGAGGCATCTTGGGTAGTC
59
AGGTGAAACAGCAGTTTATGAC
59
AAGAACATACCAGCAAGCTC
58
CTTTGATGCGGATGGACAC
59
TTTAGAGGCATCTTGGGTAGTC
60
CTTTGATGCGGATGGACAC
59
TTTAGAGGCATCTTGGGTAGTC
60
CTTTGATGCGGATGGACAC
59
TTAGAGGCATCTTGGGTAGTC
59
GAAACAGCAGTTTATGACTACCC
60
GATAAGAACATACCAGCAAGCTC
60
CTTTGATGCGGATGGACAC
59
TTAGAGGCATCTTGGGTAGTC
59
AAACTGGGTACTGATGACAC
58
AGAGGCATCTTGGGTAGTC
59
CTTTGATGCGGATGGACAC
59
TAGAGGCATCTTGGGTAGTC
58
GTTACATAGAAGAGAAGGAACTCG
59
CTTTCATGACCGTGTCATCAG
59

转录因子

转录因子

      尚未收录相关数据

基因本体信息

SCGN基因（以及对应的蛋白质）的细胞分布位置：

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCGN基因的本体（GO）信息：

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005509
O76038 (UniProtKB)
IBA
GO:0005509
O76038 (UniProtKB)
NAS
GO:0005576
O76038 (UniProtKB)
IEA
GO:0005634
O76038 (UniProtKB)
IBA
GO:0005737
O76038 (UniProtKB)
NAS
GO:0005829
O76038 (UniProtKB)
IBA
GO:0008150
O76038 (UniProtKB)
ND
GO:0030658
O76038 (UniProtKB)
IEA
GO:0043005
O76038 (UniProtKB)
IBA
GO:0045202
O76038 (UniProtKB)
IBA
GO:0051480
O76038 (UniProtKB)
IBA

基因相关microRNA

基因相关microRNA

可能调控 SCGN基因的相关microRNA：     

基因相互作用关系

基因相互作用关系

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称

基因通路

基因通路

基因相关疾病

基因相关疾病

疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
Pituitary Neoplasms 0.00272435 1 0 LHGDN
Serum uric acid observed 0.002367032 1 1 GAD
Pituitary Adenoma 0.000542884 2 0 BeFree
Small cell carcinoma of lung 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Carcinoma 0.000271442 1 0 BeFree
Pituitary Diseases 0.000271442 1 0 BeFree
Colorectal Cancer 0.000271442 1 0 BeFree

基因相关服务

基因相关服务

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