SCRG1 (stimulator of chondrogenesis 1)

symbol:
SCRG1
locus group:
protein-coding gene
location:
4q34.1
gene_family:
alias symbol:
SCRG-1
alias name:
scrapie responsive gene 1
entrez id:
11341
ensembl gene id:
ENSG00000164106
ucsc gene id:
uc003ite.4
refseq accession:
NM_007281
hgnc_id:
HGNC:17036
approved reserved:
2009-06-04
4q34.1
基因染色体位置图

SCRG1(Stimulated by retinoic acid and cAMP in glioma 1)是一个在多种组织中表达的基因,最初在神经胶质瘤中被发现受视黄酸(retinoic acid)和环磷酸腺苷(cAMP)调控。其编码的蛋白质SCRG1属于一类分泌型糖蛋白,具有潜在的免疫调节和神经保护功能。SCRG1在神经系统发育和炎症反应中发挥作用,尤其在神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)和神经炎症过程中可能参与调控小胶质细胞(microglia)的活化状态。SCRG1的生物学功能尚未完全明确,但研究表明它可能通过调节细胞间信号传导或免疫应答影响神经元的存活和修复。该基因的突变或表达异常可能与神经系统疾病相关,例如其低表达可能加剧神经炎症反应,而过表达可能通过抑制促炎因子释放发挥保护作用。SCRG1属于一个较小的基因家族,其成员通常具有分泌特性和免疫调节功能,但家族名称尚未统一命名。目前研究提示SCRG1与UBL4A(ubiquitin-like protein 4A)等基因存在功能关联,可能共同参与内质网应激反应。需要注意的是,SCRG1在不同物种中的功能可能存在差异,例如小鼠模型中显示其对朊病毒疾病(prion disease)的病理过程具有调控作用。由于SCRG1具有糖基化修饰位点,其蛋白质产物可能存在多种异构体,这增加了功能研究的复杂性。现有证据表明SCRG1可能通过调节TLR4(Toll样受体4)等免疫相关通路影响疾病进程,但其具体分子机制仍需进一步研究。

Scrapie-responsive gene 1 is associated with neurodegenerative changes observed in transmissible spongiform encephalopathies. It may play a role in host response to prion-associated infections. The scrapie responsive protein 1 may be partly included in the membrane or secreted by the cells due to its hydrophobic N-terminus. [provided by RefSeq, Jul 2008]

痒病应答基因1与在传染性海绵状脑病观察神经变性的变化相关联。它可能在宿主响应于朊病毒相关的感染的作用。痒病反应蛋白1可以部分地包含在膜或通过将细胞,由于其疏水性的N-末端分泌。 [由RefSeq的,2008年7月提供]

SCRG1基因的碱基序列:[NCBI]
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SCRG1基因的碱基突变:           仅显示部分snp
rs880960       rs880961       rs880962       rs1319302       rs1348225       rs1372526       rs1372527       rs1442155       rs1442157       rs1442158       rs1481119       rs1481121       rs1530304       rs1561789       rs1561791       rs1561792       rs1561793      

SCRG1基因在不同组织中的表达:    [UniProt]

基因在不同组织中的表达图
正向引物序列
正向Tm值
反向引物序列
反向Tm值
评分
TTTCTATGGATGAAGGGCCA
59
TGGCTTGAACTCCTAGCAG
59
ACTTCAGCGAATTGCTCTG
59
ACGAAAGAGATCTTTGGTCCA
60
AACTTCAGCGAATTGCTCTG
59
CGAAAGAGATCTTTGGTCCA
58
TTCTATGGATGAAGGGCCA
58
ATGGCTTGAACTCCTAGCA
59
TTTCTATGGATGAAGGGCCA
59
CTCCTAGCAGCAAAGTTAGC
59
ACTTCAGCGAATTGCTCTG
59
ACGAAAGAGATCTTTGGTCC
58
      尚未收录相关数据

SCRG1基因(以及对应的蛋白质)的细胞分布位置:

[UniProt]     [GenomeNet]

" d="M482.414,245.296c3.539,4.293,4.455,10.009,0.202,11 c-4.244,0.996-4.983-10.983-8.293-8.438c-5.271,4.08,9.834,12.271,5.144,17.287c-3.717,3.607-6.172-5.75-10.839-1.976 c-4.673,3.776,6.781,7.299,2.831,11.326c-4.354,4.045-6.979-1.449-9.837-5.517c-1.193-1.742-2.059-3.851-3.595-2.748 c-1.516,1.078-1.854,1.795-0.938,3.666c2.374,4.854,9.235,10.119,5.156,12.535c-5.636,3.346-5.044-8.871-9.426-7.574 c-4.388,1.291,2.557,10.66-1.245,11.141c-4.089,0.545-3.483-10.239-6.979-8.575c-2.522,1.206-0.929,3.071-0.938,4.899 c0.004,1.32-0.964,3.6-2.372,4.062c-3.593,1.171-8.544-1.065-10.251-3.59c-6.04-8.93,0.396-15.997,4.639-7.015 c3.023,4.642,5.182,0.834,2.839-2.219c-1.032-1.354-4.309-5.901-0.781-7.252c2.904-1.113,4.271,1.941,5.985,4.592 c2.61,4.016,5.485,0.117,3.031-3.414c-1.828-2.633-2.74-3.803,3.156-7.42c6.405-4.369,6.52,3.869,10.077,0.646 c2.309-1.832-4.783-5.149,0.06-8.995c2.896-2.293,5.18,6.207,7.961,3.516c3.523-2.737-7.717-7.369,0.117-11.736 C473.413,240.77,480.519,242.891,482.414,245.296z"/> Extracellular space Cytosol Plasma membrane Cytoskeleton Lysosome Endosome Peroxisome ER Golgi Apparatus Nucleus Mitochondrion 0 1 2 3 4 5 Confidence
  • 质膜
  • 细胞质
  • 细胞外
  • 高尔基体
  • 囊泡
  • 细胞骨架
  • 内质网
  • 细胞核
  • 内体
  • 溶酶体
  • 线粒体

SCRG1基因的本体(GO)信息:

GO库代码
对应的蛋白质
来源代码
GO:0005515
O75711 (UniProtKB)
IPI
GO:0005615
O75711 (UniProtKB)
TAS
GO:0005794
O75711 (UniProtKB)
IEA
GO:0007399
O75711 (UniProtKB)
TAS
GO:0044306
O75711 (UniProtKB)
IEA

可能调控 SCRG1基因的相关microRNA:     

BioGrid

IntAct

mentha

String

基因与其他基因之间的相互作用关系图
序号 作用方式 资源库来源/分值 基因名称 基因名称
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源
疾病名称 关系值 NofPmids NofSnps 来源

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